23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0945 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0945  hypothetical protein  100 
 
 		 423 aa  861    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523813  n/a   
 
 
 
NC_011662  Tmz1t_2084  hypothetical protein  30.38 
 
 		 434 aa  202  8e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0757382  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2331  hypothetical protein  30.14 
 
 		 423 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.122664  hitchhiker  0.0000000213226 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0752  hypothetical protein  32.02 
 
 		 428 aa  184  4.0000000000000006e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000194226 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_50  hypothetical protein  30.22 
 
 		 424 aa  160  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00190835  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1034  hypothetical protein  28.77 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02900  hypothetical protein  26.78 
 
 		 296 aa  122  9e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00646507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0384  hypothetical protein  29.19 
 
 		 293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288726 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1515  hypothetical protein  27.52 
 
 		 293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.107108  hitchhiker  0.0038288 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1036  hypothetical protein  24.19 
 
 		 294 aa  76.3  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4350  hypothetical protein  35.54 
 
 		 510 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.278598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5161  hypothetical protein  25.32 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0502601  normal  0.260377 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1803  hypothetical protein  33.02 
 
 		 454 aa  69.3  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3225  hypothetical protein  40.48 
 
 		 485 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2340  hypothetical protein  22.44 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000406719  unclonable  0.000000155562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1270  hypothetical protein  24.64 
 
 		 300 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6926  DNA polymerase beta domain protein region  23.95 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000143596  hitchhiker  0.000343004 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1832  hypothetical protein  29.18 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.539757  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2822  hypothetical protein  22.17 
 
 		 449 aa  60.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.816333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1829  hypothetical protein  23.4 
 
 		 298 aa  55.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.660383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0222  hypothetical protein  22.45 
 
 		 363 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4359  hypothetical protein  22.03 
 
 		 365 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0687672  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1233  hypothetical protein  23.93 
 
 		 283 aa  48.5  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>