28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1984 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1984  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  340  5.999999999999999e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000029351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2009  hypothetical protein  47.47 
 
 		 150 aa  152  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000579412  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2426  hypothetical protein  44.38 
 
 		 154 aa  148  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0117545  hitchhiker  0.0000688315 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2365  hypothetical protein  46.63 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2005  hypothetical protein  52.59 
 
 		 161 aa  145  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00021351  hitchhiker  0.000000141582 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1970  hypothetical protein  52.59 
 
 		 161 aa  145  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000508823  hitchhiker  0.00854934 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2213  hypothetical protein  43.56 
 
 		 165 aa  144  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000117467  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2106  hypothetical protein  45.75 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121868  normal  0.452338 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2200  hypothetical protein  51.3 
 
 		 150 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0036966  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2213  hypothetical protein  51.3 
 
 		 150 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00174935  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4486  hypothetical protein  51.3 
 
 		 161 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2171  hypothetical protein  51.75 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00980217  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1790  hypothetical protein  47.52 
 
 		 150 aa  138  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0036932  normal  0.183021 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2221  hypothetical protein  51.75 
 
 		 161 aa  137  7e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000880424  normal  0.25123 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2210  hypothetical protein  54.39 
 
 		 141 aa  136  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.120945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1960  hypothetical protein  46.9 
 
 		 151 aa  124  5e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.616556  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1852  hypothetical protein  43.75 
 
 		 172 aa  123  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000309219  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1997  putative lipoprotein  26.99 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.481992  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3249  hypothetical protein  29.09 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00452739  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1271  hypothetical protein  29.09 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0490949  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0369  hypothetical protein  26.32 
 
 		 158 aa  51.2  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0940  hypothetical protein  24.18 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1390  hypothetical protein  28.18 
 
 		 158 aa  50.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02053  hypothetical protein  31.25 
 
 		 133 aa  48.9  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00133062  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1576  hypothetical protein  24.53 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.678852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1137  hypothetical protein  23.66 
 
 		 148 aa  44.7  0.0006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0043  hypothetical protein  26.05 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.761972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1812  hypothetical protein  30.77 
 
 		 142 aa  42  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.639784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>