168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_00970 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_00970  ferritin-like protein  100 
 
 
182 aa  370  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0082  Ferritin Dps family protein  65.43 
 
 
187 aa  211  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3490  Ferritin Dps family protein  56.32 
 
 
176 aa  202  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3193  Ferritin Dps family protein  57.56 
 
 
192 aa  201  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.827708  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0171  Ferritin Dps family protein  49.73 
 
 
183 aa  191  7e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5666  Ferritin, Dps family protein  54.34 
 
 
196 aa  190  8e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324809  normal  0.0103566 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13875  bacterioferritin bfrB  54.86 
 
 
181 aa  189  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321537  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2235  Ferritin Dps family protein  54.72 
 
 
184 aa  185  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000308738  normal  0.753428 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3258  Ferritin, Dps family protein  58.71 
 
 
196 aa  184  8e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000744438  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1141  Ferritin, Dps family protein  52.6 
 
 
187 aa  181  6e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.406209  normal  0.0967189 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5419  Ferritin, Dps family protein  56.77 
 
 
181 aa  180  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.920475  normal  0.703804 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5039  Ferritin and Dps  56.13 
 
 
181 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5127  Ferritin, Dps family protein  56.13 
 
 
181 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1471  Ferritin Dps family protein  50.3 
 
 
174 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1774  Ferritin, Dps family protein  46.47 
 
 
174 aa  157  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5518  Ferritin Dps family protein  49.69 
 
 
177 aa  153  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0917  Ferritin Dps family protein  41.03 
 
 
165 aa  119  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.076232 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2507  Ferritin Dps family protein  34.81 
 
 
174 aa  95.5  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000415587  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6539  Ferritin Dps family protein  36.09 
 
 
176 aa  95.5  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.973659  normal  0.877089 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0690  Ferritin, Dps family protein  32.37 
 
 
172 aa  90.1  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0800  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 
176 aa  86.3  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0797  ferritin-like protein  30.53 
 
 
155 aa  82  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.503852  normal  0.0139535 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0866  ferroxidase  30.6 
 
 
172 aa  81.6  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761126  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0380  hypothetical protein  31.11 
 
 
175 aa  81.6  0.000000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.909079 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0573  Ferritin Dps family protein  29.82 
 
 
171 aa  78.2  0.00000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0043  Ferritin Dps family protein  31.34 
 
 
171 aa  77  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1617  ferroxidase  27.52 
 
 
163 aa  77.4  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0177  Ferritin and Dps  31.11 
 
 
166 aa  76.6  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1580  Ferroxidase  31.88 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1983  Ferritin Dps family protein  30.6 
 
 
172 aa  76.6  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0282013  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2683  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 
168 aa  76.3  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000192038  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2915  Ferritin Dps family protein  32.35 
 
 
172 aa  76.3  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2260  Ferritin Dps family protein  33.61 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739627  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17741  Ferritin  33.33 
 
 
177 aa  75.5  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.970261 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1047  ferritin family protein  31.16 
 
 
170 aa  74.3  0.0000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000219081  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0428  Ferritin, Dps family protein  27.59 
 
 
175 aa  74.3  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1236  ferritin family protein  31.16 
 
 
170 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000720561  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1683  ferroxidase  26.17 
 
 
163 aa  73.6  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0804  ferritin  26 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0301  Ferritin Dps family protein  30.94 
 
 
171 aa  73.6  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.384105 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3287  ferroxidase  32.56 
 
 
167 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1512  Ferritin Dps family protein  31.08 
 
 
175 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0136  ferroxidase  29.5 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1381  ferroxidase  29.37 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000220076  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0668  Ferritin, Dps family protein  30.34 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000253889  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2555  cytoplasmic ferritin (an iron storage protein)  28.67 
 
 
174 aa  72  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000856866  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1855  ferroxidase  33.33 
 
 
167 aa  71.6  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.185397  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0556  Ferroxidase  31.16 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.729145 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1570  Ferritin Dps family protein  30.95 
 
 
170 aa  71.2  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1965  Ferritin, Dps family protein  29.38 
 
 
177 aa  70.9  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3808  Ferroxidase  32.09 
 
 
166 aa  70.9  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.057799  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3978  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 
167 aa  70.5  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.445069  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2124  Ferroxidase  30.2 
 
 
166 aa  69.7  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2947  ferritin-1  29.1 
 
 
175 aa  69.7  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0514  Ferroxidase  30.61 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0298672  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0308  ferritin  28.19 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.25083  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1838  Ferroxidase  29.3 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2122  Ferroxidase  28.85 
 
 
168 aa  68.2  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0921  ferritin like protein 2  29.27 
 
 
165 aa  68.2  0.00000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.454183  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2055  Ferritin, Dps family protein  26.55 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01880  ferritin-like protein  30.08 
 
 
171 aa  68.2  0.00000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1120  Ferritin and Dps  30.58 
 
 
176 aa  67.8  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0407  Ferritin Dps family protein  27.7 
 
 
175 aa  67.8  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.179307  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1417  Ferritin, Dps family protein  31.16 
 
 
477 aa  67.8  0.00000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.672338  normal  0.285216 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16343  ferritin  32.85 
 
 
165 aa  67.8  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.255913  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4070  Ferroxidase  25.37 
 
 
163 aa  67.8  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582999  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2236  Ferroxidase  29.53 
 
 
169 aa  67.4  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.694695  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0449  ferritin, putative  31.16 
 
 
160 aa  67  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000133256  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0617  Ferritin Dps family protein  30.43 
 
 
165 aa  67  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.433385 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0596  Ferritin, Dps family protein  28.79 
 
 
164 aa  67.4  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30880  ferritin-like protein  32.59 
 
 
173 aa  67  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17691  ferritin  28.67 
 
 
192 aa  67.4  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.932316 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0016  Ferritin and Dps  28.91 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1947  Ferritin, Dps family protein  33.58 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0631394  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1981  Ferritin Dps family protein  33.58 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7185  Ferroxidase  29.84 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0715  nonheme iron-containing ferritin  28.46 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1391  Ferritin Dps family protein  26.79 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0155478  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0641  nonheme iron-containing ferritin  28.46 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1058  nonheme iron-containing ferritin  28.46 
 
 
167 aa  65.5  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0328  ferroxidase  26.09 
 
 
170 aa  65.1  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.962185  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0794  Ferritin, Dps family protein  30.08 
 
 
162 aa  64.7  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.413552  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3795  Ferritin Dps family protein  30.3 
 
 
164 aa  64.3  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0479  Ferritin Dps family protein  26.92 
 
 
168 aa  63.9  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.918864  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2341  ferritin family protein  30.71 
 
 
169 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.410916  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1624  ferritin  30.71 
 
 
169 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2438  ferroxidase  30.71 
 
 
169 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2778  Ferritin and Dps  30.6 
 
 
168 aa  63.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0920  ferritin like protein 1  28.93 
 
 
161 aa  63.5  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0864948  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2437  ferritin  27.21 
 
 
181 aa  62.4  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1199  ferroxidase  25.17 
 
 
169 aa  62.8  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0733743  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00534  ferritin  26.12 
 
 
175 aa  61.2  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0183  Ferroxidase  29.5 
 
 
171 aa  60.8  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000415099 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0212  ferritin  26.56 
 
 
183 aa  60.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08441  ferritin  26.56 
 
 
183 aa  60.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.786758  hitchhiker  0.00432039 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1860  Ferritin Dps family protein  28.57 
 
 
164 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00316362  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001945  ferritin-like protein 2  25.74 
 
 
175 aa  60.5  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1942  ferroxidase  28.12 
 
 
172 aa  60.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295968 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5211  ferritin  31.34 
 
 
168 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000025071  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4222  ferroxidase  26.47 
 
 
178 aa  59.3  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>