73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2544 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2544  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  686    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3573  cell division protein  76.6 
 
 		 337 aa  508  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3866  cell division protein  75.68 
 
 		 337 aa  504  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546597  normal  0.0832044 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4028  cell division protein  75.48 
 
 		 316 aa  467  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0985  hypothetical protein  63.27 
 
 		 347 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1996  hypothetical protein  62.59 
 
 		 333 aa  374  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1922  hypothetical protein  62.59 
 
 		 333 aa  374  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3090  hypothetical protein  57 
 
 		 329 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0099  FtsX family protein  46.1 
 
 		 324 aa  288  9e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0668  hypothetical protein  43.93 
 
 		 323 aa  242  6e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0577  hypothetical protein  41.53 
 
 		 314 aa  236  4e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3090  hypothetical protein  44.22 
 
 		 326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.613654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2864  hypothetical protein  44.22 
 
 		 326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2984  protein of unknown function DUF214  43.88 
 
 		 323 aa  230  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4866  hypothetical protein  41.67 
 
 		 323 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal  0.378133 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1153  hypothetical protein  43.05 
 
 		 317 aa  229  5e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1177  cell division ABC transporter (membrane component)  41.67 
 
 		 319 aa  227  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.54345 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0021  hypothetical protein  44.44 
 
 		 333 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.873886  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2981  hypothetical protein  38.54 
 
 		 322 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2517  protein of unknown function DUF214  42.91 
 
 		 349 aa  219  5e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5217  protein of unknown function DUF214  41 
 
 		 328 aa  219  7e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339696  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2194  hypothetical protein  40.51 
 
 		 316 aa  216  5e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.265729  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0363  hypothetical protein  40.6 
 
 		 343 aa  210  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.920625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0835  hypothetical protein  41.33 
 
 		 327 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.618544  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0944  hypothetical protein  41 
 
 		 326 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1594  hypothetical protein  36.42 
 
 		 327 aa  166  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473332 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3218  hypothetical protein  34.23 
 
 		 297 aa  124  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368988  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3255  hypothetical protein  34.25 
 
 		 298 aa  122  8e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.97977  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3499  hypothetical protein  30.57 
 
 		 297 aa  86.7  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.770772 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2452  hypothetical protein  27.9 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123322  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3055  protein of unknown function DUF214  32.58 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0477  hypothetical protein  31.51 
 
 		 300 aa  82.4  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0700  hypothetical protein  27.65 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0734  cell division protein FtsX  29.49 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2388  hypothetical protein  29.49 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2016  hypothetical protein  27.63 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3012  hypothetical protein  27.99 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2375  hypothetical protein  31.51 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5109  hypothetical protein  26.33 
 
 		 341 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4982  hypothetical protein  26.33 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5159  hypothetical protein  25.98 
 
 		 341 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3083  hypothetical protein  29.13 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00150828  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0356  hypothetical protein  26.45 
 
 		 341 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4749  hypothetical protein  27.34 
 
 		 344 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0968947  normal  0.0457706 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3866  cell division protein FtsX  21.52 
 
 		 351 aa  50.8  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0429  putative protein insertion permease FtsX  27.66 
 
 		 344 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3761  cell division protein FtsX  22.67 
 
 		 351 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0470  cell division protein FtsX  26.28 
 
 		 335 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277959  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4173  cell division protein FtsX  27.86 
 
 		 338 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0103974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04920  cell division protein FtsX  25.29 
 
 		 335 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.123508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2891  hypothetical protein  24.6 
 
 		 301 aa  46.2  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.650198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3977  cell division protein FtsX  23.96 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.199267  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0579  cell division protein FtsX  23.96 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00250347  normal  0.512774 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0241  cell division protein FtsX  23.96 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.159478  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4063  cell division protein FtsX  27.54 
 
 		 321 aa  45.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0101  cell division protein FtsX  27.35 
 
 		 322 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.270699  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3940  cell division protein FtsX  22.27 
 
 		 351 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3771  cell division protein FtsX  22.27 
 
 		 351 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0095  cell division protein FtsX  28.21 
 
 		 322 aa  45.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3881  cell division protein FtsX  22.27 
 
 		 351 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3838  cell division protein FtsX  22.27 
 
 		 351 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2987  cell division protein FtsX  25.64 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.238508  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4782  cell division protein FtsX  26.5 
 
 		 352 aa  43.5  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3860  cell division protein FtsX  26.5 
 
 		 352 aa  43.5  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3745  cell division protein FtsX  26.5 
 
 		 352 aa  43.5  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0254  cell division protein FtsX  26.5 
 
 		 352 aa  43.5  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3944  cell division protein FtsX  26.5 
 
 		 352 aa  43.5  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3661  cell division protein FtsX  26.5 
 
 		 352 aa  43.5  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03264  hypothetical protein  26.5 
 
 		 352 aa  43.5  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0253  protein insertion ABC transporter, inner membrane subunit FtsX  26.5 
 
 		 352 aa  43.5  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03311  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  26.5 
 
 		 352 aa  43.5  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2303  hypothetical protein  28.04 
 
 		 348 aa  43.1  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.826332  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3875  cell division protein FtsX  26.5 
 
 		 323 aa  42.7  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.939193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>