More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_4109 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_4109  cation membrane transporter  100 
 
 		 127 aa  243  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4237  small multidrug resistance protein  92.06 
 
 		 129 aa  218  3e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.492024  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4260  small multidrug resistance protein  92.8 
 
 		 129 aa  213  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00910  cation/cationic drug transporter  62.02 
 
 		 132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8161  small multidrug resistance protein  42.37 
 
 		 114 aa  85.5  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.32554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7226  small multidrug resistance protein  42.11 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3713  small multidrug resistance protein  42.16 
 
 		 106 aa  77  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3464  small multidrug resistance protein  44.34 
 
 		 116 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.667657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8162  transporter  42.45 
 
 		 106 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.237194 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2659  small multidrug resistance protein  41.07 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1574  small multidrug resistance protein  40.59 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4125  small multidrug resistance protein  43.69 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2887  small multidrug resistance protein  42.57 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0184367  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4068  small multidrug resistance protein  37 
 
 		 111 aa  70.5  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0100  sugE protein  35.24 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2478  small multidrug resistance protein  42.72 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0707  sugE protein  36.54 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.411222  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0763  small multidrug resistance protein  36.63 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3403  small multidrug resistance protein  39.6 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  40.78 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8958  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  41.75 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2170  small multidrug resistance protein  38 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2731  small multidrug resistance protein  39.6 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000850052  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3404  putative transporter  40.78 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  39.42 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  39.42 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4732  small multidrug resistance protein  37.74 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00175948 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40170  putative transporter  40.38 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  35.92 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0420  small multidrug resistance protein  39.6 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2430  small multidrug resistance protein  36.89 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1773  DMT superfamily multidrug efflux pump  39.6 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.251074  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0337  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  39.42 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000205037 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2650  small multidrug resistance protein  41.75 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0442  small multidrug resistance protein  43.81 
 
 		 104 aa  67  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.608235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1231  small multidrug resistance protein  36.89 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.7202 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1005  sugE protein  37.25 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2945  small multidrug resistance protein  42.72 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46208  normal  0.904124 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1141  small multidrug resistance protein  37.14 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.564702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1016  small multidrug resistance protein  40.59 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  41.58 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3195  small multidrug resistance protein  40.78 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7227  small multidrug resistance protein  41.46 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1759  small multidrug resistance protein  37.14 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0979  small multidrug resistance protein  37.62 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5837  quaternary ammonium compound-resistance protein sugE  42 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.761993 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4409  small multidrug resistance protein  38 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3242  small multidrug resistance protein  38.68 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.810706  normal  0.088661 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5609  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.329891  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0996  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.762024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4755  small multidrug resistance protein  33.63 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.504307  normal  0.07446 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4255  small multidrug resistance protein  32.67 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.956608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1212  small multidrug resistance protein  43.3 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0428006 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4387  small multidrug resistance protein  38 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4238  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 106 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.644322  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2305  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2608  small multidrug resistance protein  37.86 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2320  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1670  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3424  small multidrug resistance protein  34 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2282  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0283  SugE protein  41.58 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4254  small multidrug resistance protein  36 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1950  small multidrug resistance protein  34.95 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.498297  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2526  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158974  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  37.86 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4620  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  34.62 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0974286 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04020  multidrug efflux system protein  34.62 
 
 		 105 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3842  small multidrug resistance protein  34.62 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03982  hypothetical protein  34.62 
 
 		 105 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3796  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 		 107 aa  60.1  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.38629  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0986  small multidrug resistance protein  33.96 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169673  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2198  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0853  small multidrug resistance protein  33.98 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3671  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  37.86 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4392  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  34.62 
 
 		 105 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5667  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  34.62 
 
 		 105 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0511297 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1398  small multidrug resistance protein  34.65 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0589  small multidrug resistance protein  43.53 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4708  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  34.62 
 
 		 105 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2320  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21770  DMT family permease  33.01 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.932562  normal  0.189308 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3862  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  34.62 
 
 		 105 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0616  small multidrug resistance protein  33.65 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.88639  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4681  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  34.62 
 
 		 105 aa  60.1  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1249  SMR family multidrug efflux pump  40.2 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0780  sugE protein  35.92 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1257  SMR family multidrug efflux pump  40.2 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303472  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0777  sugE protein  40.2 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590294  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1394  small multidrug resistance protein  38.61 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.609191 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1870  sugE protein  40.2 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.437905  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1399  suppresses groEL, may be chaperone  40.2 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1090  sugE protein  40.2 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0373  sugE protein  40.2 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5065  small multidrug resistance protein  36.7 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.929302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3160  small multidrug resistance protein  36.63 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0982  small multidrug resistance protein  33.98 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.900184  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1352  small multidrug resistance protein  37.62 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000273  molecular chaperone SugE  37.25 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>