More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_01630 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_01630  glycosyl transferase  100 
 
 		 285 aa  550  1e-155  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.76765 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0260  glycosyl transferase family 2  80.31 
 
 		 273 aa  408  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.306809  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3245  glycosyl transferase family 2  85.42 
 
 		 277 aa  388  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.164369  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3189  glycosyl transferase family 2  84.89 
 
 		 279 aa  382  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.343721  normal  0.0208978 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0375  glycosyl transferase family 2  76.29 
 
 		 337 aa  335  5.999999999999999e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.293513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0136  dolichyl-phosphate mannose synthase  60.71 
 
 		 226 aa  243  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.908094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0170  glycosyl transferase family 2  63.75 
 
 		 250 aa  237  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.121302  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0034  family 2 glycosyl transferase  58.44 
 
 		 246 aa  223  4e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06720  glycosyl transferase  52.45 
 
 		 445 aa  213  3.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5268  glycosyl transferase family 2  57.71 
 
 		 282 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.180624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0116  glycosyl transferase family 2  60 
 
 		 265 aa  207  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3054  cell wall biogenesis glycosyltransferase  56.12 
 
 		 267 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2044  glycosyl transferase family 2  39.01 
 
 		 230 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.462866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1389  glycosyl transferase family 2  43.89 
 
 		 226 aa  167  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1090  glycosyl transferase family protein  41.28 
 
 		 236 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11948  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1549  glycosyl transferase family protein  35.75 
 
 		 228 aa  161  9e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1612  glycosyl transferase family protein  43.17 
 
 		 231 aa  157  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0243  glycosyl transferase family 2  55.31 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0593  glycosyl transferase family protein  33.46 
 
 		 268 aa  150  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1577  glycosyl transferase family 2  42.13 
 
 		 238 aa  135  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.469655 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1685  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 231 aa  133  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.908588  hitchhiker  0.00379696 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06620  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 221 aa  117  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1450  glycosyl transferase family protein  40 
 
 		 232 aa  94.7  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.226924  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  32.68 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  33 
 
 		 344 aa  82.8  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1312  glycosyl transferase family 2  22.83 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0696  glycosyl transferase family 2  35.07 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.646152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  42.86 
 
 		 336 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07780  glycosyl transferase family 2  29.65 
 
 		 209 aa  78.2  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  26.54 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1807  glycosyl transferase family 2  28.1 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0532  glycosyl transferase family 2  31.6 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356755  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0824  glycosyl transferase family protein  45.08 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.216941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  36.95 
 
 		 228 aa  75.1  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  29.78 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  32.57 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  31.65 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 		 314 aa  72.4  0.000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  27.49 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  30.29 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  29.18 
 
 		 355 aa  68.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0763  glycosyl transferase family 2  42.24 
 
 		 250 aa  68.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.855183  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0488  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 		 362 aa  67.4  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.814661  hitchhiker  0.0000013139 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0866  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0478  glycosyl transferase family protein  34.34 
 
 		 371 aa  66.6  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2614  glycosyl transferase family 2  30.32 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501358  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1737  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 		 448 aa  65.9  0.0000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13662  glycosyltransferase  38.84 
 
 		 237 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0122731 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2780  glycosyl transferase family 2  28.97 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  33.13 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1651  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2490  glycosyl transferase family 2  28.31 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1041  glycosyl transferase family protein  40 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0213116 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  29.8 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  31.88 
 
 		 246 aa  62  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  40.18 
 
 		 1099 aa  62.4  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  27.36 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0916  glycosyl transferase family 2  26.15 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3793  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15820  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  31.67 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1245  glycosyl transferase family 2  29.22 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000219954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4853  glycosyl transferase family 2  27.65 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0997  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  22.7 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2413  glycosyl transferase family 2  46.43 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.367693 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  28.71 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0581  glycosyl transferase family protein  24.65 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.529493  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0083  glycosyltransferase  30.06 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.413849  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 		 450 aa  60.1  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1366  glycosyl transferase family protein  24.65 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0511  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.63 
 
 		 518 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8187  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2592  glycosyl transferase family 2  42.31 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1438  glycosyl transferase family 2  32.2 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.192606  normal  0.0852028 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3710  glycosyl transferase family 2  36.67 
 
 		 345 aa  58.9  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0328231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4474  glycosyl transferase family protein  28.04 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.26 
 
 		 220 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0435  glycosyltransferase  29.66 
 
 		 512 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1959  glycosyl transferase family 2  31.88 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.597827  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4987  glycosyl transferase family protein  27.1 
 
 		 235 aa  58.9  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278061  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1795  glycosyl transferase family 2  33.63 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00120607  normal  0.517558 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  35.25 
 
 		 693 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4209  glycosyl transferase family 2  26.99 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.220629 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  26.94 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1662  glycosyl transferase family protein  31.07 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0966  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2808  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.75 
 
 		 498 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.411544  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0483  hypothetical protein  21.49 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2758  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.75 
 
 		 496 aa  57  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000111644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2740  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.75 
 
 		 498 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3022  group 2 family glycosyl transferase  29.75 
 
 		 498 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8133  glycosyl transferase, family 2  29.78 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314026  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3018  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.75 
 
 		 498 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.477867 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1787  family 2 glycosyl transferase  32.19 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.350467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0490  glycosyl transferase family protein  29.57 
 
 		 230 aa  57  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.49136  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  26.07 
 
 		 227 aa  57  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08600  glycosyl transferase  32.68 
 
 		 225 aa  57  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.36917 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>