44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8078 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8078  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  645    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2840  methionine synthase vitamin-B12 independent  73.21 
 
 		 335 aa  473  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3565  Methionine synthase vitamin-B12 independent  65.96 
 
 		 337 aa  419  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0908729  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0602  hypothetical protein  57.74 
 
 		 342 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.441061  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0159  Methionine synthase vitamin-B12 independent  55.62 
 
 		 347 aa  348  9e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1312  Methionine synthase vitamin-B12 independent  57.32 
 
 		 335 aa  332  4e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.558991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4087  Methionine synthase vitamin-B12 independent  57.36 
 
 		 345 aa  328  6e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1081  methionine synthase vitamin-B12 independent  56.55 
 
 		 372 aa  325  5e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0693  methionine synthase, vitamin-B12 independent  56.25 
 
 		 344 aa  311  1e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08670  cobalamin-independent methionine synthase  51.45 
 
 		 362 aa  294  1e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3648  methionine synthase, vitamin-B12 independent  45.65 
 
 		 376 aa  286  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.744365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2364  Methionine synthase vitamin-B12 independent  48.48 
 
 		 370 aa  285  5e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.974097  normal  0.700828 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6042  Methionine synthase vitamin-B12 independent  51.8 
 
 		 335 aa  267  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1445  Methionine synthase vitamin-B12 independent  48.17 
 
 		 362 aa  259  4e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.354895 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1108  methionine synthase vitamin-B12 independent  55.72 
 
 		 335 aa  258  7e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.25103  hitchhiker  0.00724126 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3444  methionine synthase, vitamin-B12 independent  47.45 
 
 		 338 aa  246  3e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.76983  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1311  hypothetical protein  48.1 
 
 		 341 aa  241  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.940222  normal  0.271335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1215  methionine synthase, vitamin-B12 independent  54.22 
 
 		 335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1858  methionine synthase, vitamin-B12 independent  43.81 
 
 		 336 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.531176 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1924  methionine synthase, vitamin-B12 independent  44.79 
 
 		 336 aa  225  7e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261497  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1878  methionine synthase, vitamin-B12 independent  44.79 
 
 		 339 aa  225  8e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2719  hypothetical protein  41.92 
 
 		 341 aa  220  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2450  hypothetical protein  43.98 
 
 		 354 aa  217  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000352328 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4252  methionine synthase, vitamin-B12 independent  43.81 
 
 		 336 aa  209  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2908  Methionine synthase vitamin-B12 independent  41.03 
 
 		 335 aa  202  5e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.977615  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2108  methionine synthase, vitamin-B12 independent  41.99 
 
 		 336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.368656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3253  Methionine synthase vitamin-B12 independent  42.41 
 
 		 336 aa  196  5.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13030  hypothetical protein  42.17 
 
 		 337 aa  195  7e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.4281699999999995e-20  normal  0.0693618 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10450  hypothetical protein  40.87 
 
 		 347 aa  186  7e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.639023  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1107  hypothetical protein  42.3 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387618  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2407  hypothetical protein  40.76 
 
 		 349 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.522043  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1364  hypothetical protein  36.78 
 
 		 357 aa  124  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.362207 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1720  hypothetical protein  33.21 
 
 		 352 aa  112  9e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14780  hypothetical protein  44.94 
 
 		 371 aa  108  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.564122  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18940  hypothetical protein  36.9 
 
 		 374 aa  95.9  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.667707  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2940  hypothetical protein  23.76 
 
 		 355 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0730629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0807  hypothetical protein  24.29 
 
 		 344 aa  50.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.182765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1450  hypothetical protein  28.7 
 
 		 361 aa  48.9  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000825715  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3098  hypothetical protein  28 
 
 		 358 aa  47  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944991  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_002936  DET0516  hypothetical protein  21.57 
 
 		 342 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0203  hypothetical protein  24.55 
 
 		 350 aa  44.3  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_457  hypothetical protein, methionine synthase II-like protein  22.03 
 
 		 342 aa  43.9  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0833  hypothetical protein  25.88 
 
 		 355 aa  43.9  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.637029 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0046  hypothetical protein  25.15 
 
 		 356 aa  43.5  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>