More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2223 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2057  asparaginyl-tRNA synthetase  78.54 
 
 
466 aa  795  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.187857  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2379  asparaginyl-tRNA synthetase  87.34 
 
 
466 aa  864  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  8.51779e-07  normal  0.570909 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2054  asparaginyl-tRNA synthetase  66.74 
 
 
466 aa  682  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.424438  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1926  asparaginyl-tRNA synthetase  74.46 
 
 
466 aa  736  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00335567 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1914  asparaginyl-tRNA synthetase  87.55 
 
 
466 aa  867  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  1.57072e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1980  asparaginyl-tRNA synthetase  80.04 
 
 
466 aa  802  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000244559  normal  0.95853 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  92.92 
 
 
466 aa  913  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000597558  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1785  asparaginyl-tRNA synthetase  78.97 
 
 
466 aa  796  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00203512  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2388  asparaginyl-tRNA synthetase  79.83 
 
 
466 aa  810  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00156361  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4810  asparaginyl-tRNA synthetase  68.03 
 
 
466 aa  677  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00748  asparaginyl-tRNA synthetase  66.52 
 
 
464 aa  660  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.430236  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1329  asparaginyl-tRNA synthetase  77.68 
 
 
466 aa  773  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.155232  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1067  asparaginyl-tRNA synthetase  80.04 
 
 
466 aa  802  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.259071  hitchhiker  0.000331751 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1958  asparaginyl-tRNA synthetase  88.84 
 
 
466 aa  874  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  3.80108e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1091  asparaginyl-tRNA synthetase  79.61 
 
 
466 aa  808  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000126096  normal  0.367452 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1684  asparaginyl-tRNA synthetase  87.34 
 
 
466 aa  872  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  1.15378e-07  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2169  asparaginyl-tRNA synthetase  89.7 
 
 
466 aa  879  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2204  asparaginyl-tRNA synthetase  86.27 
 
 
466 aa  856  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.42874e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2128  asparaginyl-tRNA synthetase  86.7 
 
 
466 aa  861  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  1.32176e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0756  asparaginyl-tRNA synthetase  76.08 
 
 
467 aa  772  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.493556  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2223  asparaginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
466 aa  964  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  6.70625e-07  hitchhiker  0.00213208 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2666  asparaginyl-tRNA synthetase  79.83 
 
 
466 aa  810  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  3.63068e-07  normal  0.0518169 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1879  asparaginyl-tRNA synthetase  69.96 
 
 
465 aa  727  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2135  asparaginyl-tRNA synthetase  66.09 
 
 
466 aa  675  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0430278  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003150  asparaginyl-tRNA synthetase  78.76 
 
 
472 aa  790  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  1.40895e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2306  asparaginyl-tRNA synthetase  86.48 
 
 
466 aa  858  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  1.86406e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2648  asparaginyl-tRNA synthetase  80.04 
 
 
466 aa  802  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  7.25145e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0408  asparaginyl-tRNA synthetase  68.31 
 
 
467 aa  704  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1667  asparaginyl-tRNA synthetase  78.54 
 
 
466 aa  795  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  2.24533e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2208  asparaginyl-tRNA synthetase  66.59 
 
 
467 aa  687  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00941  hypothetical protein  79.83 
 
 
466 aa  810  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  2.72828e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2218  asparaginyl-tRNA synthetase  86.27 
 
 
466 aa  856  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1100  asparaginyl-tRNA synthetase  79.83 
 
 
466 aa  800  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298857  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2591  asparaginyl-tRNA synthetase  75.11 
 
 
466 aa  768  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2190  asparaginyl-tRNA synthetase  79.83 
 
 
466 aa  810  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0049494  normal  0.657641 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2034  asparaginyl-tRNA synthetase  90.56 
 
 
466 aa  889  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.13137e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1940  asparaginyl-tRNA synthetase  87.34 
 
 
466 aa  864  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  1.74697e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1731  asparaginyl-tRNA synthetase  78.54 
 
 
466 aa  790  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00203344  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2362  asparaginyl-tRNA synthetase  97 
 
 
466 aa  937  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  5.63375e-07  hitchhiker  0.00208401 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1117  asparaginyl-tRNA synthetase  80.04 
 
 
466 aa  802  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0105371  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2713  asparaginyl-tRNA synthetase  79.83 
 
 
466 aa  810  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.15906e-14  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00934  asparaginyl-tRNA synthetase  79.83 
 
 
466 aa  810  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  3.19087e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2558  asparaginyl-tRNA synthetase  80.04 
 
 
466 aa  802  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  1.21156e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1030  asparaginyl-tRNA synthetase  79.83 
 
 
466 aa  810  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00035335  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02652  asparaginyl-tRNA synthetase  74.25 
 
 
465 aa  748  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1035  asparaginyl-tRNA synthetase  79.83 
 
 
466 aa  800  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.488484  hitchhiker  0.00196064 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1038  asparaginyl-tRNA synthetase  79.83 
 
 
466 aa  810  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.36907e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2592  asparaginyl-tRNA synthetase  66.74 
 
 
464 aa  657  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.258167 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  78.76 
 
 
466 aa  794  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00663553  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1803  asparaginyl-tRNA synthetase  87.34 
 
 
466 aa  864  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  5.42712e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1008  asparaginyl-tRNA synthetase  79.83 
 
 
466 aa  800  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  3.54576e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1449  asparaginyl-tRNA synthetase  78.76 
 
 
466 aa  791  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0946105  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01897  asparaginyl-tRNA synthetase  77.68 
 
 
472 aa  778  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2236  asparaginyl-tRNA synthetase  66.81 
 
 
467 aa  687  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1947  asparaginyl-tRNA synthetase  87.55 
 
 
466 aa  867  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.28723e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0915  asparaginyl-tRNA synthetase  78.11 
 
 
481 aa  783  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00479655  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2654  asparaginyl-tRNA synthetase  59.66 
 
 
463 aa  589  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0440148 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3170  asparaginyl-tRNA synthetase  61.07 
 
 
463 aa  582  1e-165  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2948  asparaginyl-tRNA synthetase  61.07 
 
 
463 aa  582  1e-165  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2246  asparaginyl-tRNA synthetase  59.47 
 
 
463 aa  577  1e-163  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0830  asparaginyl-tRNA synthetase  60.22 
 
 
462 aa  573  1e-162  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2483  asparaginyl-tRNA synthetase  58.54 
 
 
462 aa  572  1e-162  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0370887  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3921  asparaginyl-tRNA synthetase  59.29 
 
 
467 aa  564  1e-159  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0433315 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0070  asparaginyl-tRNA synthetase  57.36 
 
 
464 aa  561  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4670  asparaginyl-tRNA synthetase  56.96 
 
 
463 aa  556  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.135639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2574  asparaginyl-tRNA synthetase  56.75 
 
 
464 aa  555  1e-157  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  3.72137e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4454  asparaginyl-tRNA synthetase  57.17 
 
 
463 aa  557  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4673  asparaginyl-tRNA synthetase  57.17 
 
 
463 aa  557  1e-157  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.08581e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4685  asparaginyl-tRNA synthetase  57.17 
 
 
463 aa  556  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.765592  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4292  asparaginyl-tRNA synthetase  57.17 
 
 
463 aa  557  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4802  asparaginyl-tRNA synthetase  57.17 
 
 
463 aa  557  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4302  asparaginyl-tRNA synthetase  57.17 
 
 
463 aa  557  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.678889  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4685  asparaginyl-tRNA synthetase  57.17 
 
 
463 aa  556  1e-157  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.78591e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3630  asparaginyl-tRNA synthetase  59.28 
 
 
463 aa  556  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.256869 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4390  asparaginyl-tRNA synthetase  56.96 
 
 
463 aa  554  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0569  asparaginyl-tRNA synthetase  58 
 
 
463 aa  554  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00666077  normal  0.0252712 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3247  asparaginyl-tRNA synthetase  56.1 
 
 
463 aa  550  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51201  predicted protein  57.79 
 
 
503 aa  549  1e-155  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.037074 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2509  asparaginyl-tRNA synthetase  58.35 
 
 
465 aa  548  1e-155  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4851  asparaginyl-tRNA synthetase  55.67 
 
 
463 aa  550  1e-155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2823  asparaginyl-tRNA synthetase  58.35 
 
 
465 aa  548  1e-155  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3649  asparaginyl-tRNA synthetase  58.17 
 
 
463 aa  546  1e-154  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3176  asparaginyl-tRNA synthetase  57.52 
 
 
464 aa  545  1e-154  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.534078 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0001  asparaginyl-tRNA synthetase  58.15 
 
 
461 aa  539  1e-152  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0980  asparaginyl-tRNA synthetase  55.97 
 
 
473 aa  535  1e-151  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  8.64605e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0095  asparaginyl-tRNA synthetase  55.75 
 
 
472 aa  535  1e-150  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113003  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3465  asparaginyl-tRNA synthetase  54.66 
 
 
475 aa  533  1e-150  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3724  asparaginyl-tRNA synthetase  57.27 
 
 
462 aa  533  1e-150  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.28968  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2442  asparaginyl-tRNA synthetase  53.1 
 
 
479 aa  533  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0099  asparaginyl-tRNA synthetase  57.49 
 
 
461 aa  529  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1156  asparaginyl-tRNA synthetase  55.78 
 
 
461 aa  526  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2475  asparaginyl-tRNA synthetase  54.08 
 
 
466 aa  527  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04580  asparaginyl-tRNA synthetase  56.69 
 
 
467 aa  526  1e-148  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  1.41691e-05  unclonable  2.15103e-09 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19266  predicted protein  57.24 
 
 
448 aa  521  1e-147  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.262064  hitchhiker  0.00228321 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0260  asparaginyl-tRNA synthetase  53.65 
 
 
460 aa  522  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0882  asparaginyl-tRNA synthetase  55.33 
 
 
461 aa  521  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0370  asparaginyl-tRNA synthetase  56.39 
 
 
467 aa  520  1e-146  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3378  asparaginyl-tRNA synthetase  54.89 
 
 
461 aa  520  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0101  asparaginyl-tRNA synthetase  52.27 
 
 
462 aa  520  1e-146  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3019  asparaginyl-tRNA synthetase  54.03 
 
 
482 aa  520  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.852561  hitchhiker  0.00877585 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>