42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0914 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0914  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  657    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2516  hypothetical protein  67.09 
 
 		 316 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0713675  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1580  protein of unknown function DUF559  36.62 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3561  hypothetical protein  41.79 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5155  protein of unknown function DUF559  35.37 
 
 		 311 aa  53.1  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1131  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.88 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00428914 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2421  hypothetical protein  40.74 
 
 		 1724 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220469  normal  0.974769 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3609  hypothetical protein  33.75 
 
 		 201 aa  51.2  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.239567  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2841  protein of unknown function DUF559  32.56 
 
 		 148 aa  49.7  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00016732  normal  0.493476 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0282  hypothetical protein  41.94 
 
 		 122 aa  49.7  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2461  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  39.06 
 
 		 1403 aa  49.3  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1705  hypothetical protein  39.06 
 
 		 1421 aa  49.3  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0720  superfamily protein I DNA/RNA helicase  38.36 
 
 		 1490 aa  48.9  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0213  hypothetical protein  38.46 
 
 		 139 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.278517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1560  hypothetical protein  32.39 
 
 		 304 aa  47  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.426763  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3039  hypothetical protein  35.48 
 
 		 289 aa  46.6  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000250216  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0164  protein of unknown function DUF559  40 
 
 		 119 aa  46.2  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3303  hypothetical protein  32.84 
 
 		 279 aa  45.8  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1182  hypothetical protein  32.88 
 
 		 327 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3620  protein of unknown function DUF559  33.8 
 
 		 142 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4935  protein of unknown function DUF559  31.17 
 
 		 122 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0533861  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1053  protein of unknown function DUF559  31.71 
 
 		 270 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.261729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5388  hypothetical protein  36.84 
 
 		 242 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0541  hypothetical protein  38.46 
 
 		 225 aa  43.9  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.164679  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3715  hypothetical protein  39.13 
 
 		 272 aa  44.3  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0591  DNA helicase, putative  32.53 
 
 		 1629 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5477  hypothetical protein  36.84 
 
 		 285 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0193619  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0966  hypothetical protein  39.68 
 
 		 275 aa  43.5  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2845  DNA helicase, putative  28.24 
 
 		 1523 aa  43.9  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.914274 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3899  hypothetical protein  31.25 
 
 		 289 aa  43.5  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5764  hypothetical protein  36.84 
 
 		 285 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2725  protein of unknown function DUF559  40.68 
 
 		 1489 aa  43.5  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.602171 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1674  protein of unknown function DUF559  35.21 
 
 		 133 aa  43.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0900  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  43.5  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1037  protein of unknown function DUF559  41.54 
 
 		 122 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0549922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1559  hypothetical protein  32.86 
 
 		 121 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0952  leucyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 		 1146 aa  42.7  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2097  hypothetical protein  33.33 
 
 		 118 aa  42.7  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1809  hypothetical protein  35.94 
 
 		 849 aa  42.7  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0011  protein of unknown function DUF559  44.64 
 
 		 123 aa  42.4  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3166  hypothetical protein  45.1 
 
 		 1652 aa  42.4  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1651  hypothetical protein  34.72 
 
 		 123 aa  42.4  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.173926 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>