64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0692 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0692  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  416  1e-115  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  3.45273e-06  normal  0.666966 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3330  hypothetical protein  98.01 
 
 
201 aa  410  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0277435  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3442  hypothetical protein  97.51 
 
 
201 aa  407  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  8.87757e-06  normal  0.148419 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0834  hypothetical protein  77.78 
 
 
206 aa  317  9e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3524  hypothetical protein  64.81 
 
 
218 aa  285  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  2.04925e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0811  protein of unknown function DUF335 SprT  64.52 
 
 
219 aa  283  1e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  3.76161e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0843  protein of unknown function DUF335 SprT  65.28 
 
 
218 aa  282  2e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0209179  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0836  protein of unknown function DUF335 SprT  64.06 
 
 
219 aa  280  7e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00977603  hitchhiker  1.07184e-05 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3159  protein of unknown function DUF335, SprT  64.38 
 
 
219 aa  276  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  6.19203e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0545  protein of unknown function DUF335, SprT  63.23 
 
 
203 aa  217  9e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.510358  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4132  protein of unknown function DUF335 SprT  53.3 
 
 
212 aa  214  8e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.047618 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2972  hypothetical protein  62.5 
 
 
219 aa  212  3e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.609934  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3970  protein of unknown function DUF335, SprT  59.28 
 
 
191 aa  211  5e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0602  protein of unknown function DUF335 SprT  52.58 
 
 
188 aa  206  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3222  protein of unknown function DUF335, SprT  58.49 
 
 
203 aa  206  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00097264  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002465  protein SprT  54.05 
 
 
165 aa  183  2e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0551  hypothetical protein  50.62 
 
 
161 aa  182  3e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03570  hypothetical protein  52.7 
 
 
165 aa  177  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0577  sprT protein, putative  49.68 
 
 
184 aa  171  8e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00218492  normal  0.10682 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2368  protein of unknown function DUF335, SprT  47.77 
 
 
176 aa  169  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0781299  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0023  hypothetical protein  48.65 
 
 
162 aa  163  2e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01642  hypothetical protein  52.11 
 
 
151 aa  160  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.241313  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2966  hypothetical protein  48.41 
 
 
164 aa  156  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0041354  normal  0.102756 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3228  protein of unknown function DUF335, SprT  43.42 
 
 
162 aa  152  3e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3708  hypothetical protein  45.81 
 
 
170 aa  150  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000576402  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1624  hypothetical protein  44.3 
 
 
169 aa  150  1e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3376  hypothetical protein  44.81 
 
 
165 aa  148  5e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1201  hypothetical protein  48.03 
 
 
164 aa  147  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02737  hypothetical protein  44.81 
 
 
165 aa  147  8e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208868  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3102  hypothetical protein  44.81 
 
 
165 aa  147  8e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02774  hypothetical protein  44.81 
 
 
165 aa  147  8e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.110605  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0751  protein of unknown function DUF335 SprT  44.81 
 
 
165 aa  147  8e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.067857  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3287  hypothetical protein  44.81 
 
 
165 aa  147  9e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.717112  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3906  hypothetical protein  44.52 
 
 
170 aa  147  9e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  9.39538e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3086  hypothetical protein  45.1 
 
 
165 aa  147  1e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0374593  hitchhiker  0.00021739 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3706  hypothetical protein  45.28 
 
 
164 aa  146  2e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100473 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1241  hypothetical protein  48.03 
 
 
164 aa  146  2e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.28773e-08 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4247  hypothetical protein  40.45 
 
 
183 aa  145  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.397141 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4234  hypothetical protein  44.03 
 
 
164 aa  145  4e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4023  hypothetical protein  44.52 
 
 
170 aa  145  4e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.35855e-07  decreased coverage  0.000372984 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2229  protein of unknown function DUF335 SprT  42.76 
 
 
174 aa  144  8e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.354031  normal  0.796923 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1683  peptidase, SprT family  45.28 
 
 
164 aa  144  9e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.781786  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0505  hypothetical protein  42.14 
 
 
170 aa  143  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000160029  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0548  hypothetical protein  44.3 
 
 
170 aa  143  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  2.20186e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1639  hypothetical protein  46.5 
 
 
164 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197391  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4078  hypothetical protein  46.5 
 
 
164 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0770  hypothetical protein  45.58 
 
 
151 aa  142  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  2.27359e-05  hitchhiker  9.31266e-05 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0840  hypothetical protein  43.23 
 
 
170 aa  142  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3346  hypothetical protein  43.23 
 
 
187 aa  142  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0842  hypothetical protein  43.23 
 
 
187 aa  142  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  3.65146e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33250  hypothetical protein  45.16 
 
 
164 aa  141  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.115665  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3435  hypothetical protein  42.04 
 
 
165 aa  139  2e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0526499  hitchhiker  0.00365775 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3255  hypothetical protein  42.04 
 
 
165 aa  139  2e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  6.136e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3266  hypothetical protein  42.04 
 
 
165 aa  139  2e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.005885  normal  0.0446452 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3331  hypothetical protein  42.04 
 
 
165 aa  139  2e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.10575  normal  0.425008 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4190  hypothetical protein  43.12 
 
 
165 aa  139  2e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3339  hypothetical protein  42.04 
 
 
165 aa  139  2e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00105383  normal  0.150558 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3348  hypothetical protein  41.29 
 
 
165 aa  137  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000288279  decreased coverage  0.00213814 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49060  hypothetical protein  43.12 
 
 
165 aa  136  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.203632  hitchhiker  1.35384e-07 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0864  hypothetical protein  42.77 
 
 
188 aa  118  5e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1712  protein of unknown function DUF335, SprT  35.77 
 
 
169 aa  92  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0324  protein of unknown function DUF335 SprT  32.07 
 
 
196 aa  90.5  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0077532  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1552  protein of unknown function DUF335, SprT  33.87 
 
 
193 aa  82.4  4e-15  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0472621  normal  0.956048 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0501  hypothetical protein  31.11 
 
 
203 aa  74.7  8e-13  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  5.72187e-06  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>