76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7390 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7390  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  390  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2961  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 		 213 aa  131  5e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1322  transcriptional regulator, ArsR family  40.22 
 
 		 210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.0955096 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2909  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.71 
 
 		 243 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0487501  normal  0.155618 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08060  ArsR family regulatory protein  38.1 
 
 		 232 aa  121  8e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.365451  normal  0.146174 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1225  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 193 aa  107  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5019  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 227 aa  106  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2852  ArsR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260551  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2755  regulatory protein, ArsR  36.22 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.083885  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1862  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0267319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4753  transcriptional regulator, ArsR family  36.81 
 
 		 206 aa  100  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4088  putative transcriptional regulator protein, ArsR family  37.04 
 
 		 213 aa  99  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18080  predicted transcriptional regulator  39.86 
 
 		 211 aa  96.7  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.493664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2358  transcriptional regulator, ArsR family  37.25 
 
 		 216 aa  96.3  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.13645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7118  transcriptional regulator, ArsR family  35.79 
 
 		 180 aa  95.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2681  transcriptional regulator, ArsR family  34.64 
 
 		 214 aa  92.8  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02100  predicted transcriptional regulator  37.97 
 
 		 192 aa  89  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1338  putative transcriptional regulator  35.2 
 
 		 230 aa  88.2  7e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1822  regulatory protein, ArsR  35.03 
 
 		 198 aa  87.8  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00289732  normal  0.850355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2503  transcriptional regulator, MarR family  36.21 
 
 		 182 aa  87.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1813  ArsR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 198 aa  85.5  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0789444  hitchhiker  0.0000651262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4545  ArsR family transcriptional regulator  57.58 
 
 		 187 aa  85.5  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1441  transcriptional regulator, ArsR family  33 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2040  regulatory protein ArsR  34.04 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2257  transcriptional regulator, ArsR family  53.73 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27290  hypothetical protein  37.42 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109442  normal  0.290934 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0075  regulatory protein ArsR  28.93 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.493033  normal  0.853303 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0521  putative transcriptional regulator  34.83 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36740  ArsR family regulatory protein  34.81 
 
 		 230 aa  74.7  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.929416  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4497  regulatory protein, ArsR  31.21 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2302  regulatory protein, ArsR  33.14 
 
 		 201 aa  71.2  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.71264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0321  transcriptional regulator, ArsR family  33.7 
 
 		 195 aa  67.8  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322661  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4924  transcriptional regulator, ArsR family  33.15 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.864535  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20540  ArsR family regulatory protein  50 
 
 		 187 aa  62  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1212  transcriptional regulator, ArsR family  27.85 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1779  putative transcriptional regulator  39.07 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.304494  normal  0.74945 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3356  ArsR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1047  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0265584 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4321  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120832  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4536  ArsR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 224 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482904  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0618  regulatory protein, ArsR  43.75 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3654  transcriptional regulator, ArsR family  40.98 
 
 		 226 aa  48.9  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.162067 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0746  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2776  ArsR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 110 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2260  transcriptional regulator, ArsR family  29.61 
 
 		 183 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.1059  normal  0.463419 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2808  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 101 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.598578  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4095  putative transcriptional regulator  42.11 
 
 		 196 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.475604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2713  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 102 aa  45.1  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05590  hypothetical protein  37.18 
 
 		 197 aa  45.1  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.604639  normal  0.83451 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2809  hypothetical protein  41.79 
 
 		 249 aa  45.1  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 		 110 aa  45.1  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2627  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 102 aa  44.7  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.8267  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1887  putative transcriptional regulatory protein  21.21 
 
 		 188 aa  44.7  0.0009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.471019  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2853  putative transcriptional regulator  42.67 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.76719  decreased coverage  0.00327558 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1606  transcriptional regulatory protein, putative  21.21 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00436475  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0142  ArsR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 98 aa  43.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0006  regulatory protein, ArsR  37.1 
 
 		 98 aa  43.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  31.58 
 
 		 119 aa  43.1  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0328  putative transcriptional regulator  32.02 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0496107 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0073  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 110 aa  42.7  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.77483 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0307  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 80 aa  42.4  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  25 
 
 		 107 aa  42.4  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  25 
 
 		 107 aa  42.4  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0453  putative transcriptional regulator  45.45 
 
 		 106 aa  42.7  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.701032 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  38 
 
 		 267 aa  42.4  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2235  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 117 aa  42  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167964  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5228  transcriptional regulator, ArsR family  23.08 
 
 		 102 aa  42.4  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.395015 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1488  regulatory protein ArsR  31.48 
 
 		 104 aa  42.4  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.486972  normal  0.347049 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0251  transcriptional regulator, ArsR family  36.27 
 
 		 120 aa  42  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0788  regulatory protein ArsR  37.18 
 
 		 120 aa  42  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  45.1 
 
 		 222 aa  41.6  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1111  putative transcriptional regulator  39.34 
 
 		 223 aa  41.6  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0673626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1814  ArsR family transcriptional regulator  42 
 
 		 79 aa  41.6  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.346706  normal  0.834101 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0870  transcriptional regulator, ArsR family  32 
 
 		 171 aa  41.6  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06338  hypothetical protein  35.44 
 
 		 113 aa  41.2  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1638  putative transcriptional regulator  43.08 
 
 		 219 aa  41.2  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>