36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5850 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5850  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  506  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9205  hypothetical protein  40.94 
 
 
254 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2467  hypothetical protein  33.08 
 
 
266 aa  97.1  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2915  protein of unknown function DUF1503  30.74 
 
 
269 aa  94.7  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal  0.0781303 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2998  hypothetical protein  30.73 
 
 
255 aa  85.5  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.725145  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5259  hypothetical protein  29.88 
 
 
255 aa  84  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1408  protein of unknown function DUF1503  24.65 
 
 
278 aa  82.8  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5638  hypothetical protein  27.94 
 
 
249 aa  80.5  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0394  hypothetical protein  38.76 
 
 
253 aa  78.6  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2667  protein of unknown function DUF1503  30.2 
 
 
238 aa  77.4  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19770  hypothetical protein  30.18 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0128439  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4616  protein of unknown function DUF1503  34.48 
 
 
283 aa  76.6  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0327  hypothetical protein  37.21 
 
 
253 aa  76.6  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2951  protein of unknown function DUF1503  31.47 
 
 
249 aa  71.6  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5133  protein of unknown function DUF1503  29.36 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2346  hypothetical protein  30.88 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.837592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0650  protein of unknown function DUF1503  28.29 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.780317 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2255  protein of unknown function DUF1503  33.03 
 
 
266 aa  65.1  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6055  protein of unknown function DUF1503  30.38 
 
 
241 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.585971  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6764  protein of unknown function DUF1503  28.11 
 
 
245 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0119  hypothetical protein  35.22 
 
 
246 aa  62.8  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.288507  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1989  protein of unknown function DUF1503  31.29 
 
 
261 aa  59.3  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.768755 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1875  protein of unknown function DUF1503  27.95 
 
 
260 aa  59.3  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0142051  normal  0.0199341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1392  protein of unknown function DUF1503  28.14 
 
 
272 aa  58.9  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5043  hypothetical protein  33.57 
 
 
246 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3207  protein of unknown function DUF1503  31.11 
 
 
257 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0703058  normal  0.0564696 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6860  protein of unknown function DUF1503  32.13 
 
 
247 aa  55.8  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0601  hypothetical protein  29.77 
 
 
248 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.492856  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4265  hypothetical protein  29.41 
 
 
254 aa  48.5  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508402  normal  0.471663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9026  hypothetical protein  28.57 
 
 
262 aa  48.5  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10337  hypothetical protein  27.06 
 
 
261 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0421  hypothetical protein  28.37 
 
 
249 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2202  protein of unknown function DUF1503  28.17 
 
 
250 aa  47.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.495161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0444  hypothetical protein  27.66 
 
 
249 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00202884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0434  hypothetical protein  27.66 
 
 
249 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2217  protein of unknown function DUF1503  27.7 
 
 
252 aa  43.5  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601241 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>