More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0713 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0713  glycosyl transferase  100 
 
 		 343 aa  700    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4251  glycosyl transferase family protein  85.63 
 
 		 339 aa  598  1e-170  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3629  glycosyl transferase family protein  66.47 
 
 		 345 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02791  hypothetical protein  60.44 
 
 		 346 aa  423  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1863  glycosyl transferase, group 2 family protein  57.28 
 
 		 332 aa  386  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0609042  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2662  glycosyl transferase family protein  52.96 
 
 		 341 aa  363  3e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.562323  normal  0.531483 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4457  glycosyl transferase family 2  49.09 
 
 		 335 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0724  glycosyl transferase family protein  50 
 
 		 347 aa  330  2e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4438  glycosyl transferase family 2  51.66 
 
 		 330 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4500  glycosyl transferase family 2  51.66 
 
 		 330 aa  328  8e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1452  glycosyl transferase family 2  51.74 
 
 		 334 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.411296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2174  glycosyl transferase family 2  49.52 
 
 		 350 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1776  glycosyl transferase  52.81 
 
 		 320 aa  325  5e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0288  glycosyl transferase family protein  53.16 
 
 		 335 aa  323  3e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6128  glycosyltransferase  47.53 
 
 		 367 aa  321  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.286179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0135  glycosyl transferases-like  46.47 
 
 		 319 aa  320  1.9999999999999998e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0498044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01670  SfII prophage-derived bactoprenol glucosyl transferase  47.68 
 
 		 348 aa  305  5.0000000000000004e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0722504  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0132  glycosyl transferase family protein  48.17 
 
 		 383 aa  305  5.0000000000000004e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0409142  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0149  glycosyl transferase  48.5 
 
 		 337 aa  305  8.000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.70371  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2876  glycosyl transferase family protein  46.58 
 
 		 334 aa  302  4.0000000000000003e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3057  glycosyl transferase family 2  49 
 
 		 339 aa  300  2e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187191  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5287  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.88 
 
 		 323 aa  295  9e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5112  glycosyltransferase, group 2 family protein  39.88 
 
 		 323 aa  295  9e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5528  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.88 
 
 		 323 aa  295  9e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5684  group 2 family glycosyl transferase  39.88 
 
 		 323 aa  295  9e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5129  glycosyltransferase, group 2 family protein  39.56 
 
 		 323 aa  294  2e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1751  glycosyl transferase family 2  47.16 
 
 		 373 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.357367 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5968  glycosyltransferase  47.16 
 
 		 373 aa  293  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0337928  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0656  glycosyl transferase family protein  45.93 
 
 		 338 aa  293  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.453348 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0539  glycosyl transferase family 2  45.09 
 
 		 357 aa  293  3e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1307  glycosyl transferase family 2  44.7 
 
 		 321 aa  293  3e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.235499  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1685  glycosyl transferase family protein  47.54 
 
 		 360 aa  293  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.543739 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5538  putative glycosyl transferase  47.77 
 
 		 324 aa  292  7e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200424  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3431  glycosyl transferase family protein  46.51 
 
 		 358 aa  292  7e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411933  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3938  ribonuclease III  45.85 
 
 		 358 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.243257 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1173  glycosyl transferase family 2  47.84 
 
 		 319 aa  291  1e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000473476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2635  glycosyl transferase family protein  46.08 
 
 		 340 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2876  glycosyl transferase family 2  45.57 
 
 		 320 aa  288  8e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1379  glycosyl transferase family protein  44.1 
 
 		 340 aa  287  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.603449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2219  glycosyl transferase family 2  44.55 
 
 		 327 aa  286  4e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.660827  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3500  ribonuclease III  43.6 
 
 		 365 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102768 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4342  glycosyl transferase family protein  46.03 
 
 		 365 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4024  glycosyl transferase family protein  46.03 
 
 		 365 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3094  glycosyl transferase family protein  40.13 
 
 		 324 aa  285  5.999999999999999e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000830791  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0394  glycosyl transferase family 2  45.42 
 
 		 311 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0385  glycosyl transferase family 2  45.42 
 
 		 311 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63710  putative glycosyl transferase  46.18 
 
 		 324 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2047  glycosyl transferase family protein  44.76 
 
 		 359 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0225457  normal  0.0522256 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1246  glycosyl transferase family protein  43.67 
 
 		 342 aa  282  7.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000114042  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2872  glycosyl transferase family 2  42.86 
 
 		 336 aa  282  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2398  hypothetical protein  43.85 
 
 		 319 aa  281  1e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3075  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.51 
 
 		 353 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.34037  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1303  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.51 
 
 		 353 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2949  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.51 
 
 		 353 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2346  glycosyl transferase family protein  42.53 
 
 		 327 aa  280  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6381  glycosyl transferase family protein  46.91 
 
 		 347 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.35625  normal  0.721648 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2260  bactoprenol glucosyl transferase  44.9 
 
 		 353 aa  279  4e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5508  glycosyl transferase family protein  46.91 
 
 		 347 aa  279  5e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.465095  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5872  glycosyl transferase family protein  46.91 
 
 		 347 aa  279  5e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146169  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4133  glycosyl transferase family 2  42.38 
 
 		 310 aa  279  5e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000533827 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2543  hypothetical protein  43.19 
 
 		 319 aa  277  2e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2359  glycosyl transferase family protein  40.65 
 
 		 319 aa  276  4e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7210  glycosyl transferase family protein  46.1 
 
 		 348 aa  275  7e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.738535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2681  b-glycosyltransferase, glycosyltransferase family 2 protein  42.38 
 
 		 312 aa  275  7e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0350  glycosyl transferase family protein  41.28 
 
 		 333 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.319839  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0800  glycosyl transferase family protein  43.28 
 
 		 366 aa  273  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.985817 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0600  glycosyl transferase family 2  44.27 
 
 		 337 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.755696 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1943  glycosyl transferase family 2  43.55 
 
 		 322 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  0.190394 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0125  glycosyl transferase family 2  44.74 
 
 		 319 aa  271  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.403715  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1307  Ribonuclease III  44.26 
 
 		 306 aa  269  5e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00145921  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6284  glycosyl transferase family protein  45 
 
 		 347 aa  269  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0178243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5988  ribonuclease III  45 
 
 		 347 aa  269  5e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0608  glycosyl transferase  43.93 
 
 		 306 aa  268  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163631 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5901  glycosyl transferase family 2  45.87 
 
 		 339 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2352  glycosyl transferase family protein  40.49 
 
 		 363 aa  267  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0302049  normal  0.854444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1679  glycosyl transferase family protein  40.43 
 
 		 347 aa  267  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0804  glycosyl transferase family protein  41.72 
 
 		 312 aa  267  2e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3950  glycosyl transferase family protein  42.9 
 
 		 312 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5303  glycosyl transferase family protein  45.54 
 
 		 339 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285782 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4719  glycosyl transferase family protein  40.06 
 
 		 346 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.19129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0603  bactoprenol glucosyl transferase  42.48 
 
 		 308 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.607961  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0668  bactoprenol glucosyl transferase  41.97 
 
 		 308 aa  265  8e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0334  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.31 
 
 		 319 aa  265  8.999999999999999e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5394  bactoprenol glucosyl transferase  41.58 
 
 		 312 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0655  bactoprenol glucosyl transferase  43.19 
 
 		 310 aa  265  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0415  bactoprenol glucosyl transferase  43.19 
 
 		 310 aa  265  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.81511  hitchhiker  0.00033312 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1339  glycosyl transferase family 2  42.21 
 
 		 347 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2576  glycosyl transferase family 2  42.62 
 
 		 356 aa  265  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0724  bactoprenol glucosyl transferase  42.19 
 
 		 306 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.459902 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1923  glycosyl transferase family 2  44.52 
 
 		 383 aa  263  2e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0863  ribonuclease III  43.73 
 
 		 312 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0659  bactoprenol glucosyl transferase  41.64 
 
 		 308 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0373  glycosyl transferase family 2  41.53 
 
 		 332 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.249101 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4447  glycosyl transferase family protein  42.38 
 
 		 364 aa  261  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4310  glycosyl transferase family 2  39.53 
 
 		 320 aa  260  3e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1844  glycosyl transferase family protein  41.4 
 
 		 347 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000858357 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8842  glycosyl transferase family 2  41.25 
 
 		 387 aa  259  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1377  glycosyl transferase family protein  41.74 
 
 		 323 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0520964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2759  glycosyl transferase family protein  41.64 
 
 		 362 aa  259  6e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1650  glycosyl transferase family protein  41.86 
 
 		 331 aa  258  8e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.402224  normal  0.30355 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>