More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1607 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
419 aa  851    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.53 
 
 
418 aa  544  1e-154  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.48 
 
 
419 aa  528  1e-149  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.28 
 
 
418 aa  523  1e-147  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.93 
 
 
419 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.89 
 
 
414 aa  496  1e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2903  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.35 
 
 
415 aa  497  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2582  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.87 
 
 
415 aa  495  1e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.66 
 
 
419 aa  479  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0619  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.78 
 
 
415 aa  476  1e-133  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00446157  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0644  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.03 
 
 
415 aa  477  1e-133  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.33 
 
 
418 aa  467  9.999999999999999e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.85 
 
 
418 aa  467  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.73 
 
 
446 aa  463  1e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135756  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1303  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.51 
 
 
415 aa  464  1e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4829  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.94 
 
 
421 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4369  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.42 
 
 
421 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2600  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.51 
 
 
415 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0823147  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.46 
 
 
418 aa  457  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3199  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.41 
 
 
418 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000241705  unclonable  2.3922e-23 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.88 
 
 
418 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0217  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.12 
 
 
416 aa  452  1.0000000000000001e-126  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.37 
 
 
418 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.12 
 
 
418 aa  449  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2730  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.43 
 
 
415 aa  449  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2988  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.43 
 
 
415 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012162 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2789  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.43 
 
 
415 aa  450  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1169  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.96 
 
 
415 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289018  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3027  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.94 
 
 
415 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.297708  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3028  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.94 
 
 
415 aa  443  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00693675  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2502  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.77 
 
 
417 aa  444  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2711  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.94 
 
 
415 aa  444  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0725314  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.27 
 
 
420 aa  444  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2017  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.7 
 
 
413 aa  442  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.969749  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2175  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.27 
 
 
418 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.202609  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2873  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.21 
 
 
413 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2804  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.07 
 
 
420 aa  438  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1880  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.43 
 
 
430 aa  436  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2781  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.94 
 
 
414 aa  436  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268278  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2992  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.94 
 
 
414 aa  436  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.440021  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.72 
 
 
418 aa  433  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1099  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.47 
 
 
424 aa  432  1e-120  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2456  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.53 
 
 
418 aa  434  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.690341  normal  0.130366 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1071  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 
425 aa  432  1e-120  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.96 
 
 
418 aa  433  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1552  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.64 
 
 
418 aa  432  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554956  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3644  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.29 
 
 
416 aa  434  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0817389  normal  0.521871 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0761  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.98 
 
 
445 aa  434  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0336329  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.31 
 
 
418 aa  432  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1288  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.53 
 
 
424 aa  429  1e-119  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2993  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.94 
 
 
415 aa  429  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.471186  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0345  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.81 
 
 
414 aa  431  1e-119  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2884  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.1 
 
 
428 aa  431  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2252  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.97 
 
 
415 aa  428  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.628785  normal  0.156933 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.84 
 
 
418 aa  426  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.51 
 
 
427 aa  425  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  51.94 
 
 
423 aa  427  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.34 
 
 
434 aa  421  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.61 
 
 
421 aa  421  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3345  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.71 
 
 
435 aa  418  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234228  normal  0.0212307 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2254  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.91 
 
 
430 aa  421  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4864  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.31 
 
 
423 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.797783  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4811  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.07 
 
 
423 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.41418 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1312  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.99 
 
 
411 aa  415  9.999999999999999e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695125  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0482  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.33 
 
 
429 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13569  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1541  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  51.33 
 
 
428 aa  415  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0892613  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2672  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.81 
 
 
424 aa  417  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.322038  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11440  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  51.42 
 
 
446 aa  414  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7267  Glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  53.73 
 
 
429 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0694677  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0792  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.64 
 
 
410 aa  414  1e-114  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1227  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.67 
 
 
419 aa  412  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.683793  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1268  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  52.66 
 
 
409 aa  412  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0385  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.21 
 
 
413 aa  414  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.427307  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0540  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.61 
 
 
418 aa  408  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2442  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.66 
 
 
426 aa  409  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4974  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.03 
 
 
423 aa  410  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.126752  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1194  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.4 
 
 
420 aa  409  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3802  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.95 
 
 
421 aa  411  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0610  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.84 
 
 
423 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2671  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.67 
 
 
417 aa  410  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1716  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.73 
 
 
413 aa  409  1e-113  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7264  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.19 
 
 
419 aa  405  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2158  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 
419 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0784  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.52 
 
 
423 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0456  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.9 
 
 
413 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120489 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4686  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.84 
 
 
423 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.820899  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0528  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.28 
 
 
429 aa  406  1.0000000000000001e-112  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08350  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.95 
 
 
421 aa  406  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3197  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.15 
 
 
434 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2852  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.76 
 
 
419 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204057  hitchhiker  0.000000132471 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0363  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.03 
 
 
416 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0357  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.03 
 
 
416 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0364  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.28 
 
 
416 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000332423 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2142  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.29 
 
 
424 aa  402  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1102  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.9 
 
 
421 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0826689  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0372  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.03 
 
 
416 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.559785  normal  0.568115 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0615  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.92 
 
 
418 aa  402  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.663423  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12010  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.67 
 
 
421 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1675  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 
416 aa  403  1e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2079  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.29 
 
 
432 aa  402  1e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>