More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_30510 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_30510  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  100 
 
 
326 aa  642  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163783  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  38.69 
 
 
319 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  36.84 
 
 
662 aa  169  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3525  periplasmic binding protein  36.65 
 
 
310 aa  164  2e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1784  hypothetical protein  35.35 
 
 
309 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.933909 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  35.19 
 
 
300 aa  152  9e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  30.12 
 
 
316 aa  150  4e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4123  periplasmic binding protein  29.71 
 
 
346 aa  147  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  29.7 
 
 
324 aa  145  9e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.25239e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  28.7 
 
 
324 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3654  periplasmic binding protein  39.43 
 
 
329 aa  143  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.841476  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.48 
 
 
322 aa  134  2e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7046e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  29.49 
 
 
322 aa  134  2e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.48 
 
 
322 aa  134  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  30.11 
 
 
321 aa  133  4e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  2.82355e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  30.11 
 
 
321 aa  133  4e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  6.73134e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  29.75 
 
 
321 aa  132  7e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  2.68482e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  29.75 
 
 
321 aa  131  2e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.33829e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.75 
 
 
321 aa  131  2e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.64 
 
 
321 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7985  substrate-binding family protein, putative  33.44 
 
 
336 aa  128  1e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  29.06 
 
 
320 aa  127  2e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  2.70129e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  29.06 
 
 
320 aa  127  2e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  29.06 
 
 
320 aa  127  2e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17371e-45 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.93 
 
 
321 aa  126  4e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  8.97265e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2038  iron(III) dicitrate-binding protein  29.06 
 
 
320 aa  126  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.24878e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2365  putative iron compound-binding protein  29.06 
 
 
320 aa  126  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00267184  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2440  periplasmic binding protein  28.74 
 
 
348 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  1.2115e-07 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2036  iron(III) dicitrate-binding protein  29.63 
 
 
320 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  1.0516e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2237  putative iron compound-binding protein  29.34 
 
 
305 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  28.75 
 
 
320 aa  123  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2078  periplasmic binding protein  28.75 
 
 
320 aa  122  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0923581  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3865  periplasmic binding protein  30.29 
 
 
329 aa  122  1e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2283  substrate-binding family protein, putative  28.12 
 
 
321 aa  118  1e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918063  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0463  periplasmic binding protein  32.18 
 
 
308 aa  118  1e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5759  periplasmic binding protein  27.3 
 
 
331 aa  113  4e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0133  periplasmic binding protein  32.74 
 
 
306 aa  113  4e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4510  periplasmic binding protein  29.48 
 
 
317 aa  109  8e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2122  periplasmic binding protein  32.29 
 
 
298 aa  108  9e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10692  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13060  Fe(III)-dicitrate-binding periplasmic lipoprotein fecB  30.74 
 
 
359 aa  106  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0425065 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1043  periplasmic binding protein  33.7 
 
 
340 aa  106  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1898  periplasmic binding protein  31.88 
 
 
353 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2940  periplasmic binding protein  30.14 
 
 
316 aa  106  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1851  periplasmic binding protein  31.88 
 
 
353 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1832  periplasmic binding protein  31.88 
 
 
353 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.136123  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1777  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  32.62 
 
 
331 aa  103  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1523  periplasmic binding protein  30.74 
 
 
313 aa  102  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2699  periplasmic binding protein  31.27 
 
 
305 aa  102  9e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.885635  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3296  periplasmic binding protein  30.31 
 
 
319 aa  101  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06007  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  28.26 
 
 
298 aa  100  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001069  iron(III) dicitrate transport system iron-binding protein fecB  31.63 
 
 
307 aa  100  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  30.43 
 
 
330 aa  98.6  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  1.4163e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  30.43 
 
 
330 aa  98.6  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  1.00605e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0362  periplasmic binding protein  26.48 
 
 
315 aa  97.8  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4143  iron chelate ABC transporter periplasmic iron-binding protein  30.94 
 
 
317 aa  97.1  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0242829  normal  0.0341564 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0071  periplasmic binding protein  30.94 
 
 
317 aa  97.1  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4091  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  30.94 
 
 
317 aa  97.1  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0693  periplasmic binding protein  33.16 
 
 
306 aa  96.3  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1282  periplasmic binding protein  29.38 
 
 
357 aa  96.3  6e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2035  periplasmic binding protein  28.28 
 
 
316 aa  96.3  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2081  periplasmic binding protein  31.73 
 
 
380 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.754693 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0300  periplasmic binding protein  33.64 
 
 
301 aa  95.5  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1763  periplasmic binding protein  28.45 
 
 
316 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361737  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0667  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  28.68 
 
 
306 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0763  iron(III) dicitrate transport system, periplasmic iron-binding protein FecB  28.68 
 
 
306 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0640  periplasmic binding protein  29.9 
 
 
337 aa  92.8  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.451068  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5028  periplasmic binding protein  31.31 
 
 
316 aa  92.4  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.690796  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0734  periplasmic binding protein  27.54 
 
 
348 aa  92.4  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0974  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  31.44 
 
 
304 aa  92  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37813  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4780  periplasmic binding protein  33.51 
 
 
305 aa  91.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2413  periplasmic binding protein  26.88 
 
 
351 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2670  periplasmic binding protein  36.05 
 
 
272 aa  89  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2409  periplasmic binding protein  27.36 
 
 
333 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0140485  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2590  periplasmic binding protein  32.09 
 
 
301 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37556  normal  0.0169021 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4278  periplasmic binding protein  30.42 
 
 
405 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.170406  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3470  periplasmic binding protein  32.35 
 
 
356 aa  85.9  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00150315  hitchhiker  0.00510017 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1806  periplasmic binding protein  28.77 
 
 
358 aa  85.5  1e-15  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.455628  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2757  periplasmic binding protein  31.58 
 
 
309 aa  85.9  1e-15  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3710  periplasmic binding protein  31.44 
 
 
300 aa  84.7  2e-15  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.508283  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2208  periplasmic binding protein  27.63 
 
 
327 aa  84.3  2e-15  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.970371  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0385  periplasmic binding protein  27.75 
 
 
365 aa  84.7  2e-15  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2246  periplasmic binding protein  27.63 
 
 
327 aa  84.3  2e-15  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.13483  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2416  periplasmic binding protein  30 
 
 
311 aa  84  4e-15  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2754  periplasmic binding protein  27.43 
 
 
312 aa  83.6  4e-15  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2437  periplasmic binding protein  31.64 
 
 
351 aa  83.2  6e-15  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.0637289 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0742  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  31.44 
 
 
300 aa  82.8  7e-15  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04119  hypothetical protein  31.44 
 
 
300 aa  82.8  8e-15  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04156  iron-dicitrate transporter subunit  31.44 
 
 
300 aa  82.8  8e-15  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5065  periplasmic binding protein  31.85 
 
 
336 aa  82.4  1e-14  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34400  ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component  33.18 
 
 
302 aa  82.4  1e-14  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4867  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  30.16 
 
 
302 aa  82.4  1e-14  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0550  periplasmic binding protein  27.66 
 
 
313 aa  81.6  2e-14  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1001  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, periplasmic vibriobactin/enterobactin-binding protein  29.37 
 
 
333 aa  81.6  2e-14  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.70207e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3694  periplasmic binding protein  32.31 
 
 
341 aa  81.3  2e-14  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.792098  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1928  periplasmic binding protein  26.33 
 
 
307 aa  80.9  3e-14  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.967613  normal  0.0105947 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4041  periplasmic binding protein  37.16 
 
 
341 aa  80.5  4e-14  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0794  periplasmic binding protein  28.16 
 
 
314 aa  80.1  5e-14  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.352793  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0807  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.16 
 
 
314 aa  79.7  6e-14  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.426992  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0632  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  31.16 
 
 
309 aa  79.7  6e-14  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06135  ABC-type enterochelin transport system periplasmic protein  29.73 
 
 
302 aa  79.3  9e-14  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>