51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0842 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0842  putative adenylyl cyclase CyaB  100 
 
 		 204 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.112196 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3125  putative adenylyl cyclase CyaB  98.53 
 
 		 204 aa  417  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3778  adenylate cyclase CyaB, putative  87.19 
 
 		 194 aa  362  2e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0814  putative adenylyl cyclase CyaB  94.5 
 
 		 213 aa  354  5.999999999999999e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3104  putative adenylyl cyclase CyaB  79.79 
 
 		 197 aa  329  1e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0910  putative adenylyl cyclase CyaB  81.82 
 
 		 195 aa  323  1e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3461  putative adenylyl cyclase CyaB  81.82 
 
 		 195 aa  322  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0875  putative adenylyl cyclase CyaB  80.75 
 
 		 195 aa  320  7e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0901  adenylyl cyclase CyaB  81.28 
 
 		 195 aa  320  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1050  putative adenylate cyclase CyaB  68.97 
 
 		 185 aa  251  6e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0024  adenylate cyclase  61.93 
 
 		 183 aa  234  7e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0940  putative adenylyl cyclase CyaB  60.92 
 
 		 185 aa  229  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1665  putative adenylyl cyclase CyaB  57.8 
 
 		 183 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.248414  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02204  hypothetical protein  58.52 
 
 		 182 aa  214  5.9999999999999996e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1517  putative adenylyl cyclase CyaB  53.63 
 
 		 193 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000378541  normal  0.664583 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1784  putative adenylyl cyclase CyaB  56 
 
 		 194 aa  207  8e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2804  adenylate cyclase, class IV  48.86 
 
 		 179 aa  175  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1350  adenylate cyclase 2  48.86 
 
 		 179 aa  175  5e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0174263 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2502  adenylyl cyclase CyaB  48.3 
 
 		 179 aa  171  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2407  adenylyl cyclase CyaB  47.4 
 
 		 179 aa  168  5e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308065  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1537  adenylyl cyclase CyaB  46.82 
 
 		 180 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.678182  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2924  adenylyl cyclase CyaB  46.82 
 
 		 180 aa  164  8e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.880007  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0623  adenylyl cyclase CyaB  36.42 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0735  putative adenylyl cyclase CyaB  27.53 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00219376 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1114  putative adenylyl cyclase CyaB  32.73 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.643274 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0075  putative adenylyl cyclase CyaB  31.67 
 
 		 176 aa  64.3  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.109831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0808  putative adenylyl cyclase CyaB  33.52 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0933  putative adenylyl cyclase CyaB  30.49 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.164628  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1326  putative adenylyl cyclase CyaB  30.86 
 
 		 175 aa  62  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.422285 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0067  adenylyl cyclase CyaB  30.91 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.160565  normal  0.206262 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0548  adenylate cyclase  28.77 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0514  adenylyl cyclase CyaB  28.78 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1167  adenylyl cyclase CyaB, putative  24.46 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0805  adenylyl cyclase CyaB  26.67 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.763555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1147  hypothetical protein  29.08 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.903912 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2305  adenylyl cyclase CyaB  27.34 
 
 		 181 aa  53.5  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0126885  normal  0.751604 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0037  adenylate cyclase  32.74 
 
 		 176 aa  52.8  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1572  adenylyl cyclase CyaB  26.92 
 
 		 175 aa  51.6  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.845661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1935  adenylate cyclase  25.7 
 
 		 171 aa  50.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00466325  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0006  adenylate cyclase  30.97 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.136902 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0038  putative adenylyl cyclase CyaB  31.16 
 
 		 180 aa  50.4  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.318646  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1229  adenylyl cyclase CyaB  32.04 
 
 		 186 aa  48.5  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2432  adenylyl cyclase CyaB  30 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.190501  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0631  adenylate cyclase  25.28 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446364  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0232  adenylyl cyclase CyaB  25.97 
 
 		 178 aa  45.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0056  adenylate cyclase  32.35 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0323  adenylyl cyclase CyaB  27.27 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.362109  normal  0.0195848 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1526  adenylate cyclase  25.9 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3053  adenylate cyclase  25.55 
 
 		 176 aa  42.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0013  putative adenylate cyclase  24.71 
 
 		 178 aa  41.6  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3919  adenylate cyclase  24.71 
 
 		 178 aa  41.2  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.682505  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>