More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_54110 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_54110  transporter  100 
 
 		 101 aa  190  6e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4733  transporter  97.03 
 
 		 101 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0570  small multidrug resistance protein  80.2 
 
 		 101 aa  159  9e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0982  small multidrug resistance protein  50.5 
 
 		 105 aa  106  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.900184  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0707  sugE protein  50.5 
 
 		 106 aa  103  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.411222  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04008  SugE  49.5 
 
 		 104 aa  100  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1016  small multidrug resistance protein  49.5 
 
 		 104 aa  100  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8161  small multidrug resistance protein  54.46 
 
 		 114 aa  99.8  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.32554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7226  small multidrug resistance protein  54.46 
 
 		 109 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1141  small multidrug resistance protein  49.5 
 
 		 105 aa  99.8  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.564702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3713  small multidrug resistance protein  48.51 
 
 		 106 aa  99.4  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2945  small multidrug resistance protein  45.54 
 
 		 104 aa  98.6  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46208  normal  0.904124 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  48.51 
 
 		 105 aa  98.6  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  49.5 
 
 		 146 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7227  small multidrug resistance protein  55.17 
 
 		 104 aa  98.2  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  49.5 
 
 		 146 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3671  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  46.53 
 
 		 104 aa  97.8  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1313  small multidrug resistance protein  45.54 
 
 		 106 aa  97.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.177322 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2235  small multidrug resistance protein  47.52 
 
 		 106 aa  97.8  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  46.53 
 
 		 153 aa  97.8  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4202  small multidrug resistance protein  47.52 
 
 		 105 aa  97.1  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8162  transporter  49.5 
 
 		 106 aa  96.7  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.237194 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1759  small multidrug resistance protein  48.51 
 
 		 106 aa  96.7  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2608  small multidrug resistance protein  50.5 
 
 		 108 aa  96.7  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2080  small multidrug resistance protein  47.52 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235888  normal  0.293882 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2198  small multidrug resistance protein  47.52 
 
 		 106 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3247  small multidrug efflux pump  46.53 
 
 		 106 aa  96.7  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.848781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2320  small multidrug resistance protein  47.52 
 
 		 106 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2027  small multidrug resistance protein  47.52 
 
 		 105 aa  95.9  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.067086  normal  0.084051 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0337  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  48.51 
 
 		 105 aa  95.9  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000205037 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  49.5 
 
 		 104 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  45.54 
 
 		 105 aa  95.5  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2336  small multidrug resistance protein  47.52 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155364  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3195  small multidrug resistance protein  48 
 
 		 122 aa  94.7  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1298  small multidrug resistance protein  48.51 
 
 		 105 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3160  small multidrug resistance protein  49.5 
 
 		 104 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2305  small multidrug resistance protein  47.52 
 
 		 106 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1670  small multidrug resistance protein  47.52 
 
 		 106 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2282  small multidrug resistance protein  47.52 
 
 		 106 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4019  small multidrug resistance protein  47.52 
 
 		 105 aa  94  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1870  sugE protein  48.51 
 
 		 106 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.437905  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1399  suppresses groEL, may be chaperone  48.51 
 
 		 106 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1090  sugE protein  48.51 
 
 		 106 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5609  small multidrug resistance protein  47.52 
 
 		 134 aa  93.6  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.329891  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0373  sugE protein  48.51 
 
 		 106 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1249  SMR family multidrug efflux pump  48.51 
 
 		 106 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1257  SMR family multidrug efflux pump  48.51 
 
 		 106 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303472  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2526  small multidrug resistance protein  46.53 
 
 		 104 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158974  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0777  sugE protein  48.51 
 
 		 106 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590294  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1701  small multidrug resistance protein  47.52 
 
 		 105 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.218727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1256  small multidrug resistance protein  47.52 
 
 		 105 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359766 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3646  small multidrug resistance protein  44.55 
 
 		 104 aa  92.8  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1965  small multidrug resistance protein  48.51 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0996  small multidrug resistance protein  47.52 
 
 		 106 aa  92.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.762024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1398  small multidrug resistance protein  43.56 
 
 		 106 aa  92  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2731  small multidrug resistance protein  49.5 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000850052  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1878  small multidrug resistance protein  44.55 
 
 		 104 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337942  normal  0.058805 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  47.52 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  48.51 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3403  small multidrug resistance protein  44.55 
 
 		 105 aa  90.9  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3903  small multidrug resistance protein  44 
 
 		 112 aa  90.9  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3013  small multidrug resistance protein  47.52 
 
 		 106 aa  90.1  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3404  putative transporter  46.53 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1950  small multidrug resistance protein  43.56 
 
 		 105 aa  89.4  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.498297  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1502  small multidrug resistance protein  43 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1027  sugE protein  45.54 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40170  putative transporter  47.52 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04020  multidrug efflux system protein  44.55 
 
 		 105 aa  88.6  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6417  small multidrug resistance protein  41.58 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03982  hypothetical protein  44.55 
 
 		 105 aa  88.6  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1856  putative transporter  45.54 
 
 		 104 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4620  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  44.55 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0974286 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3948  small multidrug resistance protein  47.52 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3842  small multidrug resistance protein  44.55 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3862  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  44.55 
 
 		 105 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5667  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  44.55 
 
 		 105 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0511297 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4392  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  44.55 
 
 		 105 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4708  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  44.55 
 
 		 105 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4681  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  44.55 
 
 		 105 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2052  small multidrug resistance protein  42.57 
 
 		 106 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.712643 
 
 
-
 
NC_004310  BR0780  sugE protein  46.53 
 
 		 105 aa  87.4  6e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21770  DMT family permease  44.55 
 
 		 104 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.932562  normal  0.189308 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4409  small multidrug resistance protein  42.57 
 
 		 106 aa  86.7  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2659  small multidrug resistance protein  44.55 
 
 		 130 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1403  small multidrug resistance protein  42.57 
 
 		 104 aa  86.3  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0526825  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1608  small multidrug resistance protein  41.57 
 
 		 104 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4387  small multidrug resistance protein  42.57 
 
 		 106 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4254  small multidrug resistance protein  42.57 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1683  small multidrug resistance protein  41.57 
 
 		 104 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.656055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3825  small multidrug resistance protein  40.59 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0773  sugE protein  45.54 
 
 		 105 aa  84.7  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.757365  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2515  small multidrug resistance protein  46.53 
 
 		 105 aa  84.7  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.686448  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0730  small multidrug resistance protein  41.41 
 
 		 107 aa  84.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2478  small multidrug resistance protein  45 
 
 		 104 aa  84.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1676  small multidrug resistance protein  41.57 
 
 		 104 aa  84.3  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1005  sugE protein  47.52 
 
 		 104 aa  84  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2320  small multidrug resistance protein  41.58 
 
 		 106 aa  84  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0415  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 108 aa  84  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179992 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0420  small multidrug resistance protein  41.41 
 
 		 104 aa  83.6  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1773  DMT superfamily multidrug efflux pump  41.41 
 
 		 104 aa  83.6  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.251074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>