More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1815 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1815  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  100 
 
 		 323 aa  665    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  50.76 
 
 		 313 aa  335  5e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  53.23 
 
 		 317 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01003  curved DNA-binding protein, DnaJ-like protein that functions as a co-chaperone of DnaK  50.77 
 
 		 306 aa  312  4.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  50.77 
 
 		 306 aa  312  4.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  50.77 
 
 		 306 aa  312  4.999999999999999e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01010  hypothetical protein  50.77 
 
 		 306 aa  312  4.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  50.77 
 
 		 306 aa  312  4.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  50.77 
 
 		 306 aa  312  4.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  50.77 
 
 		 306 aa  311  6.999999999999999e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2124  curved DNA-binding protein CbpA  50.76 
 
 		 306 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.584386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2314  curved DNA-binding protein CbpA  50.46 
 
 		 306 aa  309  4e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4440  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  54.05 
 
 		 314 aa  306  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4897  curved-DNA-binding protein  53.75 
 
 		 314 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1207  curved DNA-binding protein CbpA  48.92 
 
 		 306 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.358657 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1071  curved DNA-binding protein CbpA  48.92 
 
 		 306 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1187  curved DNA-binding protein CbpA  48.92 
 
 		 306 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.227747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1222  curved DNA-binding protein CbpA  48.92 
 
 		 306 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.898218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1176  curved DNA-binding protein CbpA  48.92 
 
 		 306 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.668416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4726  chaperone DnaJ domain-containing protein  51.52 
 
 		 319 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462782 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4848  DnaJ family curved-DNA-binding protein  51.52 
 
 		 319 aa  299  5e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4905  chaperone DnaJ domain-containing protein  51.69 
 
 		 318 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113006 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2100  heat shock protein DnaJ-like  51.68 
 
 		 320 aa  295  9e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3860  curved DNA-binding protein CbpA  50.61 
 
 		 309 aa  293  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.167572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0577  chaperone DnaJ-like  50.31 
 
 		 316 aa  275  6e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.344875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3332  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.49 
 
 		 324 aa  245  6e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870111  normal  0.639314 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  38.84 
 
 		 315 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  40 
 
 		 313 aa  229  5e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  40 
 
 		 341 aa  229  6e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3023  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.3 
 
 		 319 aa  227  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6322  heat shock protein DnaJ domain protein  38.07 
 
 		 313 aa  225  9e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3236  heat shock protein DnaJ domain protein  39.58 
 
 		 320 aa  219  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1039  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.69 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  37.69 
 
 		 324 aa  211  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1727  curved DNA-binding protein  38.62 
 
 		 308 aa  211  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1520  heat shock protein DnaJ-like  38.11 
 
 		 327 aa  211  1e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2406  dnaJ domain-containing protein  39.75 
 
 		 313 aa  209  5e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2189  hypothetical protein  40 
 
 		 296 aa  208  9e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3102  curved DNA-binding protein  41.56 
 
 		 310 aa  208  9e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0177095  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2700  chaperone DnaJ domain protein  41.56 
 
 		 310 aa  208  9e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.062215  hitchhiker  0.0000000117807 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2065  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  37.65 
 
 		 315 aa  208  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2217  hypothetical protein  40 
 
 		 296 aa  206  3e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2130  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.67 
 
 		 323 aa  205  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.192509  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2220  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.08 
 
 		 325 aa  202  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.159655  normal  0.021204 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3019  heat shock protein DnaJ domain protein  37.38 
 
 		 295 aa  202  6e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.493396 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1382  heat shock protein DnaJ-like  39.94 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0185  chaperone DnaJ domain protein  37.42 
 
 		 314 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.522529  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0490  heat shock protein DnaJ-like  37.19 
 
 		 326 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0261  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.63 
 
 		 324 aa  200  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0719528  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6288  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.14 
 
 		 313 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.524726  normal  0.735233 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  40.18 
 
 		 315 aa  199  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  37.05 
 
 		 311 aa  197  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2478  heat shock protein DnaJ domain protein  39.18 
 
 		 304 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.8 
 
 		 315 aa  195  8.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1124  heat shock protein DnaJ domain protein  39.08 
 
 		 326 aa  193  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.405615 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0109  heat shock protein DnaJ domain protein  39.18 
 
 		 297 aa  192  7e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.200595  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.71 
 
 		 324 aa  192  8e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2171  heat shock protein DnaJ-like  34.1 
 
 		 335 aa  190  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1428  heat shock protein DnaJ-like protein  37.5 
 
 		 321 aa  187  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0047  heat shock protein DnaJ-like  35.83 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.940459  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.26 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0453  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.05 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  38.17 
 
 		 307 aa  186  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2621  chaperone DnaJ domain-containing protein  34.92 
 
 		 283 aa  185  7e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.591487 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1171  chaperone DnaJ-like  36.68 
 
 		 304 aa  185  9e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2014  chaperone DnaJ-like  39.32 
 
 		 316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122637  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1856  chaperone DnaJ domain protein  39.7 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000127856  normal  0.0651455 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  37.62 
 
 		 287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  35.21 
 
 		 330 aa  183  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  32.25 
 
 		 375 aa  182  7e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0723  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.42 
 
 		 326 aa  181  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1288  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.65 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479526  normal  0.450004 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1014  chaperone protein DnaJ  33.96 
 
 		 382 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0049  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.04 
 
 		 339 aa  179  5.999999999999999e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  32.97 
 
 		 379 aa  177  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  32.97 
 
 		 379 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.58 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  32.97 
 
 		 379 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2984  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.81 
 
 		 331 aa  176  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0491  dnaJ domain-containing protein  38.62 
 
 		 340 aa  176  6e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0918592  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0918  heat shock protein DnaJ-like  33.13 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.555506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  32.16 
 
 		 376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0426  chaperone DnaJ domain protein  36.73 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.011162 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  32.16 
 
 		 376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  32.16 
 
 		 376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  32.16 
 
 		 376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  32.16 
 
 		 376 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4186  chaperone DnaJ domain protein  32.56 
 
 		 333 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.303766 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  31.89 
 
 		 376 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02638  curved DNA binding protein  36.33 
 
 		 299 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  32.16 
 
 		 376 aa  172  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  32.16 
 
 		 376 aa  172  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  31.89 
 
 		 376 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0039  heat shock protein DnaJ  34.57 
 
 		 332 aa  172  1e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  32.83 
 
 		 326 aa  171  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  32.43 
 
 		 379 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  32.43 
 
 		 379 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  32.43 
 
 		 379 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  32.43 
 
 		 379 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  32.43 
 
 		 379 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>