34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3462 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3462  ABC-3 protein  100 
 
 		 259 aa  501  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0567  ABC-3 protein  100 
 
 		 255 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0568  ABC-3 protein  99.22 
 
 		 255 aa  489  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0566  ABC 3 transport family protein  94.21 
 
 		 259 aa  472  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3309  ABC-3 protein  88.8 
 
 		 262 aa  435  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.224275  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3797  ABC-3 protein  91.27 
 
 		 266 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.48799  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3740  ABC-3 protein  90.87 
 
 		 266 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3923  ABC-3 protein  90.87 
 
 		 266 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00893533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0528  ABC-3 protein  90.87 
 
 		 266 aa  417  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000497802  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3515  ABC-3 protein  78.16 
 
 		 261 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4332  ABC-3 protein  73.83 
 
 		 265 aa  377  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.364125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3140  ABC 3 transport family protein  79.2 
 
 		 251 aa  374  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0618  ABC-3 protein  79.67 
 
 		 286 aa  375  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.087201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0449  ABC-3 protein  80.08 
 
 		 263 aa  364  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.856508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0529  hypothetical protein  74.39 
 
 		 263 aa  359  3e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00670346  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3714  ABC-3 protein  74.13 
 
 		 263 aa  343  2e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0390511  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000604  zinc ABC transporter permease protein ZnuB  41.7 
 
 		 267 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000103291  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06464  hypothetical protein  39.69 
 
 		 264 aa  176  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2539  zinc/manganese transport system permease protein  49.78 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.421777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1547  ABC-3 protein  33.9 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000363711  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0050  putative manganese transport system permease protein  35.86 
 
 		 249 aa  102  9e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2782  ABC-3 protein  34.62 
 
 		 466 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1444  hypothetical protein  32.37 
 
 		 239 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00097924  normal  0.0494808 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0153  cation ABC transporter, permease protein  28.28 
 
 		 267 aa  48.5  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  30.47 
 
 		 274 aa  46.6  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2421  ABC Mn2+/Zn2+ transporter,inner membrane subunit  28.92 
 
 		 276 aa  46.2  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0177  cation ABC transporter, permease protein  27.78 
 
 		 267 aa  46.2  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  29.69 
 
 		 274 aa  45.8  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  27.74 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  27.74 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  30.47 
 
 		 272 aa  42.7  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2716  ABC-3 protein  38.36 
 
 		 271 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  27.6 
 
 		 304 aa  42  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0136  cation ABC transporter, permease protein  26.77 
 
 		 267 aa  42  0.009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.032132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>