18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1812 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1812  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  295  1e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.639784  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1368  hypothetical protein  63.06 
 
 		 142 aa  156  8e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.963563  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2080  hypothetical protein  61.06 
 
 		 141 aa  141  4e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.210886  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1577  hypothetical protein  52.67 
 
 		 130 aa  135  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1337  FixH family protein  34.29 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1235  hypothetical protein  34.29 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1223  hypothetical protein  36.08 
 
 		 283 aa  67  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.808212 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1175  hypothetical protein  31.13 
 
 		 265 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.888048  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0043  hypothetical protein  33.62 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.761972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1922  hypothetical protein  27.86 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0369  hypothetical protein  32.38 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1816  hypothetical protein  26.5 
 
 		 172 aa  51.2  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.103062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1390  hypothetical protein  21.9 
 
 		 158 aa  43.9  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0782  hypothetical protein  26.55 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0323619  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3249  hypothetical protein  19.85 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00452739  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1271  hypothetical protein  19.85 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0490949  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1984  hypothetical protein  30.77 
 
 		 165 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000029351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1576  hypothetical protein  28 
 
 		 156 aa  41.6  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.678852  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>