217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2327 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_2327  peptidase M19 renal dipeptidase  100 
 
 
353 aa  717    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4181  peptidase M19 renal dipeptidase  77.94 
 
 
352 aa  574  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3853  peptidase M19 renal dipeptidase  77.36 
 
 
352 aa  574  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1907  peptidase M19 renal dipeptidase  72.44 
 
 
352 aa  533  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3889  dipeptidase  70.57 
 
 
350 aa  503  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5916  dipeptidase  54.36 
 
 
344 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3742  peptidase M19 renal dipeptidase  51.59 
 
 
346 aa  361  1e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0026  Membrane dipeptidase  54.13 
 
 
354 aa  360  2e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0616  renal dipeptidase family protein  51.73 
 
 
346 aa  355  5e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0654  renal dipeptidase family protein  51.45 
 
 
346 aa  353  2.9999999999999997e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0134  Membrane dipeptidase  51.72 
 
 
355 aa  350  3e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3994  Membrane dipeptidase  52.44 
 
 
360 aa  342  8e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0802  dipeptidase AC  50.7 
 
 
355 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2460  peptidase M19, renal dipeptidase  51.27 
 
 
355 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.133769 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0386  Membrane dipeptidase  51.16 
 
 
342 aa  328  8e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3312  membrane dipeptidase  48.27 
 
 
342 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.649064 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0039  dipeptidase AC  51.69 
 
 
349 aa  323  3e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508075  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0377  membrane dipeptidase  51.14 
 
 
355 aa  323  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116941  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1304  peptidase M19, renal dipeptidase  49.86 
 
 
349 aa  302  6.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.53734  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1592  peptidase M19, renal dipeptidase  49.86 
 
 
349 aa  302  6.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3883  membrane dipeptidase  50 
 
 
342 aa  301  1e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  32.54 
 
 
311 aa  179  9e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  28.21 
 
 
348 aa  159  7e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  33.72 
 
 
315 aa  159  8e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  32.75 
 
 
307 aa  157  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  33.33 
 
 
311 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  31.12 
 
 
313 aa  149  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  31.93 
 
 
320 aa  145  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  34.18 
 
 
312 aa  143  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  28.37 
 
 
328 aa  142  9e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5836  Membrane dipeptidase  29.02 
 
 
444 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2089  Membrane dipeptidase  30.75 
 
 
307 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  31.51 
 
 
320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  30.41 
 
 
333 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1425  renal dipeptidase family protein  29.77 
 
 
307 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0826575  normal  0.836876 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  29.77 
 
 
399 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1194  Membrane dipeptidase  28.82 
 
 
307 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000135749  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3688  membrane dipeptidase  27.15 
 
 
399 aa  134  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.083911  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3822  renal dipeptidase family protein  29.81 
 
 
307 aa  133  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137554  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3810  renal dipeptidase family protein  28.49 
 
 
307 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3624  renal dipeptidase family protein  30 
 
 
307 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0203729  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3911  renal dipeptidase family protein  30 
 
 
307 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.809372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3787  renal dipeptidase family protein  30 
 
 
307 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820793 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3534  renal dipeptidase family protein  30.33 
 
 
307 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00478646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3516  renal dipeptidase family protein  30 
 
 
307 aa  129  6e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  29.69 
 
 
402 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3546  membrane dipeptidase  30.1 
 
 
307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0243201  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  30.12 
 
 
338 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3874  renal dipeptidase family protein  31 
 
 
307 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.452188  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  25.8 
 
 
315 aa  127  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0102  thermostable dipeptidase  34.68 
 
 
337 aa  126  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  31.02 
 
 
381 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2427  membrane dipeptidase  26.25 
 
 
307 aa  125  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.939171  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  27.35 
 
 
317 aa  124  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1127  Membrane dipeptidase  29.27 
 
 
297 aa  122  8e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0633246  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  32.48 
 
 
355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  33.18 
 
 
311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  27.48 
 
 
438 aa  120  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00224  membrane dipeptidase GliJ (AFU_orthologue; AFUA_6G09650)  27.27 
 
 
415 aa  119  9e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152892  normal  0.499822 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2579  membrane dipeptidase  28.57 
 
 
429 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  31.19 
 
 
327 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  35.24 
 
 
350 aa  114  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  27.44 
 
 
444 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  32.97 
 
 
412 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  27.18 
 
 
419 aa  113  6e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  27.63 
 
 
326 aa  110  5e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3959  Membrane dipeptidase  33.09 
 
 
412 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.651593  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6121  Membrane dipeptidase  26.92 
 
 
402 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3815  membrane dipeptidase  32.37 
 
 
418 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3958  peptidase M19 renal dipeptidase  30.6 
 
 
362 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.561135  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0645  peptidase M19, renal dipeptidase  30.77 
 
 
306 aa  106  7e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1296  peptidase M19 renal dipeptidase  37.36 
 
 
344 aa  105  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.488471  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0032  peptidase M19, renal dipeptidase  28.24 
 
 
307 aa  104  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4630  peptidase M19 renal dipeptidase  35.09 
 
 
350 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  26.44 
 
 
433 aa  103  3e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1093  peptidase M19, renal dipeptidase  31.71 
 
 
307 aa  102  7e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.620091 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1477  Membrane dipeptidase  30.07 
 
 
315 aa  102  9e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.203918  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3505  peptidase M19, renal dipeptidase  37.21 
 
 
327 aa  102  9e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3437  membrane dipeptidase  26.32 
 
 
323 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0672  peptidase M19, renal dipeptidase  28.02 
 
 
356 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1847  peptidase M19, renal dipeptidase  26.98 
 
 
357 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3875  membrane dipeptidase  26.05 
 
 
449 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0805  membrane dipeptidase  27.16 
 
 
420 aa  100  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25440  Peptidase M19, renal dipeptidase.PvdM-like protein  27.86 
 
 
423 aa  99.4  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1888  peptidase M19 renal dipeptidase  28.42 
 
 
362 aa  99.4  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3302  membrane dipeptidase  25.19 
 
 
323 aa  99.4  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1837  Membrane dipeptidase  27.11 
 
 
363 aa  98.6  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.36005  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1966  peptidase M19, renal dipeptidase  25.63 
 
 
464 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0692763  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  27.62 
 
 
433 aa  99  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000416179  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0941  peptidase M19, renal dipeptidase  26.27 
 
 
412 aa  98.6  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118584  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1052  peptidase M19, renal dipeptidase  29.34 
 
 
310 aa  99  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.580265  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4213  dipeptidase, putative  26.35 
 
 
462 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2156  renal dipeptidase family protein  25.63 
 
 
447 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0303403  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2359  peptidase M19, renal dipeptidase  27.82 
 
 
393 aa  98.2  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.160596 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2622  peptidase M19 renal dipeptidase  31.37 
 
 
310 aa  97.4  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17280  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  31.87 
 
 
400 aa  97.4  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.922551  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1025  peptidase M19 renal dipeptidase  27.16 
 
 
356 aa  96.7  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.134164  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3785  peptidase M19 renal dipeptidase  26.35 
 
 
448 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2866  putative dipeptidase precursor  27.44 
 
 
448 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  25.28 
 
 
323 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>