More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_08960 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_08960  glycosyl transferase  100 
 
 		 245 aa  490  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.206591 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2568  glycosyl transferase family 2  63.14 
 
 		 250 aa  297  8e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.238514  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2355  glycosyl transferase family 2  61.34 
 
 		 250 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000348766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8187  glycosyl transferase family 2  56.96 
 
 		 233 aa  253  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2413  glycosyl transferase family 2  53.04 
 
 		 243 aa  248  5e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.367693 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2681  glycosyl transferase family protein  55.02 
 
 		 249 aa  239  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0123554  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0090  glycosyl transferase family 2  42.69 
 
 		 252 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  35.81 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3050  glycosyl transferase family 2  36.61 
 
 		 227 aa  164  9e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0571  glycosyltransferase ycbB  32.6 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.50645  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5607  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 		 242 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  37.89 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5220  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3944  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 		 242 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5400  glycosyl transferase family 2  30.7 
 
 		 242 aa  153  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.859637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2054  glycosyl transferase family 2  36.13 
 
 		 237 aa  153  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5209  glycosyl transferase family 2  33.48 
 
 		 243 aa  146  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3149  glycosyl transferase family 2  42.55 
 
 		 245 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.754874  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3250  glycosyl transferase family 2  42.55 
 
 		 245 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0680662  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1440  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  32.38 
 
 		 238 aa  142  5e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000177815  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1821  glycosyl transferase family protein  39.39 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3051  glycosyl transferase family protein  41.7 
 
 		 245 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0213  glycosyltransferase  31.74 
 
 		 245 aa  136  4e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0997  glycosyl transferase family 2  29.78 
 
 		 226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1421  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.77 
 
 		 243 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000839573  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5557  hypothetical protein  30.81 
 
 		 176 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3793  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  32.66 
 
 		 450 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0441  glycosyl transferase family protein  38.05 
 
 		 271 aa  112  5e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397838  normal  0.437223 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0220  glycosyl transferase family 2  34.47 
 
 		 353 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  26.97 
 
 		 321 aa  106  3e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  31 
 
 		 340 aa  106  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  32 
 
 		 448 aa  105  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2240  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 		 226 aa  105  8e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1366  glycosyl transferase family protein  29.19 
 
 		 228 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 		 340 aa  102  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 344 aa  102  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  32.63 
 
 		 355 aa  101  9e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0581  glycosyl transferase family protein  28.71 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.529493  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3268  glycosyl transferase family protein  34.11 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1238  glycosyl transferase family protein  37.96 
 
 		 340 aa  99.8  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0299197  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3017  glycosyl transferase family protein  30.9 
 
 		 235 aa  99  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0914269  hitchhiker  0.00000277643 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  29.38 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  31.33 
 
 		 305 aa  97.4  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1501  glycosyl transferase family protein  27.64 
 
 		 230 aa  97.1  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0720079  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0417  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 		 230 aa  94.7  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0490  glycosyl transferase family protein  27.14 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.49136  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 		 253 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0418  glycosyl transferase family protein  26.02 
 
 		 230 aa  93.2  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0496978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  30.7 
 
 		 299 aa  92.4  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  31.65 
 
 		 291 aa  91.3  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2389  glycosyl transferase family protein  33.62 
 
 		 262 aa  91.3  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0758603  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2339  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.231367  normal  0.416225 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2209  glycosyl transferase family 2  33.8 
 
 		 220 aa  89.7  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 		 285 aa  90.1  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 		 313 aa  90.1  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.09 
 
 		 239 aa  89.7  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0044  glycosyltransferase  31.31 
 
 		 352 aa  89  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117079  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0752  glycosyl transferase family protein  38.06 
 
 		 243 aa  89  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000917436  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  34.94 
 
 		 336 aa  88.6  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.64 
 
 		 248 aa  88.2  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1573  b-glycosyltransferase  27.59 
 
 		 248 aa  88.2  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0763842  normal  0.209527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8133  glycosyl transferase, family 2  32.91 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314026  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21780  glycosyl transferase  36.25 
 
 		 261 aa  87  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229815  normal  0.622988 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1841  hypothetical protein  31.03 
 
 		 241 aa  87.8  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2503  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  35.37 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2932  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  35.8 
 
 		 264 aa  87.4  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000763611  hitchhiker  0.000488065 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3616  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 		 222 aa  87.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00297369  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2548  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  35.37 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2905  glycosyl transferase family 2  30.52 
 
 		 243 aa  87  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000459225 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0487  glycosyl transferase family 2  33.96 
 
 		 284 aa  87.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2540  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  35.37 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178137  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0757  glycosyl transferase family protein  34.76 
 
 		 226 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.861392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1919  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.82 
 
 		 241 aa  86.3  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025482  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  35.58 
 
 		 293 aa  86.3  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0734  glycosyl transferase family protein  27.86 
 
 		 230 aa  86.3  4e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0939265  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  31.56 
 
 		 262 aa  86.3  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3710  glycosyl transferase family 2  32.2 
 
 		 345 aa  85.9  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0328231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0602  glycosyl transferase family 2  33.73 
 
 		 233 aa  85.5  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0184  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.13 
 
 		 249 aa  85.5  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0888944  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1686  glycosyl transferase family protein  30.66 
 
 		 220 aa  85.1  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000734571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3369  glycosyl transferase family protein  31.92 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000732835  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3901  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  37.74 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  37.66 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  25.33 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  37.74 
 
 		 414 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2200  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  36.81 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.562364  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1870  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00880451  normal  0.0336485 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  39.24 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2614  glycosyl transferase family 2  30.25 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501358  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3212  glycosyl transferase family protein  31.67 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2422  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.43 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.25 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000779145  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0345  dolichol-phosphate mannosyltransferase  28.26 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.855294  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1604  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.19 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.623354  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2557  glycosyl transferase family 2  26.72 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3118  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.95 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00360955  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>