90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0241 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_0235  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  354  4e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0235  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  354  4e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0241  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  354  4e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  decreased coverage  1.09722e-05 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0238  hypothetical protein  98.82 
 
 
170 aa  351  3e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0345  hypothetical protein  97.65 
 
 
170 aa  349  1e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0238  hypothetical protein  87.65 
 
 
170 aa  318  3e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  5.56975e-08 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3783  hypothetical protein  87.65 
 
 
170 aa  317  4e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0239  hypothetical protein  87.06 
 
 
170 aa  317  4e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.43934e-09 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4492  hypothetical protein  87.06 
 
 
170 aa  316  1e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0562  hypothetical protein  81.18 
 
 
173 aa  296  1e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1896  hypothetical protein  77.06 
 
 
170 aa  279  1e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1303  hypothetical protein  48.19 
 
 
167 aa  150  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.412045  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3410  hypothetical protein  46.11 
 
 
169 aa  143  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1821  hypothetical protein  47.88 
 
 
169 aa  142  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311509  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02104  hypothetical protein  46.67 
 
 
170 aa  141  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.32134 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3710  hypothetical protein  43.71 
 
 
169 aa  137  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.617797  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4185  hypothetical protein  44.17 
 
 
165 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436089  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0923  hypothetical protein  46.67 
 
 
169 aa  135  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470025  normal  0.52192 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0858  hypothetical protein  46.67 
 
 
169 aa  134  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.293474 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4974  hypothetical protein  42.26 
 
 
169 aa  134  6e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0847  hypothetical protein  44.24 
 
 
168 aa  133  9e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1303  hypothetical protein  43.71 
 
 
169 aa  131  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.652966  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2420  hypothetical protein  43.03 
 
 
169 aa  131  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.384209  normal  0.715571 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2687  hypothetical protein  43.03 
 
 
187 aa  130  8e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3857  hypothetical protein  41.72 
 
 
165 aa  129  2e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.512206  normal  0.250482 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00670  hypothetical protein  44.24 
 
 
168 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2989  hypothetical protein  42.42 
 
 
167 aa  128  4e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.394828  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1369  hypothetical protein  43.98 
 
 
167 aa  126  1e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0055  hypothetical protein  43.64 
 
 
168 aa  127  1e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626392  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1570  hypothetical protein  44.31 
 
 
170 aa  126  2e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1532  hypothetical protein  41.82 
 
 
169 aa  124  9e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189027  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5053  helix-turn-helix domain-containing protein  42.68 
 
 
168 aa  123  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.776949 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1995  hypothetical protein  40.36 
 
 
169 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.938278  normal  0.0127211 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2000  hypothetical protein  42.95 
 
 
173 aa  123  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.79085e-07 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1903  hypothetical protein  40.96 
 
 
169 aa  123  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.522183 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4777  hypothetical protein  41.57 
 
 
169 aa  122  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00674885  hitchhiker  0.00133084 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1091  hypothetical protein  41.82 
 
 
196 aa  122  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2424  hypothetical protein  41.57 
 
 
168 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5006  hypothetical protein  43.03 
 
 
168 aa  121  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1287  hypothetical protein  40.61 
 
 
168 aa  121  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2016  hypothetical protein  40.61 
 
 
168 aa  121  6e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2441  hypothetical protein  40.61 
 
 
168 aa  121  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.263602  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3295  hypothetical protein  40.61 
 
 
168 aa  121  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.331848  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1518  hypothetical protein  40.61 
 
 
168 aa  121  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2540  hypothetical protein  40.61 
 
 
168 aa  121  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.228229  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3357  hypothetical protein  40.24 
 
 
168 aa  120  8e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.844459 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2439  hypothetical protein  42.07 
 
 
171 aa  120  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0479  hypothetical protein  40.61 
 
 
172 aa  119  2e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0958  hypothetical protein  40.61 
 
 
172 aa  119  2e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4059  hypothetical protein  42.17 
 
 
172 aa  119  2e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0828  hypothetical protein  40.61 
 
 
172 aa  118  5e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0920  hypothetical protein  40 
 
 
172 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.617627  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2397  hypothetical protein  40 
 
 
168 aa  117  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1850  hypothetical protein  41.57 
 
 
168 aa  117  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.095787  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0819  hypothetical protein  40 
 
 
172 aa  115  2e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0061  hypothetical protein  40 
 
 
168 aa  115  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2808  hypothetical protein  39.76 
 
 
183 aa  110  1e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2185  hypothetical protein  40.24 
 
 
179 aa  109  2e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.27954 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0614  hypothetical protein  40.96 
 
 
170 aa  108  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0979  hypothetical protein  40 
 
 
170 aa  106  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.556138 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5253  hypothetical protein  35.54 
 
 
186 aa  102  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415649  normal  0.0494269 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2170  hypothetical protein  35.84 
 
 
172 aa  92.4  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1986  hypothetical protein  35.12 
 
 
178 aa  87.8  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000813375  normal  0.0326161 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4810  hypothetical protein  35.59 
 
 
211 aa  87  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1579  hypothetical protein  32.95 
 
 
403 aa  85.5  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360622  normal  0.0697544 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1636  hypothetical protein  32.57 
 
 
190 aa  81.6  5e-15  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.722246  normal  0.0779232 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1182  hypothetical protein  32.57 
 
 
228 aa  81.3  6e-15  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1662  hypothetical protein  32.57 
 
 
228 aa  81.3  6e-15  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1561  hypothetical protein  32.37 
 
 
190 aa  78.2  5e-14  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06423  conserved hypothetical protein  36.31 
 
 
173 aa  78.2  5e-14  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0269408  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1580  hypothetical protein  32.57 
 
 
190 aa  75.5  3e-13  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.967848  normal  0.206881 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2420  hypothetical protein  30.29 
 
 
191 aa  72.8  2e-12  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0537843  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1924  hypothetical protein  31.82 
 
 
191 aa  71.2  7e-12  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1938  hypothetical protein  31.82 
 
 
191 aa  71.2  7e-12  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.411142  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1627  hypothetical protein  31.82 
 
 
191 aa  70.9  8e-12  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.474473  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2084  hypothetical protein  31.82 
 
 
267 aa  70.9  9e-12  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111552  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0290  hypothetical protein  31.82 
 
 
255 aa  70.5  1e-11  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0025701  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1184  hypothetical protein  31.82 
 
 
255 aa  70.5  1e-11  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11176  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0871  hypothetical protein  31.82 
 
 
255 aa  70.5  1e-11  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0668164  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4217  hypothetical protein  33.52 
 
 
189 aa  68.2  5e-11  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221932  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3817  hypothetical protein  31.06 
 
 
174 aa  62.4  3e-09  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3867  hypothetical protein  31.06 
 
 
174 aa  62.4  3e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2884  hypothetical protein  30 
 
 
170 aa  60.1  1e-08  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3056  hypothetical protein  26.29 
 
 
173 aa  57  1e-07  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.020297  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3797  hypothetical protein  24.59 
 
 
174 aa  55.5  4e-07  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288116  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0579  hypothetical protein  26.47 
 
 
166 aa  49.7  2e-05  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0345367 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1217  hypothetical protein  42.86 
 
 
174 aa  44.7  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304346  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0681  hypothetical protein  26.76 
 
 
152 aa  44.3  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3021  hypothetical protein  24.46 
 
 
175 aa  44.3  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2060  hypothetical protein  32.65 
 
 
191 aa  42  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>