16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1000 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1000  TM1410 hypothetical-related protein  100 
 
 		 307 aa  613  1e-175  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2649  extracellular endo alpha-1 4 polygalactosaminidase or related polysaccharide hydrolase-like  26.14 
 
 		 374 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  43.96 
 
 		 485 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1420  cysteinyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 		 323 aa  87  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0991  cysteinyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00231888  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3272  cysteinyl-tRNA synthetase  27.33 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2446  TM1410 hypothetical-related protein  32.82 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2053  TM1410 hypothetical-related protein  32.06 
 
 		 368 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.514202  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2241  hypothetical protein  30 
 
 		 299 aa  62.4  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2500  hypothetical protein  34.26 
 
 		 462 aa  62.4  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.967827  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0530  hypothetical protein  31.58 
 
 		 448 aa  61.6  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0672  hypothetical protein  35 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4070  hypothetical protein  24.18 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141328  normal  0.0763536 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1609  hypothetical protein  28.7 
 
 		 273 aa  47.4  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22100  hypothetical protein  28.7 
 
 		 258 aa  47.8  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00255841 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1962  hypothetical protein  32.14 
 
 		 917 aa  43.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000223558  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>