228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_02380 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_02380  carbamate kinase  100 
 
 
317 aa  650    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.720538  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00850  carbamate kinase  81.96 
 
 
319 aa  521  1e-147  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0679  carbamate kinase  81.39 
 
 
317 aa  517  1e-146  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.378738 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1947  carbamate kinase  82.02 
 
 
317 aa  518  1e-146  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0184546  normal  0.423275 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06560  carbamate kinase  78.16 
 
 
319 aa  514  1e-144  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.298804 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0673  carbamate kinase  71.61 
 
 
317 aa  473  1e-132  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000329636 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0183  carbamate kinase  57.93 
 
 
310 aa  369  1e-101  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0426  carbamate kinase  54.9 
 
 
310 aa  347  1e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0787  carbamate kinase  54.4 
 
 
312 aa  346  3e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06680  carbamate kinase  55.37 
 
 
310 aa  343  2e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0651  carbamate kinase  54.46 
 
 
310 aa  340  2e-92  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1429  carbamate kinase  55.37 
 
 
310 aa  332  3e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2650  carbamate kinase  53.25 
 
 
313 aa  324  1e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2476  carbamate kinase  53.57 
 
 
309 aa  319  5e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2125  carbamate kinase  50.82 
 
 
308 aa  318  7e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2352  carbamate kinase  48.37 
 
 
310 aa  317  1e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1253  carbamate kinase  47.56 
 
 
311 aa  317  2e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.661641  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1228  carbamate kinase  47.56 
 
 
311 aa  317  2e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0242  carbamate kinase  52.41 
 
 
313 aa  316  3e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000109106  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0164  carbamate kinase  50 
 
 
314 aa  314  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0160  carbamate kinase  49.35 
 
 
314 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0818  carbamate kinase  51.47 
 
 
310 aa  312  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0029  carbamate kinase  50.49 
 
 
310 aa  312  3.9999999999999997e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3007  carbamate kinase  51.47 
 
 
310 aa  312  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3034  carbamate kinase  51.47 
 
 
310 aa  312  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0834  carbamate kinase  51.47 
 
 
310 aa  312  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05980  carbamate kinase  50.8 
 
 
320 aa  312  5.999999999999999e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.38542 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02707  predicted amino acid kinase  51.14 
 
 
310 aa  311  1e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3199  carbamate kinase  51.14 
 
 
310 aa  311  1e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02669  hypothetical protein  51.14 
 
 
310 aa  311  1e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4164  carbamate kinase  50.81 
 
 
310 aa  309  4e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3444  carbamate kinase  51.3 
 
 
312 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.02546  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1665  carbamate kinase  51.79 
 
 
313 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0269  carbamate kinase  51.13 
 
 
318 aa  296  2e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000010285  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12560  carbamate kinase  48.88 
 
 
321 aa  296  2e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2117  carbamate kinase  48.22 
 
 
312 aa  295  6e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.43365  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0485  carbamate kinase  49.36 
 
 
313 aa  294  1e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000618454  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2167  carbamate kinase  46.39 
 
 
318 aa  286  4e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0069  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  45.54 
 
 
313 aa  285  8e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4895  carbamate kinase  46.45 
 
 
320 aa  275  7e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.428226  normal  0.706873 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0475  carbamate kinase  46.45 
 
 
320 aa  275  9e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.331437  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0410  carbamate kinase  46.45 
 
 
320 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00340879 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0344  carbamate kinase  46.45 
 
 
320 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0423  carbamate kinase  46.45 
 
 
320 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03712  Carbamate kinase-like protein yahI  44.41 
 
 
346 aa  272  7e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4199  carbamate kinase  44.09 
 
 
318 aa  271  8.000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169191 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03661  hypothetical protein  44.41 
 
 
366 aa  271  9e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1927  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  46.5 
 
 
312 aa  271  2e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0219816  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0351  carbamate kinase  46.45 
 
 
321 aa  270  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1948  carbamate kinase  46.37 
 
 
314 aa  268  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.572312  hitchhiker  0.000272947 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1788  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  44.73 
 
 
311 aa  266  2.9999999999999995e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2712  carbamate kinase  44.34 
 
 
322 aa  256  4e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2656  carbamate kinase  44.34 
 
 
322 aa  256  4e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.168651  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf130  carbamate kinase  49.35 
 
 
312 aa  251  1e-65  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0039  carbamate kinase  46.96 
 
 
309 aa  250  2e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2318  carbamate kinase  45.05 
 
 
314 aa  246  4e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0247  carbamate kinase  44.59 
 
 
314 aa  246  4e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2848  carbamate kinase  47.28 
 
 
313 aa  244  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.431073  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3101  carbamate kinase  44.12 
 
 
309 aa  238  1e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000494592  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1838  carbamate kinase  43.09 
 
 
301 aa  237  2e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.955077  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1820  carbamate kinase  40.76 
 
 
330 aa  236  5.0000000000000005e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0388  putative carbamate kinase  45.08 
 
 
316 aa  235  6e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.662634 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3283  Carbamate kinase  45.08 
 
 
316 aa  235  7e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3300  putative carbamate kinase  44.76 
 
 
316 aa  235  9e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.777293  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00278  predicted carbamate kinase-like protein  44.76 
 
 
316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00282  hypothetical protein  44.76 
 
 
316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0383  putative carbamate kinase  44.41 
 
 
316 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0353  putative carbamate kinase  44.44 
 
 
316 aa  232  5e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3141  putative carbamate kinase  43.91 
 
 
316 aa  230  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.463314  normal  0.769623 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0341  putative carbamate kinase  44.05 
 
 
316 aa  229  4e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1878  carbamate kinase  40.26 
 
 
316 aa  222  7e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2319  carbamate kinase  42.17 
 
 
314 aa  220  3e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1620  carbamate kinase  42.58 
 
 
298 aa  218  7e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4720  carbamate kinase  40.44 
 
 
310 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.153382 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4813  carbamate kinase  40.44 
 
 
310 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.42996  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4868  carbamate kinase  40.44 
 
 
310 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4750  carbamate kinase  40.13 
 
 
310 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2409  carbamate kinase  44.73 
 
 
301 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2359  carbamate kinase  44.73 
 
 
301 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4849  carbamate kinase  40.44 
 
 
310 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0172  carbamate kinase  41.35 
 
 
307 aa  203  3e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.528941  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0451  carbamate kinase  41.85 
 
 
303 aa  201  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0361431 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0529  carbamate kinase  41.03 
 
 
298 aa  200  3e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0047  carbamate kinase  39.37 
 
 
311 aa  197  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1504  carbamate kinase  38.34 
 
 
323 aa  196  5.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.521984  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6542  Carbamate kinase  41.9 
 
 
314 aa  195  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000567735 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2798  Carbamate kinase  41.67 
 
 
311 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910562  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1145  carbamate kinase  40.58 
 
 
300 aa  192  5e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.986133  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2239  carbamate kinase  42.17 
 
 
305 aa  192  6e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126564  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0182  aspartate/glutamate/uridylate kinase  37.04 
 
 
341 aa  188  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0659  carbamate kinase  40.51 
 
 
298 aa  186  4e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4648  carbamate kinase  37.94 
 
 
302 aa  185  7e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2426  carbamate kinase  39.16 
 
 
318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1875  carbamate kinase  39.42 
 
 
303 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2214  aspartate/glutamate/uridylate kinase  41.69 
 
 
300 aa  179  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.350348  normal  0.825943 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1106  carbamate kinase  39.62 
 
 
308 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0757388  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6441  carbamate kinase  39.23 
 
 
312 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.841619  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1784  Carbamate kinase  39.23 
 
 
301 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00351606  normal  0.0183756 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2487  carbamate kinase  37.3 
 
 
314 aa  176  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.37864  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2963  carbamate kinase  39.42 
 
 
300 aa  176  6e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.558478 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>