More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3731 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1749  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  64.29 
 
 		 534 aa  700    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000244457  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3378  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  59.55 
 
 		 545 aa  651    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.960766  normal  0.505448 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3731  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  100 
 
 		 532 aa  1090    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.95506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2224  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  64.53 
 
 		 541 aa  689    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.691075  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2021  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  65.23 
 
 		 534 aa  701    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.769355  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2325  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  65.47 
 
 		 531 aa  702    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.18048  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0670  sensor histidine kinase DpiB  40.72 
 
 		 552 aa  426  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0246714  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0638  sensor histidine kinase DpiB  40.83 
 
 		 552 aa  426  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.736103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3025  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  40.64 
 
 		 552 aa  426  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00589  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with citB  40.45 
 
 		 552 aa  423  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3006  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  40.64 
 
 		 552 aa  424  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0707  sensor histidine kinase DpiB  40.45 
 
 		 552 aa  423  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0060  sensor kinase DpiB  44.4 
 
 		 552 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0059  sensor kinase DpiB  44.78 
 
 		 552 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0642  sensor histidine kinase DpiB  40.64 
 
 		 552 aa  425  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0459667  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0057  sensor kinase DpiB  44.59 
 
 		 552 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0425242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0058  sensor kinase DpiB  44.4 
 
 		 552 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.736152  normal  0.965676 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0058  sensor kinase DpiB  44.21 
 
 		 552 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390736  normal  0.361929 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0666  sensor kinase DpiB  40.45 
 
 		 553 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.863518  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0784  sensor kinase DpiB  40.45 
 
 		 553 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.636686  normal  0.450792 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0740  sensor kinase DpiB  40.64 
 
 		 553 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0680  sensor kinase DpiB  40.45 
 
 		 553 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.520362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0318  sensor kinase citA  38.58 
 
 		 565 aa  387  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2898  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.98 
 
 		 553 aa  292  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0615  sensor histidine kinase  32.34 
 
 		 534 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0527  sensor histidine kinase  32.34 
 
 		 536 aa  272  9e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0559  sensor histidine kinase  32.34 
 
 		 536 aa  272  9e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0470  sensor histidine kinase  32.15 
 
 		 536 aa  272  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.398861  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0595  sensor protein CitS  31.78 
 
 		 533 aa  271  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0470  sensor histidine kinase  32.15 
 
 		 536 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.974367  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0688  sensor histidine kinase  32.15 
 
 		 534 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02431  sensor kinase CitA  31.1 
 
 		 541 aa  268  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4744  sensor protein CitS  32.02 
 
 		 533 aa  268  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0876  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.71 
 
 		 537 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3096  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.71 
 
 		 537 aa  266  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0620  sensor histidine kinase  32.87 
 
 		 536 aa  265  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0928  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.84 
 
 		 537 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2789  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.54 
 
 		 536 aa  265  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0938  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.84 
 
 		 537 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.101589 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0904  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.84 
 
 		 537 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3432  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.84 
 
 		 537 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2441  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.74 
 
 		 540 aa  263  6e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003319  sensor kinase CitA  32.03 
 
 		 539 aa  262  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0472  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.21 
 
 		 532 aa  260  4e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3991  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.4 
 
 		 553 aa  260  5.0000000000000005e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00164194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1210  putative sensor kinase citA  32.37 
 
 		 538 aa  241  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000551679  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0350  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.16 
 
 		 555 aa  229  8e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0869  sensor histidine kinase  30.3 
 
 		 529 aa  229  9e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0923  sensor histidine kinase  30.3 
 
 		 529 aa  229  9e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1004  sensor histidine kinase  30.11 
 
 		 529 aa  229  9e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.68776e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1089  sensor histidine kinase  30.11 
 
 		 529 aa  229  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1009  sensor histidine kinase  30.38 
 
 		 529 aa  228  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4346  sensor histidine kinase  30.48 
 
 		 529 aa  227  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149156  hitchhiker  0.000000000000186115 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0965  sensor histidine kinase  30.3 
 
 		 529 aa  225  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4645  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.26 
 
 		 529 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0010254  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2790  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.41 
 
 		 547 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000273411  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0837  sensor histidine kinase  29.74 
 
 		 529 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0496  sensory histidine kinase DcuS  28.54 
 
 		 528 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0811  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.56 
 
 		 529 aa  216  9e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4311  sensory histidine kinase DcuS  30.09 
 
 		 533 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412968  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0515  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.01 
 
 		 526 aa  210  6e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0490  sensory histidine kinase DcuS  28.57 
 
 		 534 aa  209  8e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0614  sensory histidine kinase DcuS  27.29 
 
 		 534 aa  207  5e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1959  sensory histidine kinase DcuS  29.17 
 
 		 533 aa  206  7e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516955 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4725  sensory histidine kinase DcuS  27.81 
 
 		 534 aa  205  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1377  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.73 
 
 		 525 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0545  sensory histidine kinase DcuS  27.62 
 
 		 534 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.847766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0576  sensory histidine kinase DcuS  27.62 
 
 		 534 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.391584  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2555  sensory histidine kinase DcuS  28.73 
 
 		 538 aa  204  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.129089 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0639  sensory histidine kinase DcuS  27.62 
 
 		 534 aa  204  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0489  sensory histidine kinase DcuS  27.62 
 
 		 534 aa  203  5e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0632  sensory histidine kinase DcuS  27.24 
 
 		 534 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0487  sensory histidine kinase DcuS  27 
 
 		 534 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2258  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.32 
 
 		 542 aa  201  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0498367  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4679  sensory histidine kinase DcuS  29.62 
 
 		 543 aa  201  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8198  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.34 
 
 		 538 aa  201  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5077  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.14 
 
 		 558 aa  200  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.669392 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3867  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.43 
 
 		 543 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4592  sensory histidine kinase DcuS  29.41 
 
 		 543 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5639  sensory histidine kinase DcuS  29.43 
 
 		 543 aa  199  9e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3902  sensory histidine kinase DcuS  29.43 
 
 		 543 aa  199  9e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4650  sensory histidine kinase DcuS  30.51 
 
 		 543 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.414572  normal  0.461897 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4650  sensory histidine kinase DcuS  30.51 
 
 		 543 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4567  sensory histidine kinase DcuS  30.51 
 
 		 543 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4366  sensory histidine kinase DcuS  29.43 
 
 		 543 aa  197  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.206477  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4559  sensory histidine kinase DcuS  30.32 
 
 		 543 aa  196  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3910  sensory histidine kinase DcuS  27.68 
 
 		 537 aa  195  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37840  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.61 
 
 		 527 aa  191  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.183307 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4699  sensory histidine kinase DcuS  30.13 
 
 		 543 aa  192  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4102  sensory histidine kinase DcuS  27.26 
 
 		 537 aa  190  7e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0700  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.37 
 
 		 543 aa  189  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8065  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.12 
 
 		 583 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25730  PAS domain S-box  28.96 
 
 		 520 aa  187  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0597  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.63 
 
 		 524 aa  183  8.000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00345786 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3705  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.18 
 
 		 527 aa  182  9.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0834  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.33 
 
 		 540 aa  182  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0952704  normal  0.0982471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3869  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.9 
 
 		 540 aa  182  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0780654  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1396  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.46 
 
 		 556 aa  181  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0792453  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3003  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  34.26 
 
 		 503 aa  177  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0343689 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3300  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.52 
 
 		 539 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.814205  hitchhiker  0.00983464 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>