234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2058 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2058  NAD/FAD-binding protein-like protein  100 
 
 		 408 aa  842    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00023874  normal  0.0560685 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1707  amine oxidase  74.94 
 
 		 408 aa  657    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.588233  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4072  amine oxidase  25.17 
 
 		 416 aa  120  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.693433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1622  amine oxidase  26.16 
 
 		 443 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1443  amine oxidase  26.62 
 
 		 443 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.383199 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2774  amine oxidase  25.58 
 
 		 417 aa  117  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.858792  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2468  amine oxidase, flavin-containing  26.12 
 
 		 422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1383  hypothetical protein  27.19 
 
 		 436 aa  112  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.152417  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1869  amine oxidase  26.94 
 
 		 462 aa  112  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773785 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4724  amine oxidase  27.38 
 
 		 421 aa  111  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.519629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0958  amine oxidase, flavin-containing  23.69 
 
 		 415 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2253  amine oxidase  24.31 
 
 		 451 aa  109  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0638  hypothetical protein  22.86 
 
 		 426 aa  106  8e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000186691  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1118  amine oxidase, flavin-containing protein  22.78 
 
 		 415 aa  106  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1239  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 		 424 aa  105  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0355742  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2736  amine oxidase  24.65 
 
 		 415 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1390  amine oxidase  23.63 
 
 		 445 aa  104  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3017  amine oxidase  24.66 
 
 		 415 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1555  amine oxidase  22.95 
 
 		 445 aa  103  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.5068 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0350  amine oxidase  25.98 
 
 		 423 aa  102  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4739  amine oxidase  23.71 
 
 		 415 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3033  amine oxidase  24.01 
 
 		 422 aa  101  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.567673  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0273  amine oxidase  23.35 
 
 		 449 aa  101  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1482  amine oxidase  25.17 
 
 		 417 aa  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4020  FAD dependent oxidoreductase  23.82 
 
 		 430 aa  101  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2098  amine oxidase  24.49 
 
 		 415 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3173  amine oxidase  24.44 
 
 		 415 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0714711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1250  amine oxidase  23.62 
 
 		 428 aa  99  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00507419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003863  amine oxidase flavin-containing  24.59 
 
 		 436 aa  99  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210369  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0129  hypothetical protein  24.18 
 
 		 414 aa  97.8  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0462  FAD dependent oxidoreductase  24.83 
 
 		 441 aa  97.1  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2327  hypothetical protein  24.15 
 
 		 414 aa  96.7  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3370  amine oxidase  23.5 
 
 		 417 aa  95.9  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1449  amine oxidase  23.84 
 
 		 434 aa  95.5  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01816  hypothetical protein  23.26 
 
 		 436 aa  95.1  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1068  amine oxidase  22.88 
 
 		 415 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1091  putative cyclopropane/cyclopropene fatty acid synthesis protein, flavin amine oxidase  24.07 
 
 		 430 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.432347  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2754  amine oxidase  24.07 
 
 		 430 aa  94  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0088  amine oxidase flavin-containing  25.12 
 
 		 435 aa  93.6  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1867  amine oxidase  24.41 
 
 		 425 aa  93.2  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2122  amine oxidase  24.08 
 
 		 465 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160745 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3930  hypothetical protein  24.03 
 
 		 437 aa  92.8  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.562242 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2362  amine oxidase  23.61 
 
 		 454 aa  92  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2971  FAD dependent oxidoreductase  24.15 
 
 		 434 aa  92.4  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2025  amine oxidase  23.76 
 
 		 447 aa  92.8  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2398  FAD dependent oxidoreductase  24.6 
 
 		 434 aa  92  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1485  amine oxidase  23.74 
 
 		 421 aa  92  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.584042  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3571  amine oxidase  24.83 
 
 		 461 aa  91.7  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.689303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0367  amine oxidase  23.82 
 
 		 434 aa  90.5  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1956  amine oxidase  24.02 
 
 		 425 aa  90.5  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.130753 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2098  amine oxidase  24.41 
 
 		 422 aa  90.1  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4842  amine oxidase  23.27 
 
 		 458 aa  90.1  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.265562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1489  amine oxidase  23.09 
 
 		 419 aa  90.1  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2840  amine oxidase  24.94 
 
 		 437 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.167776  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3208  amine oxidase  22.17 
 
 		 416 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.884279 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2437  amine oxidase  23.53 
 
 		 424 aa  88.2  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0814  hypothetical protein  23.23 
 
 		 420 aa  87.8  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2556  FAD dependent oxidoreductase  22.25 
 
 		 437 aa  87.4  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0108905  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2567  amine oxidase  24.6 
 
 		 437 aa  87.4  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.266165 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2937  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 		 430 aa  87  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187359  normal  0.0531334 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0414  FAD dependent oxidoreductase  23.57 
 
 		 443 aa  86.7  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.308842  normal  0.291599 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3065  amine oxidase  21.95 
 
 		 416 aa  86.3  9e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3051  amine oxidase  21.95 
 
 		 416 aa  86.3  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2904  amine oxidase  23.79 
 
 		 437 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1176  amine oxidase  22.38 
 
 		 577 aa  84.7  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1168  amine oxidase  22.15 
 
 		 416 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0728  FAD dependent oxidoreductase  22.1 
 
 		 570 aa  82.4  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0404381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1239  amine oxidase  21.92 
 
 		 416 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1312  amine oxidase  21.72 
 
 		 416 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2711  amine oxidase  20.92 
 
 		 416 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4537  hypothetical protein  22.38 
 
 		 667 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.229647  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1169  amine oxidase  21.89 
 
 		 416 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3583  amine oxidase  22.43 
 
 		 421 aa  80.1  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1177  FAD dependent oxidoreductase  22.81 
 
 		 420 aa  80.1  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.909891  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0723  amine oxidase  20.88 
 
 		 461 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.885481  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1001  amine oxidase  22.6 
 
 		 418 aa  79  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.880623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0911  amine oxidase  24.21 
 
 		 447 aa  78.2  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0236  putative dehydrogenase  22.2 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0739  hypothetical protein  21.05 
 
 		 570 aa  77.4  0.0000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1328  hypothetical protein  21.28 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1890  amine oxidase  21.49 
 
 		 433 aa  76.6  0.0000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2919  amine oxidase  22.73 
 
 		 413 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10455  hypothetical protein  22.14 
 
 		 439 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01779  dehydrogenase  22.04 
 
 		 409 aa  75.1  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0510493  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4269  amine oxidase  22.3 
 
 		 445 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5617  flavin-containing amine oxidase  20.94 
 
 		 432 aa  74.7  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0298  amine oxidase  23.62 
 
 		 429 aa  73.2  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01433  putative dehydrogenase  20.93 
 
 		 421 aa  73.2  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.923495  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3381  hypothetical protein  21.2 
 
 		 416 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0490  amine oxidase:FAD dependent oxidoreductase  23.73 
 
 		 439 aa  71.6  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.599363  normal  0.908175 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1616  amine oxidase  24.07 
 
 		 426 aa  70.5  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1045  FAD dependent oxidoreductase  23.89 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.687688 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6096  FAD dependent oxidoreductase  23.45 
 
 		 430 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0754929  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0462  amine oxidase  22.57 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1053  FAD dependent oxidoreductase  22.27 
 
 		 457 aa  63.5  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.982413  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3433  putative dehydrogenase  23.29 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1802  FAD dependent oxidoreductase  19.95 
 
 		 457 aa  62  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000561447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5886  amine oxidase  24.71 
 
 		 448 aa  61.2  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0102  amine oxidase  22.12 
 
 		 465 aa  60.1  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0245457  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0355  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.04 
 
 		 686 aa  59.3  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.212693 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>