43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_4005 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_4005  hypothetical protein  100 
 
 		 489 aa  953    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0110668 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03537  hypothetical protein  80.37 
 
 		 490 aa  770    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.206866  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3164  hypothetical protein  49.58 
 
 		 487 aa  432  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0870  hypothetical protein  40.24 
 
 		 490 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26590  hypothetical protein  35.45 
 
 		 515 aa  270  4e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22890  Methyl-accepting chemotaxis protein  37.28 
 
 		 487 aa  243  3.9999999999999997e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0065  hypothetical protein  30.98 
 
 		 492 aa  202  9.999999999999999e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.950662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2296  hypothetical protein  32.64 
 
 		 478 aa  196  7e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.357562  normal  0.109764 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1811  hypothetical protein  30.28 
 
 		 481 aa  194  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0838  hypothetical protein  30.26 
 
 		 480 aa  191  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2278  hypothetical protein  32.25 
 
 		 494 aa  192  2e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1446  hypothetical protein  30.15 
 
 		 482 aa  188  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2185  hypothetical protein  32.11 
 
 		 510 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0737  hypothetical protein  28.66 
 
 		 482 aa  182  9.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.509556  normal  0.0133056 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03600  hypothetical protein  31.12 
 
 		 510 aa  182  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0901  hypothetical protein  29.45 
 
 		 483 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0797032  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0780  hypothetical protein  29.09 
 
 		 481 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0518  hypothetical protein  28.87 
 
 		 482 aa  180  5.999999999999999e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.566512  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0048  hypothetical protein  31.95 
 
 		 484 aa  177  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0017  hypothetical protein  30.35 
 
 		 484 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0222  hypothetical protein  30.23 
 
 		 488 aa  171  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00993068 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1630  hypothetical protein  30.91 
 
 		 486 aa  166  6.9999999999999995e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0742  hypothetical protein  33.43 
 
 		 412 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1131  hypothetical protein  32.13 
 
 		 489 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03250  hypothetical protein  31.5 
 
 		 538 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127047  unclonable  2.10051e-21 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3740  hypothetical protein  27.47 
 
 		 485 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3942  hypothetical protein  27.47 
 
 		 482 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3698  hypothetical protein  28.99 
 
 		 499 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268851  decreased coverage  0.000278839 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49830  hypothetical protein  33.08 
 
 		 450 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1123  hypothetical protein  25.19 
 
 		 488 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.963285 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2029  hypothetical protein  30.06 
 
 		 490 aa  94.7  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17220  hypothetical protein  27.51 
 
 		 477 aa  89  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.96015  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2066  hypothetical protein  25.38 
 
 		 502 aa  83.2  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0285936  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5157  hypothetical protein  25.4 
 
 		 496 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265097  normal  0.0750185 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2222  hypothetical protein  27.71 
 
 		 499 aa  79.7  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0627  hypothetical protein  30.99 
 
 		 176 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2511  hypothetical protein  25 
 
 		 511 aa  74.7  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.398866  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1174  hypothetical protein  25.46 
 
 		 485 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.180277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1567  hypothetical protein  23.03 
 
 		 522 aa  69.7  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0865  hypothetical protein  26.13 
 
 		 480 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0871  hypothetical protein  26.13 
 
 		 480 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.566977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0882  hypothetical protein  26.13 
 
 		 480 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0271  hypothetical protein  25.37 
 
 		 507 aa  63.9  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  decreased coverage  0.00169568 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>