More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0084 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0084  ribosomal protein L20  100 
 
 		 117 aa  233  8e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000355513  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1840  50S ribosomal protein L20  86.32 
 
 		 118 aa  206  8e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0347  50S ribosomal protein L20  83.76 
 
 		 118 aa  201  2e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0494  50S ribosomal protein L20  80.34 
 
 		 117 aa  198  3e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0242  50S ribosomal protein L20  85.29 
 
 		 117 aa  182  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0113  50S ribosomal protein L20  81.2 
 
 		 117 aa  180  6e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0295  50S ribosomal protein L20  87.25 
 
 		 117 aa  161  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0035  50S ribosomal protein L20  87.25 
 
 		 117 aa  161  2.0000000000000002e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0270  50S ribosomal protein L20  87.25 
 
 		 117 aa  161  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0207  50S ribosomal protein L20  78.95 
 
 		 118 aa  160  6e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1223  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 117 aa  148  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000332435  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15180  LSU ribosomal protein L20P  57.26 
 
 		 117 aa  147  5e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00260509  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1821  LSU ribosomal protein L20P  58.12 
 
 		 117 aa  145  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00014178  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2170  ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 121 aa  142  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00052538  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1381  ribosomal protein L20  56.41 
 
 		 120 aa  142  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000161333  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3478  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800064  hitchhiker  0.00881726 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1970  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  hitchhiker  0.00701004 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0574  50S ribosomal protein L20  59.48 
 
 		 119 aa  142  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3222  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0366  50S ribosomal protein L20P  55.56 
 
 		 117 aa  142  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000702723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2029  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 119 aa  141  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000108915  hitchhiker  0.0000236508 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2058  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 117 aa  140  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.524551  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 		 118 aa  140  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2317  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 118 aa  140  6e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000405852  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  58.62 
 
 		 117 aa  140  7e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20450  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 		 118 aa  140  8e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.834025  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 118 aa  139  9e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 119 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000359041  normal  0.016896 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0674  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 		 133 aa  139  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28680  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000531022 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1615  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000423443  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2305  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 117 aa  139  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00881657  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2507  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2015  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000132248  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2302  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2219  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521277  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2151  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000337835  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2187  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144083  normal  0.0378081 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2327  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000174207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1708  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547661  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1958  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000262165  normal  0.497021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2018  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000148558  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2025  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 119 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.240457  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1313  50S ribosomal protein L20  57.76 
 
 		 117 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000242462  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2046  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000387614  hitchhiker  0.00333012 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01386  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 119 aa  138  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2260  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 119 aa  137  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000555159  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1768  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 119 aa  138  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000021709  normal  0.0190948 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2802  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 119 aa  137  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2488  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 		 119 aa  137  6e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000082554  hitchhiker  0.0000796215 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1756  50S ribosomal protein L20  55.56 
 
 		 121 aa  137  6e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000228708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0046  ribosomal protein L20  58.04 
 
 		 117 aa  136  7e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1242  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 		 118 aa  137  7e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000191981  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1997  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 		 118 aa  136  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00229305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2300  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 		 118 aa  136  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000821818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2398  ribosomal protein L20  52.14 
 
 		 118 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0041866  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2658  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000886061  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0765  50S ribosomal protein L20P  53.85 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9715  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1253  ribosomal protein L20  56.03 
 
 		 116 aa  135  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.78638  normal  0.232233 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003713  LSU ribosomal protein L20p  57.26 
 
 		 117 aa  134  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000104464  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02082  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 117 aa  134  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05610  ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 119 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312556  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4404  50S ribosomal protein L20  54.39 
 
 		 118 aa  134  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1414  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 		 117 aa  134  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000403686  normal  0.489901 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1608  50S ribosomal protein L20  52.99 
 
 		 121 aa  134  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.248279  normal  0.0149786 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4704  50S ribosomal protein L20  54.39 
 
 		 118 aa  134  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000111354  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4469  50S ribosomal protein L20  54.39 
 
 		 118 aa  134  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4304  50S ribosomal protein L20  54.39 
 
 		 118 aa  134  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.71931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4315  50S ribosomal protein L20  54.39 
 
 		 118 aa  134  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000569694  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1770  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 		 118 aa  134  5e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000104745  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4817  50S ribosomal protein L20  54.39 
 
 		 118 aa  134  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000468944  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1580  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 		 119 aa  134  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4697  50S ribosomal protein L20  54.39 
 
 		 118 aa  134  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443116  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1736  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 		 118 aa  134  5e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000116439  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0556  50S ribosomal protein L20  54.39 
 
 		 118 aa  134  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000506915  hitchhiker  1.2511e-24 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4688  50S ribosomal protein L20  54.39 
 
 		 118 aa  134  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.35886e-62 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2096  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 		 119 aa  134  5e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4681  50S ribosomal protein L20  54.39 
 
 		 118 aa  134  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000654651  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1518  50S ribosomal protein L20  56.52 
 
 		 117 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0150794  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2017  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 		 119 aa  134  6.0000000000000005e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2594  ribosomal protein L20  54.7 
 
 		 118 aa  134  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649926  hitchhiker  0.00570674 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1206  50S ribosomal protein L20  58.93 
 
 		 119 aa  134  6.0000000000000005e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3259  50S ribosomal protein L20  53.85 
 
 		 118 aa  133  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000143022  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1628  50S ribosomal protein L20  52.14 
 
 		 121 aa  133  9e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0736554  hitchhiker  0.00508977 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2753  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 119 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0178087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1872  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 		 117 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000476313  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1374  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 119 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.107797  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1362  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 119 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0800  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 		 119 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1402  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 119 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1893  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292968  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0219  ribosomal protein L20  51.28 
 
 		 118 aa  131  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0939  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748381  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0451  50S ribosomal protein L20  52.1 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1555  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>