More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2371 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_2371  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 
255 aa  522  1e-147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000018  serine/threonine protein phosphatase  49.03 
 
 
264 aa  247  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  43.55 
 
 
256 aa  188  9e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2086  protein phosphatase 2C domain-containing protein  44.44 
 
 
239 aa  186  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.440717  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1520  putative phosphoprotein phosphatase  41.38 
 
 
241 aa  182  5.0000000000000004e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.101947 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00890  putative phosphoprotein phosphatase  40.77 
 
 
242 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0335578  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3050  protein serine/threonine phosphatase  37.71 
 
 
267 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0477  protein serine/threonine phosphatases  40.95 
 
 
256 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0912  protein serine/threonine phosphatase  39.83 
 
 
276 aa  170  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0146  putative phosphoprotein phosphatase  39.91 
 
 
242 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4004  protein serine/threonine phosphatase  39.66 
 
 
256 aa  168  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467216  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1333  protein serine/threonine phosphatase  37.87 
 
 
270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2562  protein serine/threonine phosphatases  38.33 
 
 
256 aa  163  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144925  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42890  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  38.98 
 
 
242 aa  161  9e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.566256 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2879  protein serine/threonine phosphatase  38.26 
 
 
262 aa  161  9e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0260244 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2423  protein phosphatase 2C-like  40.59 
 
 
259 aa  159  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3602  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  38.56 
 
 
242 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2314  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.28 
 
 
243 aa  159  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109306  hitchhiker  0.0000219679 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0846  protein serine/threonine phosphatase  37.71 
 
 
234 aa  156  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  36.48 
 
 
236 aa  155  8e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5417  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  39.66 
 
 
242 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02467  protein phosphatase  37.18 
 
 
234 aa  150  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0105  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.91 
 
 
242 aa  149  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.895672  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  36.56 
 
 
238 aa  149  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3492  protein phosphatase 2C-like  37.67 
 
 
248 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.492295  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  36.48 
 
 
236 aa  145  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  33.47 
 
 
276 aa  145  5e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  36.78 
 
 
421 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  32.49 
 
 
417 aa  143  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3847  protein serine/threonine phosphatase  34.05 
 
 
239 aa  143  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000749886  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.66 
 
 
247 aa  142  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5576  protein serine/threonine phosphatase  39.08 
 
 
242 aa  142  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.9371 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20950  serine/threonine protein phosphatase, 2C-like protein  34.93 
 
 
293 aa  141  9e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0398622  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  36.86 
 
 
320 aa  141  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3817  protein phosphatase 2C-like protein  37.55 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358114 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2458  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.36 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.469461 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  37 
 
 
395 aa  140  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3136  protein phosphatase 2C domain-containing protein  39.27 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1774  serine/threonine protein phosphatase-like  36.21 
 
 
264 aa  140  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0461354  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1044  protein serine/threonine phosphatase  33.2 
 
 
245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0666  protein serine/threonine phosphatase  35.71 
 
 
241 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.719355  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  34.98 
 
 
245 aa  139  6e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0024  protein serine/threonine phosphatase  39.42 
 
 
567 aa  137  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3360  protein phosphatase 2C-like  35.39 
 
 
274 aa  136  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 
323 aa  136  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324067 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  35.59 
 
 
241 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1292  protein serine/threonine phosphatases  34.73 
 
 
325 aa  135  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4681  protein serine/threonine phosphatase  36.55 
 
 
270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1992  protein phosphatase 2C family protein  33.77 
 
 
239 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4033  protein serine/threonine phosphatase  37.28 
 
 
404 aa  135  9e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3691  serine/threonine phosphatase  34.9 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1325  protein serine/threonine phosphatase  36.6 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235242  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0221  protein serine/threonine phosphatase  32.63 
 
 
252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0158982  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3950  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.95 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0256176 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.62 
 
 
237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1710  protein phosphatase 2C family protein  33.33 
 
 
239 aa  132  5e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  33.04 
 
 
236 aa  132  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0024  protein serine/threonine phosphatases  38.26 
 
 
558 aa  132  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6773  protein serine/threonine phosphatase  33.87 
 
 
254 aa  132  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05930  serine/threonine protein phosphatase  38.68 
 
 
252 aa  131  9e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3749  protein serine/threonine phosphatase  34.51 
 
 
256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00230331  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3832  protein serine/threonine phosphatase  34.51 
 
 
256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140812  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  36 
 
 
452 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3622  protein serine/threonine phosphatase  35.71 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00717219  decreased coverage  0.000139718 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3297  protein serine/threonine phosphatases  35.17 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00780778 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  38.2 
 
 
466 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3942  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.17 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145265  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.53 
 
 
238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  36.36 
 
 
425 aa  129  6e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0927  protein serine/threonine phosphatase  31.84 
 
 
273 aa  129  6e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00103547  hitchhiker  1.35771e-17 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1303  protein phosphatase 2C-like protein  35.04 
 
 
247 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.244984  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1278  protein phosphatase 2C-like protein  35.04 
 
 
247 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  34.19 
 
 
319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  36.44 
 
 
477 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3965  protein serine/threonine phosphatase  34.04 
 
 
244 aa  127  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  33.07 
 
 
597 aa  126  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1324  protein serine/threonine phosphatase  34.02 
 
 
253 aa  127  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21560  serine/threonine protein phosphatase  37.98 
 
 
293 aa  126  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.146725  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3183  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.19 
 
 
274 aa  126  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.07989  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1226  serine/threonine phosphatase  33.76 
 
 
236 aa  126  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  33.2 
 
 
419 aa  126  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  35.74 
 
 
463 aa  125  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2487  protein serine/threonine phosphatase  34.39 
 
 
241 aa  125  6e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00028988  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3382  protein serine/threonine phosphatase  33.19 
 
 
240 aa  125  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  34.31 
 
 
554 aa  124  2e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10018  serine/threonine phosphatase ppp  36.53 
 
 
514 aa  124  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000837689  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  35.06 
 
 
507 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0489  protein serine/threonine phosphatase  35.25 
 
 
285 aa  123  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.650161  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  33.73 
 
 
472 aa  123  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4652  protein serine/threonine phosphatase  27.87 
 
 
361 aa  122  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.195598  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  33.73 
 
 
305 aa  122  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  35.34 
 
 
463 aa  122  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.87 
 
 
611 aa  122  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  31.72 
 
 
416 aa  122  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  34.33 
 
 
252 aa  121  9e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  34.76 
 
 
538 aa  121  9e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1935  protein serine/threonine phosphatase  33.04 
 
 
321 aa  121  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.709495  hitchhiker  0.0000466361 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3671  putative serine/threonine phosphatase  30.54 
 
 
246 aa  121  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3187  protein serine/threonine phosphatase  34.23 
 
 
415 aa  121  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000686686  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1755  protein serine/threonine phosphatase  32.61 
 
 
284 aa  121  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.959742  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>