203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_09890 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_09890  homoserine kinase  100 
 
 
315 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1057  homoserine kinase  64.44 
 
 
317 aa  357  9.999999999999999e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175086  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1788  homoserine kinase  58.75 
 
 
317 aa  355  6.999999999999999e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.542876  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2463  homoserine kinase  62.22 
 
 
310 aa  315  5e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19320  homoserine kinase  54.97 
 
 
304 aa  292  4e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1283  homoserine kinase  57.69 
 
 
311 aa  271  9e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.335201 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0885  homoserine kinase  51.92 
 
 
310 aa  268  8e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4151  homoserine kinase  51.76 
 
 
321 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.317014  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1201  homoserine kinase  50.49 
 
 
336 aa  253  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326603  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2422  homoserine kinase  54.68 
 
 
316 aa  247  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1650  Homoserine kinase  49 
 
 
336 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4029  homoserine kinase  51.94 
 
 
314 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116733 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1232  homoserine kinase  54.42 
 
 
330 aa  240  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3647  homoserine kinase  57.99 
 
 
309 aa  239  5e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.529848  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1254  homoserine kinase  54.38 
 
 
328 aa  226  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0775555 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2621  homoserine kinase  46.93 
 
 
305 aa  226  6e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0320  homoserine kinase  49.45 
 
 
320 aa  225  8e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.234549 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1903  homoserine kinase  53.85 
 
 
336 aa  223  4e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3936  homoserine kinase  53.79 
 
 
316 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0632  homoserine kinase  50.71 
 
 
310 aa  219  5e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.305614  decreased coverage  0.0010744 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2354  homoserine kinase  45.48 
 
 
324 aa  216  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000501713 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1746  homoserine kinase  50.82 
 
 
300 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0611668  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1007  homoserine kinase  51.09 
 
 
317 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2097  homoserine kinase  52.75 
 
 
300 aa  210  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000128102  normal  0.0746509 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29940  homoserine kinase  47.85 
 
 
291 aa  210  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1300  homoserine kinase  46.72 
 
 
304 aa  209  6e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6154  homoserine kinase  50 
 
 
295 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1230  homoserine kinase  38.76 
 
 
355 aa  192  9e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000185797 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2300  homoserine kinase  49.81 
 
 
315 aa  191  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1608  Homoserine kinase  37.37 
 
 
370 aa  191  2e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2115  homoserine kinase  39.93 
 
 
300 aa  185  7e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185248 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1166  homoserine kinase  41.7 
 
 
301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4346  homoserine kinase  50.38 
 
 
314 aa  176  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0197752  normal  0.0812998 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3880  homoserine kinase  50 
 
 
314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11323  homoserine kinase  47.88 
 
 
316 aa  171  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2478  homoserine kinase  37.15 
 
 
297 aa  170  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.979123  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3894  homoserine kinase  49.61 
 
 
314 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3968  homoserine kinase  49.61 
 
 
314 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353705  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0593  homoserine kinase  35.93 
 
 
304 aa  167  2e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1581  homoserine kinase  35.45 
 
 
307 aa  166  5.9999999999999996e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2309  homoserine kinase  33.86 
 
 
308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1074  homoserine kinase  43.73 
 
 
313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1960  homoserine kinase  33.65 
 
 
307 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000160344  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1305  homoserine kinase  38.55 
 
 
296 aa  159  8e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1064  homoserine kinase  37.69 
 
 
303 aa  157  3e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1240  homoserine kinase  37.23 
 
 
314 aa  154  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000301538  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1440  homoserine kinase  38.06 
 
 
306 aa  150  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.231357  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1871  homoserine kinase  35.29 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1897  homoserine kinase  34.93 
 
 
305 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359865  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08010  homoserine kinase  33.58 
 
 
311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0100938  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14830  homoserine kinase  39.61 
 
 
297 aa  145  8.000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17524  normal  0.116843 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5245  homoserine kinase  39.41 
 
 
304 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1794  homoserine kinase  38.89 
 
 
284 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.324471  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3124  homoserine kinase  39.94 
 
 
310 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2794  homoserine kinase  35.23 
 
 
302 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0354264  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1031  homoserine kinase  35.14 
 
 
315 aa  137  2e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18581  homoserine kinase  34.19 
 
 
316 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2698  homoserine kinase  31.21 
 
 
300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0218075  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2880  homoserine kinase  33.83 
 
 
303 aa  136  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0703126  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0595  homoserine kinase  30.61 
 
 
315 aa  136  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0932  homoserine kinase  35.14 
 
 
315 aa  135  7.000000000000001e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.732555  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0118  homoserine kinase  36.94 
 
 
303 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06211  homoserine kinase  30.27 
 
 
315 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46461  predicted protein  36.13 
 
 
426 aa  135  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.5833  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1018  homoserine kinase  33.82 
 
 
305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0910  homoserine kinase  35.93 
 
 
311 aa  133  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000332858 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2253  homoserine kinase  34.78 
 
 
317 aa  133  5e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.227732  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1281  homoserine kinase  32.39 
 
 
296 aa  133  5e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.045186  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0220  homoserine kinase  29.35 
 
 
292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000123965  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1080  homoserine kinase  33.46 
 
 
304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129806 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06601  homoserine kinase  30.53 
 
 
315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1318  homoserine kinase  33.91 
 
 
300 aa  130  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.607391  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0031  homoserine kinase  32.49 
 
 
315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06511  homoserine kinase  32.49 
 
 
315 aa  129  6e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.893933  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16080  homoserine kinase  32.25 
 
 
293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.222088  hitchhiker  0.000000158758 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06511  homoserine kinase  29.86 
 
 
302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_10263  predicted protein  37.09 
 
 
265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.111228  normal  0.879833 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1391  homoserine kinase  28.47 
 
 
304 aa  125  7e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00775199  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1418  homoserine kinase  28.47 
 
 
304 aa  125  7e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.011674  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1479  homoserine kinase  34.48 
 
 
315 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0538  homoserine kinase  32.71 
 
 
309 aa  124  2e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.283285  unclonable  0.0000000181031 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1368  homoserine kinase  25.56 
 
 
297 aa  124  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0129  homoserine kinase  28.35 
 
 
292 aa  123  3e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0169  homoserine kinase  28.35 
 
 
292 aa  123  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00243862  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0147  homoserine kinase  28.35 
 
 
292 aa  123  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00399009  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1119  homoserine kinase  32.15 
 
 
288 aa  123  4e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0950  homoserine kinase  37.83 
 
 
290 aa  123  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.388606 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0899  homoserine kinase  29.58 
 
 
306 aa  122  6e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.29792  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0507  homoserine kinase  31.95 
 
 
286 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0674  homoserine kinase  28.21 
 
 
293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0444063  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0246  homoserine kinase  28.2 
 
 
294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00137655  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0883  homoserine kinase  35.32 
 
 
307 aa  119  7e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000117754  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1023  homoserine kinase  40 
 
 
323 aa  115  6.9999999999999995e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1495  homoserine kinase  27.56 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.122475  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0785  homoserine kinase  31.66 
 
 
292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1835  homoserine kinase  28.3 
 
 
297 aa  113  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.439683  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85224  homoserine kinase  27.8 
 
 
353 aa  112  8.000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.481244  normal  0.37391 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1493  homoserine kinase  26.67 
 
 
294 aa  112  9e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00125886  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10551  homoserine kinase  32 
 
 
303 aa  112  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0375  homoserine kinase  30.6 
 
 
281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>