More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5268 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5268  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
282 aa  550  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.180624  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0136  dolichyl-phosphate mannose synthase  70 
 
 
226 aa  300  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.908094  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3054  cell wall biogenesis glycosyltransferase  73.5 
 
 
267 aa  292  3e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0034  family 2 glycosyl transferase  70.71 
 
 
246 aa  289  4e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0116  glycosyl transferase family 2  68.72 
 
 
265 aa  279  4e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0260  glycosyl transferase family 2  56.84 
 
 
273 aa  241  7e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.306809  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3189  glycosyl transferase family 2  58.93 
 
 
279 aa  241  9e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.343721  normal  0.0208978 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01630  glycosyl transferase  57.69 
 
 
285 aa  238  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.76765 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0375  glycosyl transferase family 2  54.22 
 
 
337 aa  226  4e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.293513 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0170  glycosyl transferase family 2  61.92 
 
 
250 aa  224  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.121302  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3245  glycosyl transferase family 2  56.41 
 
 
277 aa  218  1e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.164369  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06720  glycosyl transferase  51.57 
 
 
445 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1549  glycosyl transferase family protein  39.08 
 
 
228 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1090  glycosyl transferase family protein  45.02 
 
 
236 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11948  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1389  glycosyl transferase family 2  47.37 
 
 
226 aa  174  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2044  glycosyl transferase family 2  42.54 
 
 
230 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.462866  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1612  glycosyl transferase family protein  45.3 
 
 
231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0593  glycosyl transferase family protein  36.82 
 
 
268 aa  157  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0243  glycosyl transferase family 2  50.64 
 
 
233 aa  149  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1577  glycosyl transferase family 2  45.05 
 
 
238 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.469655 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1685  glycosyl transferase family 2  35.9 
 
 
231 aa  138  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.908588  hitchhiker  0.00379696 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06620  glycosyl transferase family 2  31.33 
 
 
221 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1312  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
222 aa  92.4  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1450  glycosyl transferase family protein  38.84 
 
 
232 aa  88.2  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.226924  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0488  glycosyl transferase family protein  35.42 
 
 
362 aa  83.6  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.814661  hitchhiker  0.0000013139 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  35.11 
 
 
448 aa  80.9  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1807  glycosyl transferase family 2  30.13 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1651  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 
206 aa  79  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  30.37 
 
 
355 aa  79  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1245  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 
324 aa  75.9  0.0000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000219954  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  32.65 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4474  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 
235 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  31.53 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  32.09 
 
 
295 aa  71.6  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  29.68 
 
 
344 aa  70.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4853  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 
227 aa  70.1  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  36.8 
 
 
693 aa  70.1  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4987  glycosyl transferase family protein  30.41 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278061  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8133  glycosyl transferase, family 2  31.7 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314026  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  36.44 
 
 
336 aa  68.9  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1041  glycosyl transferase family protein  38.28 
 
 
222 aa  68.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0213116 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0763  glycosyl transferase family 2  41.46 
 
 
250 aa  68.2  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.855183  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  29.58 
 
 
293 aa  67.8  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6919  glycosyl transferase family 2  35.05 
 
 
241 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00000675814  hitchhiker  0.000119796 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1438  glycosyl transferase family 2  26.05 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.192606  normal  0.0852028 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0824  glycosyl transferase family protein  33.82 
 
 
234 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.216941  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  31.16 
 
 
298 aa  67  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0532  glycosyl transferase family 2  29.86 
 
 
315 aa  66.6  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356755  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07780  glycosyl transferase family 2  30.41 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2299  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 
332 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705135  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0696  glycosyl transferase family 2  30.84 
 
 
310 aa  64.7  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.646152  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  29.3 
 
 
314 aa  65.5  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3268  glycosyl transferase family protein  30.6 
 
 
301 aa  64.7  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230129  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  32.58 
 
 
253 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0033  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.07 
 
 
247 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0326174 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  35.11 
 
 
450 aa  63.9  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 
340 aa  63.5  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2490  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 
344 aa  63.9  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0298  glycosyl transferase family 2  28.34 
 
 
217 aa  63.5  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00219104  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1959  glycosyl transferase family 2  42.19 
 
 
212 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.597827  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2870  glycosyl transferase family 2  34.17 
 
 
227 aa  62.4  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000193907  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
321 aa  61.6  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  32.57 
 
 
228 aa  62  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1787  family 2 glycosyl transferase  40.94 
 
 
210 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.350467  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33890  glycosyl transferase  31.78 
 
 
749 aa  61.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47583  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  28.17 
 
 
307 aa  61.2  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 
229 aa  60.8  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0490  glycosyl transferase family protein  28.8 
 
 
230 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.49136  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  27.49 
 
 
227 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  27.01 
 
 
227 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1142  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  47.06 
 
 
321 aa  60.1  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0992  glycosyl transferase family 2  30.33 
 
 
240 aa  59.7  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.861872  hitchhiker  0.00252858 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2940  glycosyl transferase family protein  30.62 
 
 
318 aa  59.7  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  24.06 
 
 
229 aa  59.7  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0534  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 
238 aa  59.3  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0441  glycosyl transferase family protein  32.41 
 
 
271 aa  58.9  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397838  normal  0.437223 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1292  hypothetical protein  28.5 
 
 
309 aa  58.9  0.00000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1109  glycosyltransferase  25.67 
 
 
531 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.405384  normal  0.415248 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1495  glycosyl transferase family protein  26.24 
 
 
308 aa  58.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.025805  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0916  glycosyl transferase family 2  29.02 
 
 
336 aa  58.9  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 
287 aa  58.5  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1566  cell wall membrane glycosyltransferase  31.34 
 
 
314 aa  58.2  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.901523  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13662  glycosyltransferase  34.15 
 
 
237 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0122731 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5439  glycosyl transferase family protein  25.99 
 
 
318 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.431845 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
305 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  29.81 
 
 
259 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1038  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 
685 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.152383  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  27.52 
 
 
227 aa  57.4  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1189  glycosyltransferase, group 2 family protein  26.17 
 
 
310 aa  57  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
340 aa  56.6  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  37.31 
 
 
273 aa  56.6  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1401  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 
798 aa  56.2  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  30.95 
 
 
238 aa  56.2  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0960  glycosyl transferase family protein  30.91 
 
 
316 aa  55.8  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.36215  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1592  glycosyl transferase family protein  27.51 
 
 
346 aa  55.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  44.19 
 
 
336 aa  55.8  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 
299 aa  55.5  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0596  dolichol-phosphate mannosyltransferase  25.36 
 
 
305 aa  55.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0757  glycosyl transferase family protein  29.48 
 
 
226 aa  55.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.861392  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>