36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3510 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3510  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  208  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134478  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3874  hypothetical protein  57.14 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000339506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0661  hypothetical protein  55.95 
 
 		 109 aa  107  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000789332  hitchhiker  0.000026352 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0623  hypothetical protein  50 
 
 		 115 aa  103  9e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0617  hypothetical protein  50 
 
 		 115 aa  102  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000242002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3413  hypothetical protein  50 
 
 		 115 aa  102  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000138823  normal  0.329766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0616  hypothetical protein  50 
 
 		 115 aa  102  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000414361  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0584  hypothetical protein  51.11 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00300104  normal  0.454317 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3691  hypothetical protein  47.78 
 
 		 115 aa  97.4  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3874  hypothetical protein  47.78 
 
 		 115 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000309341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0577  hypothetical protein  47.78 
 
 		 115 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00197884  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3748  hypothetical protein  47.78 
 
 		 115 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0891426  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0651  hypothetical protein  46.67 
 
 		 115 aa  97.4  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000188562  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3005  hypothetical protein  47.42 
 
 		 114 aa  95.1  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000355724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3293  hypothetical protein  45.24 
 
 		 116 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0196419  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  32.58 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1912  Propeptide PepSY amd peptidase M4  33.33 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0313  membrane protein  36 
 
 		 105 aa  47.4  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0240  peptidase  34.92 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0358  peptidase  33.33 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0241  peptidase  33.33 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000271334 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3780  peptidase  33.33 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0246  Propeptide PepSY amd peptidase M4  33.33 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000325989 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0240  peptidase  33.33 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0243  peptidase  33.33 
 
 		 88 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0242  peptidase  33.33 
 
 		 88 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000136946 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4315  peptidase  32.18 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4486  hypothetical protein  31.75 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1661  peptidase  27.16 
 
 		 104 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1884  peptidase  25.68 
 
 		 104 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4806  hypothetical protein  37.7 
 
 		 201 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.325935  normal  0.738091 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3897  peptidase  31.82 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.33427  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5305  Propeptide PepSY amd peptidase M4  27.03 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6195  Propeptide PepSY amd peptidase M4  26.51 
 
 		 103 aa  41.2  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5574  hypothetical protein  25.4 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185184  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1946  peptidase  35.14 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953564 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>