More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0060 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0060  argininosuccinate lyase  100 
 
 		 466 aa  970    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.58938 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  57.46 
 
 		 461 aa  570  1e-161  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  57.62 
 
 		 458 aa  557  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  57.52 
 
 		 458 aa  554  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  57.08 
 
 		 458 aa  553  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  57.3 
 
 		 458 aa  550  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  57.52 
 
 		 458 aa  550  1e-155  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  58.19 
 
 		 458 aa  548  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  57.21 
 
 		 458 aa  546  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  52.22 
 
 		 458 aa  521  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  53.28 
 
 		 459 aa  523  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  54.49 
 
 		 467 aa  519  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  52.81 
 
 		 464 aa  515  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  52.64 
 
 		 456 aa  513  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1123  argininosuccinate lyase ArgH-like protein  52.95 
 
 		 458 aa  514  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168929 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  53.73 
 
 		 466 aa  511  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2490  argininosuccinate lyase  55.93 
 
 		 466 aa  512  1e-144  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  53.95 
 
 		 469 aa  509  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2328  argininosuccinate lyase  54.85 
 
 		 476 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306722  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  52.3 
 
 		 460 aa  504  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0110  argininosuccinate lyase  52.53 
 
 		 462 aa  503  1e-141  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  54.05 
 
 		 467 aa  504  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0275  argininosuccinate lyase  50.22 
 
 		 466 aa  501  1e-140  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  53.48 
 
 		 467 aa  499  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  53.07 
 
 		 468 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  52.63 
 
 		 464 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  52.86 
 
 		 464 aa  497  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  52.76 
 
 		 464 aa  495  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  52.4 
 
 		 464 aa  497  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  52.84 
 
 		 464 aa  496  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  53.07 
 
 		 499 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  52.33 
 
 		 462 aa  495  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  54.2 
 
 		 469 aa  497  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  53.51 
 
 		 468 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  52.86 
 
 		 478 aa  494  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  53.29 
 
 		 468 aa  492  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  52.98 
 
 		 464 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  52.85 
 
 		 464 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  52.49 
 
 		 465 aa  489  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  52.32 
 
 		 464 aa  490  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0684  argininosuccinate lyase  50.33 
 
 		 460 aa  491  1e-137  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.586592  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  53.93 
 
 		 475 aa  491  1e-137  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3741  argininosuccinate lyase  55.51 
 
 		 464 aa  491  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1248  argininosuccinate lyase  51.08 
 
 		 462 aa  490  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000860987  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  52.56 
 
 		 464 aa  488  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  50 
 
 		 457 aa  485  1e-136  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  51.33 
 
 		 462 aa  483  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  50.66 
 
 		 462 aa  481  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  51.33 
 
 		 462 aa  483  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  51.11 
 
 		 463 aa  481  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1433  argininosuccinate lyase  53.36 
 
 		 485 aa  482  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857857  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  51.11 
 
 		 462 aa  481  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  50.88 
 
 		 462 aa  479  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  50.66 
 
 		 462 aa  478  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  50.88 
 
 		 463 aa  479  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  50.66 
 
 		 462 aa  479  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3681  argininosuccinate lyase  53.32 
 
 		 462 aa  479  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  50.88 
 
 		 462 aa  479  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  48.47 
 
 		 461 aa  479  1e-134  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3415  argininosuccinate lyase  51.54 
 
 		 468 aa  481  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  49.56 
 
 		 457 aa  480  1e-134  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  52.21 
 
 		 459 aa  480  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1229  argininosuccinate lyase  52.82 
 
 		 459 aa  478  1e-133  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  48.05 
 
 		 491 aa  475  1e-133  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  50.33 
 
 		 462 aa  477  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0126  argininosuccinate lyase  48.8 
 
 		 459 aa  478  1e-133  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.900188  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  51.02 
 
 		 459 aa  474  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0126  argininosuccinate lyase  51.1 
 
 		 462 aa  473  1e-132  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.013786  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  51.11 
 
 		 467 aa  472  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1219  argininosuccinate lyase  52.13 
 
 		 490 aa  471  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.935194  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5760  argininosuccinate lyase  52.83 
 
 		 469 aa  472  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.298665 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1065  argininosuccinate lyase  52.38 
 
 		 468 aa  473  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0012  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 		 459 aa  471  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.526131  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  51.76 
 
 		 481 aa  473  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0865  argininosuccinate lyase  52.36 
 
 		 489 aa  473  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2476  argininosuccinate lyase  52.83 
 
 		 490 aa  471  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1458  argininosuccinate lyase  50.54 
 
 		 460 aa  474  1e-132  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0718  argininosuccinate lyase  52.13 
 
 		 469 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1067  argininosuccinate lyase  52.13 
 
 		 469 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447898  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1061  argininosuccinate lyase  51.91 
 
 		 469 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2295  argininosuccinate lyase  52.13 
 
 		 469 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  52.5 
 
 		 463 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0864  argininosuccinate lyase  52.13 
 
 		 469 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0238931  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02920  argininosuccinate lyase  50.33 
 
 		 464 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1608  argininosuccinate lyase  52.13 
 
 		 469 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2183  argininosuccinate lyase  52.36 
 
 		 468 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.013453 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2342  argininosuccinate lyase  52.83 
 
 		 469 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146568  normal  0.209916 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1818  argininosuccinate lyase  52.38 
 
 		 469 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2991  argininosuccinate lyase  52.13 
 
 		 469 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1791  argininosuccinate lyase  50.33 
 
 		 461 aa  471  1.0000000000000001e-131  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2429  argininosuccinate lyase  52.38 
 
 		 469 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0655  argininosuccinate lyase  51.42 
 
 		 472 aa  467  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.928445  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2434  argininosuccinate lyase  52.61 
 
 		 469 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3714  argininosuccinate lyase  48.69 
 
 		 462 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.564837 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3660  argininosuccinate lyase  48.69 
 
 		 462 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3312  argininosuccinate lyase  50 
 
 		 486 aa  462  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.401423  normal  0.113313 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2664  argininosuccinate lyase  50 
 
 		 486 aa  462  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1807  argininosuccinate lyase  48.8 
 
 		 461 aa  462  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1169  argininosuccinate lyase  49.02 
 
 		 462 aa  462  1e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0682  argininosuccinate lyase  49.56 
 
 		 466 aa  462  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>