33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_02910 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3729  alkaline phosphatase domain-containing protein  56.37 
 
 
703 aa  806  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141206  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0565  hypothetical protein  57.29 
 
 
686 aa  809  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.642014  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02910  conserved hypothetical protein TIGR02688  100 
 
 
694 aa  1439  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000891633  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2202  hypothetical protein  52.53 
 
 
670 aa  729  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.501325  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1675  hypothetical protein  57.12 
 
 
689 aa  811  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.404714  hitchhiker  0.000649266 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4849  hypothetical protein  43.78 
 
 
675 aa  554  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895704  normal  0.860028 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2488  ATP-dependent Lon protease  50.54 
 
 
678 aa  442  1e-122  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1906  ATP-dependent protease La  48.38 
 
 
687 aa  436  1e-121  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.672246  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2283  ATP-dependent Lon-type protease  47.52 
 
 
679 aa  436  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0301  putative ATP-dependent Lon protease  47.18 
 
 
676 aa  429  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0341  hypothetical protein  45.69 
 
 
694 aa  426  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.168371  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5032  putative ATP-dependent Lon protease  45.61 
 
 
686 aa  424  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_258  ATP-dependent Lon protease  44.66 
 
 
676 aa  410  1e-113  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2105  hypothetical protein  44.92 
 
 
676 aa  392  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1126  hypothetical protein  44.11 
 
 
678 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596948  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0999  ATP-dependent protease La  41.35 
 
 
679 aa  368  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.48984  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2041  ATP-dependent protease La  37.91 
 
 
684 aa  365  1e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1077  putative ATP-dependent Lon protease  40.53 
 
 
681 aa  355  1e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.543626 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3231  putative ATP-dependent Lon protease  40.59 
 
 
684 aa  345  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2236  putative ATP-dependent Lon protease  39.96 
 
 
682 aa  338  2e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  5.8517e-05 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1136  putative ATP-dependent Lon protease  38.43 
 
 
682 aa  333  5e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.541958  hitchhiker  4.32292e-07 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2752  putative ATP-dependent Lon protease  38.64 
 
 
682 aa  323  5e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1323  putative ATP-dependent Lon protease  38.35 
 
 
681 aa  323  7e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1800  ATP-dependent protease La  31.37 
 
 
469 aa  237  4e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.186498  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3353  hypothetical protein  33.41 
 
 
508 aa  229  9e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1519  ATP-dependent protease La  34.13 
 
 
470 aa  222  2e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1245  ATP-dependent Lon-type protease  31.8 
 
 
531 aa  221  2e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1063  hypothetical protein  29.85 
 
 
477 aa  209  1e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0757607  hitchhiker  0.000125956 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1754  hypothetical protein  28.66 
 
 
473 aa  193  9e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0803  ATP-dependent protease La  28.66 
 
 
485 aa  174  6e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0793  ATP-dependent Lon-type protease-like protein  27.23 
 
 
485 aa  171  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0583  ATP-dependent protease La  26.14 
 
 
186 aa  79.7  1e-13  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1406  hypothetical protein  30.07 
 
 
914 aa  68.6  3e-10  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>