52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C1250 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A2234  curli production assembly/transport component CsgG  100 
 
 
277 aa  567  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.734266 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2051  curli production assembly/transport component CsgG  100 
 
 
277 aa  567  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.351157  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1205  curli production assembly/transport component CsgG  100 
 
 
277 aa  567  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.749123  normal  0.584294 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1250  curli production assembly/transport component CsgG  100 
 
 
277 aa  567  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.589697 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1235  curli production assembly/transport component CsgG  100 
 
 
277 aa  567  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.562011  normal  0.947173 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1156  curli production assembly/transport subunit CsgG  96.03 
 
 
277 aa  552  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2562  curli production assembly/transport component CsgG  96.03 
 
 
277 aa  552  1e-156  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.25398 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2096  curli production assembly/transport subunit CsgG  96.03 
 
 
277 aa  552  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.832846 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01034  outer membrane lipoprotein  96.03 
 
 
277 aa  552  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.743614  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01041  hypothetical protein  96.03 
 
 
277 aa  552  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.756314  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2608  Curli production assembly/transport component CsgG  96.03 
 
 
277 aa  552  1e-156  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0251589  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1416  curli production assembly/transport subunit CsgG  95.67 
 
 
277 aa  550  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0591449 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1155  curli production assembly/transport subunit CsgG  95.31 
 
 
277 aa  546  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.411032  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1553  curli production assembly/transport component CsgG  92.78 
 
 
277 aa  534  1e-151  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.301914  normal  0.209181 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1729  curli production assembly/transport component CsgG  53.14 
 
 
282 aa  291  1e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.214664  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1820  curli production assembly/transport component CsgG  50.92 
 
 
282 aa  285  7e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0010127  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1520  curli production assembly/transport component CsgG  50.74 
 
 
283 aa  280  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.301126  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2474  curli production assembly/transport component CsgG  51.3 
 
 
283 aa  278  9e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.248627 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2299  curli production assembly/transport component CsgG  53.73 
 
 
283 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2465  curli production assembly/transport component CsgG  52.94 
 
 
283 aa  272  5e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3472  curli production assembly/transport component CsgG  53.73 
 
 
282 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.669591 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1993  curli production assembly/transport component CsgG  49.62 
 
 
286 aa  269  5e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00606032  normal  0.0509044 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01506  putative transport protein for curli synthesis  46.69 
 
 
253 aa  239  3e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2588  curli production assembly/transport component CsgG  43.98 
 
 
312 aa  235  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3253  curli production assembly/transport component CsgG  44.28 
 
 
268 aa  221  1e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2857  curli production assembly/transport component CsgG, putative  44.02 
 
 
261 aa  221  1e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.680035  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0870  curli production assembly/transport component CsgG  43.91 
 
 
268 aa  220  2e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3152  curli production assembly/transport component CsgG  43.91 
 
 
268 aa  219  3e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0643  curli production assembly/transport component CsgG  44.53 
 
 
255 aa  219  4e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0140532  unclonable  1.5798e-08 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0971  curli production assembly/transport component CsgG  42.86 
 
 
265 aa  214  1e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3685  curli production assembly/transport component CsgG, putative  44.09 
 
 
268 aa  214  1e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1038  curli production assembly/transport component CsgG  44.75 
 
 
268 aa  213  2e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.766979 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1005  curli production assembly/transport component CsgG  47.09 
 
 
268 aa  212  6e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3334  curli production assembly/transport component CsgG  47.09 
 
 
268 aa  212  6e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1026  Curli production assembly/transport component CsgG  47.09 
 
 
268 aa  212  6e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2351  curli production assembly/transport component CsgG  41.7 
 
 
454 aa  208  6e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2984  curli production assembly/transport component CsgG  46.19 
 
 
268 aa  208  7e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4730  Curli production assembly/transport component CsgG  39.71 
 
 
478 aa  194  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.509697 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2419  curli production assembly/transport component CsgG  38.11 
 
 
308 aa  176  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.139852 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6061  Curli production assembly/transport component CsgG  42.13 
 
 
476 aa  172  6e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0030  Curli production assembly/transport component CsgG  36.9 
 
 
307 aa  169  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.133065 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2732  putative curli production assembly/transport component csgg precursor  35.34 
 
 
313 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3754  Curli production assembly/transport component CsgG  36.13 
 
 
291 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.845428  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1276  curli production assembly/transport component CsgG  36.44 
 
 
313 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1066  curli production assembly/transport component CsgG  30.29 
 
 
271 aa  72  9e-12  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6349  Putative protein involved in formation of curli polymers-like protein  26.17 
 
 
467 aa  60.1  4e-08  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2651  HfaB protein  26.61 
 
 
342 aa  57  4e-07  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2748  HfaB protein  26.42 
 
 
287 aa  54.3  2e-06  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.941879  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1105  Curli production assembly/transport component CsgG  28.96 
 
 
239 aa  48.1  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  1.29155e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1518  Curli production assembly/transport component CsgG  30.77 
 
 
209 aa  44.3  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  2.84024e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15901  hypothetical protein  26.96 
 
 
275 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5339  CsgG family protein  25.21 
 
 
224 aa  42.7  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>