More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5708 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  100 
 
 
301 aa  614  1e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2674  chaperone DnaJ domain protein  63.64 
 
 
309 aa  369  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5061  chaperone DnaJ domain protein  68.21 
 
 
303 aa  355  5.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00177728  hitchhiker  0.00778785 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0544  chaperone DnaJ domain protein  64.21 
 
 
291 aa  352  4e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1676  chaperone DnaJ domain protein  56.67 
 
 
299 aa  338  9e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.338376  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2374  chaperone DnaJ domain-containing protein  62.17 
 
 
306 aa  333  2e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.641958  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3803  heat shock protein DnaJ  53.69 
 
 
293 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.185873 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0029  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.3 
 
 
334 aa  238  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000766624  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.07 
 
 
315 aa  233  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  38.56 
 
 
311 aa  230  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.54 
 
 
324 aa  228  7e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.1 
 
 
289 aa  226  3e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  40.13 
 
 
287 aa  221  9e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1218  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.64 
 
 
330 aa  221  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0453172  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2078  chaperone DnaJ-like protein  39.81 
 
 
302 aa  216  4e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  36.83 
 
 
307 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2836  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.37 
 
 
287 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  37.88 
 
 
324 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2296  chaperone DnaJ domain protein  40 
 
 
331 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0426  chaperone DnaJ domain protein  40.51 
 
 
294 aa  211  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.011162 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  39.69 
 
 
315 aa  211  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  38.92 
 
 
313 aa  209  3e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  38.92 
 
 
341 aa  209  3e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1192  molecular chaperone, DnaJ family  40.85 
 
 
330 aa  208  7e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.159001  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01003  curved DNA-binding protein, DnaJ-like protein that functions as a co-chaperone of DnaK  37.7 
 
 
306 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  37.7 
 
 
306 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  37.7 
 
 
306 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  36.87 
 
 
330 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  37.7 
 
 
306 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01010  hypothetical protein  37.7 
 
 
306 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  37.7 
 
 
306 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  37.7 
 
 
306 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2124  curved DNA-binding protein CbpA  37.38 
 
 
306 aa  200  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.584386  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1288  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.11 
 
 
316 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479526  normal  0.450004 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2314  curved DNA-binding protein CbpA  37.38 
 
 
306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0453  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.19 
 
 
319 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1411  DnaJ family protein  41.16 
 
 
330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2665  chaperone DnaJ domain protein  39.45 
 
 
318 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0771  DnaJ-like curved DNA-binding protein  37.79 
 
 
296 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.63005e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2474  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.52 
 
 
320 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2569  chaperone DnaJ domain protein  39.1 
 
 
318 aa  192  5e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1308  DnaJ-like molecular chaperone  37.18 
 
 
309 aa  192  6e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.571116  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2406  dnaJ domain-containing protein  39.31 
 
 
313 aa  191  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0213  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.79 
 
 
291 aa  191  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6429  chaperone DnaJ domain protein  37.97 
 
 
324 aa  190  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.480227 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1291  chaperone DnaJ-like  39.1 
 
 
318 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0635621  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1346  DnaJ-like molecular chaperone  39.8 
 
 
299 aa  189  7e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  34.7 
 
 
315 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0519  chaperone DnaJ domain protein  39.09 
 
 
298 aa  187  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  34.73 
 
 
313 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0143  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.83 
 
 
297 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000524271  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  35.47 
 
 
335 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0200  chaperone DnaJ domain protein  38.08 
 
 
297 aa  186  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000536584 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1255  chaperone protein DnaJ  41.25 
 
 
297 aa  186  5e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.559961  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2065  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  34.38 
 
 
315 aa  185  7e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4618  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.4 
 
 
325 aa  185  8e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0261  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.62 
 
 
324 aa  185  9e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0719528  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1071  curved DNA-binding protein CbpA  35.14 
 
 
306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1187  curved DNA-binding protein CbpA  35.14 
 
 
306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.227747  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1176  curved DNA-binding protein CbpA  35.14 
 
 
306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.668416  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1207  curved DNA-binding protein CbpA  35.14 
 
 
306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.358657 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1222  curved DNA-binding protein CbpA  35.14 
 
 
306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.898218 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0217  chaperone DnaJ domain protein  38.74 
 
 
297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000962373  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3444  chaperone DnaJ domain protein  34.97 
 
 
339 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903918 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2511  heat shock protein DnaJ domain protein  36.54 
 
 
316 aa  183  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0350748  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.16 
 
 
317 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  35.06 
 
 
326 aa  182  5.0000000000000004e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5146  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.01 
 
 
392 aa  181  9.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6322  heat shock protein DnaJ domain protein  33.01 
 
 
313 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0185  chaperone DnaJ domain protein  37.38 
 
 
314 aa  179  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.522529  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2621  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.09 
 
 
283 aa  179  4e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.591487 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2984  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.15 
 
 
331 aa  177  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0109  heat shock protein DnaJ domain protein  35.83 
 
 
297 aa  177  1e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.200595  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2171  heat shock protein DnaJ-like  33.03 
 
 
335 aa  177  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0618  heat shock protein DnaJ domain protein  35.76 
 
 
331 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1602  chaperone DnaJ domain protein  36.58 
 
 
297 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000490827 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7804  putative heat shock protein- DnaJ-like protein  38.11 
 
 
336 aa  176  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108723  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1000  heat shock protein DnaJ domain protein  34.43 
 
 
314 aa  177  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3236  heat shock protein DnaJ domain protein  35.53 
 
 
320 aa  175  7e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0639  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.45 
 
 
331 aa  175  7e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0014  phage prohead protease  40 
 
 
294 aa  175  9e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.483613  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0569  chaperone DnaJ domain protein  37.38 
 
 
318 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0390561 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1431  heat shock protein DnaJ family  39.93 
 
 
318 aa  174  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1172  chaperone protein DnaJ  31.17 
 
 
382 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.696744  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4186  chaperone DnaJ domain protein  33.84 
 
 
333 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2834  chaperone protein DnaJ  31.17 
 
 
382 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0553  chaperone protein DnaJ  31.96 
 
 
372 aa  173  2.9999999999999996e-42  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4731  chaperone DnaJ domain-containing protein  33.64 
 
 
334 aa  173  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.110722  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1520  heat shock protein DnaJ-like  33.84 
 
 
327 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3550  heat shock protein DnaJ-like  39.13 
 
 
298 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00109126  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2765  chaperone protein DnaJ  30.08 
 
 
382 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4435  chaperone DnaJ domain protein  38.11 
 
 
311 aa  171  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360002  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4024  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.41 
 
 
316 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115039  normal  0.0763204 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4440  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  37.9 
 
 
314 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0791  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.01 
 
 
323 aa  171  2e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000179186  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3756  chaperone DnaJ domain protein  35.69 
 
 
303 aa  171  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.144463  normal  0.652228 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0680  chaperone protein DnaJ  34.19 
 
 
374 aa  170  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1856  chaperone DnaJ domain protein  36.14 
 
 
328 aa  170  3e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000127856  normal  0.0651455 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1514  chaperone DnaJ  31.61 
 
 
375 aa  170  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3023  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.25 
 
 
319 aa  170  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>