More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8161 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8161  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 114 aa  214  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.32554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7226  small multidrug resistance protein  79.63 
 
 		 109 aa  157  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8162  transporter  66.99 
 
 		 106 aa  125  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.237194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7227  small multidrug resistance protein  72.41 
 
 		 104 aa  122  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0570  small multidrug resistance protein  54.46 
 
 		 101 aa  103  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3013  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 106 aa  101  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3403  small multidrug resistance protein  47.52 
 
 		 105 aa  100  9e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0415  small multidrug resistance protein  48.15 
 
 		 108 aa  96.7  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179992 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 		 153 aa  96.7  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2336  small multidrug resistance protein  50.5 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155364  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  47.62 
 
 		 146 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  47.62 
 
 		 146 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3671  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  44.23 
 
 		 104 aa  95.9  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2887  small multidrug resistance protein  50.5 
 
 		 104 aa  95.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0184367  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4238  small multidrug resistance protein  49.51 
 
 		 106 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.644322  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0100  sugE protein  39.29 
 
 		 114 aa  94  6e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  46.15 
 
 		 104 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0337  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  44.76 
 
 		 105 aa  93.2  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000205037 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  50.98 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3160  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 104 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40170  putative transporter  47.62 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3404  putative transporter  46.15 
 
 		 107 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2526  small multidrug resistance protein  47.06 
 
 		 104 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158974  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04008  SugE  48.04 
 
 		 104 aa  90.1  8e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2305  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 		 106 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0996  small multidrug resistance protein  45.19 
 
 		 106 aa  89.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.762024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1670  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 		 106 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4202  small multidrug resistance protein  45.1 
 
 		 105 aa  89.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2282  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 		 106 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2731  small multidrug resistance protein  43.75 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000850052  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0707  sugE protein  44.23 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.411222  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  45.63 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 		 105 aa  89.4  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2235  small multidrug resistance protein  41.9 
 
 		 106 aa  88.2  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5609  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 		 134 aa  88.6  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.329891  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2945  small multidrug resistance protein  45.1 
 
 		 104 aa  88.2  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46208  normal  0.904124 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00930  cation/cationic drug transporter  45.45 
 
 		 122 aa  87.8  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1403  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 104 aa  87.8  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0526825  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21770  DMT family permease  45.19 
 
 		 104 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.932562  normal  0.189308 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3842  small multidrug resistance protein  42.86 
 
 		 155 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04020  multidrug efflux system protein  42.86 
 
 		 105 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3825  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 		 106 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2659  small multidrug resistance protein  44.12 
 
 		 130 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03982  hypothetical protein  42.86 
 
 		 105 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0853  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 105 aa  87.4  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4392  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  42.86 
 
 		 105 aa  87  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4708  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  42.86 
 
 		 105 aa  87  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5667  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  42.86 
 
 		 105 aa  87  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0511297 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3862  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  42.86 
 
 		 105 aa  87  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4681  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  42.86 
 
 		 105 aa  87  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3948  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 		 106 aa  87  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3713  small multidrug resistance protein  42.16 
 
 		 106 aa  87  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1965  small multidrug resistance protein  47.12 
 
 		 104 aa  87  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2027  small multidrug resistance protein  44.12 
 
 		 105 aa  87  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.067086  normal  0.084051 
 
 
-
 
NC_004310  BR0780  sugE protein  42.31 
 
 		 105 aa  86.7  9e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4620  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  42.86 
 
 		 105 aa  87  9e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0974286 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1502  small multidrug resistance protein  43.69 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0763  small multidrug resistance protein  43.14 
 
 		 110 aa  86.7  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3195  small multidrug resistance protein  45.54 
 
 		 122 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141243 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0685  small multidrug resistance protein  41.35 
 
 		 105 aa  85.5  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1856  putative transporter  44.23 
 
 		 104 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4109  cation membrane transporter  42.37 
 
 		 127 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1759  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1398  small multidrug resistance protein  42.72 
 
 		 106 aa  85.9  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  43.81 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1701  small multidrug resistance protein  42.72 
 
 		 105 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.218727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1256  small multidrug resistance protein  42.72 
 
 		 105 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359766 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1090  sugE protein  41.35 
 
 		 106 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1257  SMR family multidrug efflux pump  41.35 
 
 		 106 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303472  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0373  sugE protein  41.35 
 
 		 106 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1870  sugE protein  41.35 
 
 		 106 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.437905  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1399  suppresses groEL, may be chaperone  41.35 
 
 		 106 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1249  SMR family multidrug efflux pump  41.35 
 
 		 106 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0777  sugE protein  41.35 
 
 		 106 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590294  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4019  small multidrug resistance protein  42.72 
 
 		 105 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0773  sugE protein  41.35 
 
 		 105 aa  84.3  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.757365  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1298  small multidrug resistance protein  41.75 
 
 		 105 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3008  small multidrug resistance protein  39.42 
 
 		 106 aa  84  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2515  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 		 105 aa  84  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.686448  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1141  small multidrug resistance protein  44.76 
 
 		 105 aa  83.6  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.564702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1878  small multidrug resistance protein  41.75 
 
 		 104 aa  83.6  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337942  normal  0.058805 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2198  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 106 aa  83.6  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2320  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 106 aa  83.6  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1397  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118337 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1352  small multidrug resistance protein  40.2 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0613  hypothetical protein  36.63 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0595  hypothetical protein  36.63 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4733  transporter  54.46 
 
 		 101 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2080  small multidrug resistance protein  43.69 
 
 		 104 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235888  normal  0.293882 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1016  small multidrug resistance protein  42.16 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1027  sugE protein  41.35 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2650  small multidrug resistance protein  45.28 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54110  transporter  54.46 
 
 		 101 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1672  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.737958  normal  0.915426 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1392  small multidrug resistance protein  41.35 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1261  small multidrug resistance efflux protein  42.31 
 
 		 104 aa  82  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.943877  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1313  small multidrug resistance protein  41.35 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.177322 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3247  small multidrug efflux pump  42.31 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.848781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0589  small multidrug resistance protein  46.59 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6417  small multidrug resistance protein  39.42 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>