71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2722 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2722  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 234 aa  474  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1839  3-dehydroquinate dehydratase, type I  37.72 
 
 		 517 aa  112  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172427  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_409  3-dehydroquinate dehydratase, type I  36.99 
 
 		 222 aa  112  6e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0466  3-dehydroquinate dehydratase, type I  37.19 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.248479  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0443  3-dehydroquinate dehydratase  37.13 
 
 		 222 aa  105  4e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.277554  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0911  chorismate mutase  38.25 
 
 		 294 aa  101  9e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0808  3-dehydroquinate dehydratase, type I  35.81 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.716383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0184  3-dehydroquinate dehydratase  30.04 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.836768  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1279  3-dehydroquinate dehydratase, type I  30.21 
 
 		 218 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.02452  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0639  3-dehydroquinate dehydratase, type I  30.77 
 
 		 218 aa  99  5e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0375735  normal  0.0370197 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2038  chorismate mutase  36.11 
 
 		 295 aa  98.6  8e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1789  3-dehydroquinate dehydratase, type I  35.22 
 
 		 295 aa  97.4  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0551  3-dehydroquinate dehydratase  31.18 
 
 		 223 aa  92  7e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.93599 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0705  3-dehydroquinate dehydratase, type I  27.8 
 
 		 218 aa  87.8  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.555619  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2881  3-dehydroquinate dehydratase  30.92 
 
 		 257 aa  85.5  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1999  3-dehydroquinate dehydratase  30.92 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0132  3-dehydroquinate dehydratase, type I  26.57 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0627989  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39392  predicted protein  30.14 
 
 		 526 aa  81.3  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.541352 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1470  3-dehydroquinate dehydratase  28.99 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.21823  normal  0.0154029 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1985  3-dehydroquinate dehydratase  28.99 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267854 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1814  3-dehydroquinate dehydratase  28.99 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.457788  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1454  3-dehydroquinate dehydratase  28.99 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.287229  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1489  3-dehydroquinate dehydratase  28.99 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.670449  normal  0.0179338 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2023  3-dehydroquinate dehydratase  28.37 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1460  3-dehydroquinate dehydratase, type I  25.71 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000588162  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0922  3-dehydroquinate dehydratase  27.75 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1386  3-dehydroquinate dehydratase  27.43 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0688  3-dehydroquinate dehydratase  30.41 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.952141  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06550  3-dehydroquinate dehydratase, type I  29.49 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0540  3-dehydroquinate dehydratase, type I  30.94 
 
 		 226 aa  72  0.000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1805  3-dehydroquinate dehydratase  23.35 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000149393  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3033  3-dehydroquinate dehydratase  37.31 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12510  3-dehydroquinate dehydratase, type I  26.2 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2125  3-dehydroquinate dehydratase, type I  26.36 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2188  3-dehydroquinate dehydratase  28.7 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1896  3-dehydroquinate dehydratase  28.23 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1815  3-dehydroquinate dehydratase  27.91 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.628603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01651  hypothetical protein  28.23 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01662  3-dehydroquinate dehydratase  28.23 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1938  3-dehydroquinate dehydratase  28.23 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211983 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1774  3-dehydroquinate dehydratase  28.23 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2409  3-dehydroquinate dehydratase  28.23 
 
 		 252 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.607229 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1909  3-dehydroquinate dehydratase  28.23 
 
 		 252 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1949  3-dehydroquinate dehydratase, type I  28.23 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0553359  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1503  3-dehydroquinate dehydratase  28.23 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00191866 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0817  3-dehydroquinate dehydratase  32.96 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0010  3-dehydroquinate dehydratase, type I  26.11 
 
 		 233 aa  65.1  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.406565  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2171  3-dehydroquinate dehydratase  26.11 
 
 		 233 aa  65.1  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.70771  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4110  3-dehydroquinate dehydratase / shikimate dehydrogenase  26.44 
 
 		 613 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.471518  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1379  3-dehydroquinate dehydratase  27.93 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0591105  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3464  3-dehydroquinate dehydratase, type I  29.25 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.239262 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2355  3-dehydroquinate dehydratase, type I  21.79 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.1738899999999994e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1182  3-dehydroquinate dehydratase  31.42 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00820  3-dehydroquinate dehydratase  29.52 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0481  3-dehydroquinate dehydratase  30.17 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10544  pentafunctional AROM polypeptide, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06460)  29.94 
 
 		 688 aa  57  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.572044 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0600  dehydroquinase class I  34.19 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2381  3-dehydroquinate dehydratase  29.41 
 
 		 264 aa  54.7  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0220  3-dehydroquinate dehydratase, type I  26.47 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.26016  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15040  3-dehydroquinate dehydratase, type I  33.63 
 
 		 264 aa  53.5  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0198448  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1652  hypothetical protein  31.95 
 
 		 473 aa  53.1  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00124545 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89141  predicted protein  27.01 
 
 		 1571 aa  52  0.000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1160  3-dehydroquinate dehydratase  28.16 
 
 		 293 aa  51.2  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.26294  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0845  3-dehydroquinate dehydratase  21.9 
 
 		 238 aa  49.3  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.403123  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0828  3-dehydroquinate dehydratase  21.9 
 
 		 238 aa  49.3  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1543  3-dehydroquinate dehydratase-like protein  23.21 
 
 		 485 aa  47.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0773845  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0979  dehydroquinase class I  25.73 
 
 		 256 aa  46.6  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0127705  normal  0.936992 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1640  3-dehydroquinate dehydratase, type 1, putative/shikimate 5-dehydrogenase, putative  27.43 
 
 		 493 aa  46.2  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2806  3-dehydroquinate dehydratase  29.78 
 
 		 300 aa  45.8  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1391  3-dehydroquinate dehydratase, type I  31.86 
 
 		 277 aa  46.2  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1495  3-dehydroquinate dehydratase  27.32 
 
 		 235 aa  41.6  0.01  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.065136 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>