More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0289 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0482  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  64.6 
 
 		 548 aa  713    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.267774 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03646  acetolactate synthase II, valine insensitive, large subunit  64.9 
 
 		 548 aa  746    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0646243  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4134  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  64.17 
 
 		 548 aa  743    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.82212  normal  0.957886 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4279  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  64.72 
 
 		 548 aa  746    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4843  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  61.88 
 
 		 521 aa  663    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4347  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  83.67 
 
 		 552 aa  926    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0154  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  64.6 
 
 		 548 aa  713    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4165  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  84.02 
 
 		 557 aa  978    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4183  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  64.72 
 
 		 548 aa  742    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.224573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4291  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  64.72 
 
 		 548 aa  743    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.700125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5202  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  64.9 
 
 		 548 aa  748    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3985  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  64.72 
 
 		 548 aa  746    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2488  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  62.79 
 
 		 548 aa  691    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.818345  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3934  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  83.12 
 
 		 557 aa  931    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4232  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  64.9 
 
 		 548 aa  745    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3614  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  82.76 
 
 		 557 aa  915    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4015  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  64.17 
 
 		 548 aa  739    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565502 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0442  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  82.91 
 
 		 562 aa  964    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.596547 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00410  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  61.16 
 
 		 548 aa  679    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03595  hypothetical protein  64.9 
 
 		 548 aa  746    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0633614  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3414  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  80.97 
 
 		 557 aa  902    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4760  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  64.72 
 
 		 548 aa  728    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4009  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  82.94 
 
 		 557 aa  930    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0289  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  100 
 
 		 557 aa  1133    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3776  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  64.23 
 
 		 548 aa  747    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0147  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  56.71 
 
 		 558 aa  651    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0362  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  83.3 
 
 		 557 aa  933    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3664  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  82.94 
 
 		 551 aa  920    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0422  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  80.72 
 
 		 555 aa  898    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0356  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  83.3 
 
 		 557 aa  933    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4221  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  64.23 
 
 		 548 aa  745    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4152  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  64.72 
 
 		 548 aa  746    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3281  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  80.54 
 
 		 556 aa  882    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0348  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  63.32 
 
 		 548 aa  701    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4061  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  64.78 
 
 		 548 aa  716    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4111  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  64.72 
 
 		 548 aa  743    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4126  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  64.9 
 
 		 548 aa  745    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4234  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  64.72 
 
 		 548 aa  746    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.194744  normal  0.310929 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4032  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  64.23 
 
 		 548 aa  744    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0345  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  83.18 
 
 		 569 aa  965    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0918871  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0138  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  63.87 
 
 		 548 aa  744    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4128  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  83.12 
 
 		 557 aa  931    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4031  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  82.94 
 
 		 557 aa  929    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1108  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  53.42 
 
 		 583 aa  608  1e-173  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0289  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  55.09 
 
 		 572 aa  605  9.999999999999999e-173  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.403033  normal  0.363537 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1202  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  53.42 
 
 		 583 aa  607  9.999999999999999e-173  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02606  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  56.49 
 
 		 573 aa  594  1e-168  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3329  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  55.25 
 
 		 578 aa  589  1e-167  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2114  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  51.61 
 
 		 565 aa  574  1.0000000000000001e-162  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1707  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.84 
 
 		 571 aa  523  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.49 
 
 		 569 aa  522  1e-147  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.27 
 
 		 569 aa  523  1e-147  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.62 
 
 		 566 aa  522  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.26 
 
 		 566 aa  518  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1714  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.03 
 
 		 570 aa  521  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1691  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.85 
 
 		 570 aa  520  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1850  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.03 
 
 		 570 aa  521  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0722574  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.38 
 
 		 555 aa  520  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1888  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.03 
 
 		 570 aa  521  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1620  acetolactate synthase catalytic subunit  49.1 
 
 		 556 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.546066  normal  0.5994 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.1 
 
 		 558 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2596  acetolactate synthase catalytic subunit  47.39 
 
 		 577 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.02 
 
 		 566 aa  512  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500204  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1260  acetolactate synthase, large subunit  45.37 
 
 		 566 aa  513  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00775476  hitchhiker  0.00000116322 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2258  acetolactate synthase, large subunit  47.76 
 
 		 569 aa  513  1e-144  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2746  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.91 
 
 		 566 aa  513  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.92 
 
 		 563 aa  511  1e-144  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  46.24 
 
 		 562 aa  513  1e-144  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1851  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.31 
 
 		 573 aa  511  1e-144  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842705  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1921  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.65 
 
 		 576 aa  513  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.299558 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3491  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.31 
 
 		 571 aa  512  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  46.65 
 
 		 567 aa  511  1e-144  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1934  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.58 
 
 		 571 aa  510  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.76 
 
 		 570 aa  508  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2401  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.19 
 
 		 558 aa  511  1e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.77 
 
 		 553 aa  511  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07681  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  49.21 
 
 		 593 aa  511  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.28 
 
 		 561 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1141  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.04 
 
 		 565 aa  506  9.999999999999999e-143  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3681  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.15 
 
 		 586 aa  507  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358413  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0898  acetolactate synthase, large subunit  44.39 
 
 		 564 aa  507  9.999999999999999e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0352  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.23 
 
 		 556 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4449  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.32 
 
 		 570 aa  503  1e-141  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  44.22 
 
 		 588 aa  504  1e-141  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.92 
 
 		 565 aa  502  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.83 
 
 		 554 aa  504  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0717  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  48.49 
 
 		 574 aa  502  1e-141  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.52 
 
 		 582 aa  501  1e-141  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.91 
 
 		 612 aa  503  1e-141  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.11 
 
 		 555 aa  503  1e-141  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  45.14 
 
 		 563 aa  502  1e-141  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.62 
 
 		 581 aa  503  1e-141  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1966  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.32 
 
 		 571 aa  504  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.107455  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002041  acetolactate synthase large subunit  57.88 
 
 		 421 aa  503  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4988  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.6 
 
 		 619 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.44 
 
 		 581 aa  503  1e-141  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.1 
 
 		 559 aa  499  1e-140  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5448  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  44.19 
 
 		 592 aa  499  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404549  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0620  acetolactate synthase catalytic subunit  46.47 
 
 		 554 aa  499  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0581  acetolactate synthase catalytic subunit  46.93 
 
 		 554 aa  500  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>