86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2084 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2084  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  530  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111552  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0871  hypothetical protein  85.43 
 
 
255 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0668164  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0290  hypothetical protein  85.43 
 
 
255 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0025701  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1184  hypothetical protein  85.43 
 
 
255 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11176  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1627  hypothetical protein  99.48 
 
 
191 aa  381  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.474473  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1938  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.411142  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1924  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168146  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2420  hypothetical protein  92.67 
 
 
191 aa  361  8e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0537843  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1182  hypothetical protein  69.95 
 
 
228 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1662  hypothetical protein  69.95 
 
 
228 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1579  hypothetical protein  69.27 
 
 
403 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360622  normal  0.0697544 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1580  hypothetical protein  69.31 
 
 
190 aa  268  7e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.967848  normal  0.206881 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1636  hypothetical protein  70.37 
 
 
190 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.722246  normal  0.0779232 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1561  hypothetical protein  69.31 
 
 
190 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4810  hypothetical protein  66.84 
 
 
211 aa  264  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4217  hypothetical protein  55.32 
 
 
189 aa  182  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221932  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2185  hypothetical protein  52.91 
 
 
179 aa  172  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.27954 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1986  hypothetical protein  49.18 
 
 
178 aa  156  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000813375  normal  0.0326161 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1821  hypothetical protein  39.29 
 
 
169 aa  115  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311509  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02104  hypothetical protein  36.63 
 
 
170 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.32134 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1850  hypothetical protein  39.05 
 
 
168 aa  99  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.095787  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0979  hypothetical protein  34.3 
 
 
170 aa  98.6  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.556138 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3410  hypothetical protein  36.09 
 
 
169 aa  96.3  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2397  hypothetical protein  36.93 
 
 
168 aa  95.9  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3295  hypothetical protein  36.93 
 
 
168 aa  95.5  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.331848  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2540  hypothetical protein  36.93 
 
 
168 aa  95.5  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.228229  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2016  hypothetical protein  36.93 
 
 
168 aa  95.5  8e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2441  hypothetical protein  36.93 
 
 
168 aa  95.5  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.263602  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1518  hypothetical protein  36.93 
 
 
168 aa  95.5  8e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1287  hypothetical protein  36.93 
 
 
168 aa  95.5  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3357  hypothetical protein  35.5 
 
 
168 aa  94  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.844459 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1303  hypothetical protein  36.9 
 
 
169 aa  94.4  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.652966  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2884  hypothetical protein  36.69 
 
 
170 aa  90.5  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2989  hypothetical protein  35.33 
 
 
167 aa  90.9  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.394828  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0923  hypothetical protein  37.21 
 
 
169 aa  90.1  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470025  normal  0.52192 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0858  hypothetical protein  36.63 
 
 
169 aa  89  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.293474 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3857  hypothetical protein  34.12 
 
 
165 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.512206  normal  0.250482 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1303  hypothetical protein  29.76 
 
 
167 aa  86.7  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.412045  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1570  hypothetical protein  34.1 
 
 
170 aa  85.5  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3710  hypothetical protein  32.75 
 
 
169 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.617797  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0055  hypothetical protein  37.87 
 
 
168 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626392  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4974  hypothetical protein  33.33 
 
 
169 aa  84.7  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2687  hypothetical protein  31.58 
 
 
187 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5006  hypothetical protein  35.5 
 
 
168 aa  84.3  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2000  hypothetical protein  33.33 
 
 
173 aa  84.3  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000379085 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1091  hypothetical protein  32.93 
 
 
196 aa  84  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0614  hypothetical protein  34.91 
 
 
170 aa  83.6  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00670  hypothetical protein  37.28 
 
 
168 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0061  hypothetical protein  32.94 
 
 
168 aa  82.8  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2808  hypothetical protein  35.91 
 
 
183 aa  82.4  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4777  hypothetical protein  33.92 
 
 
169 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00674885  hitchhiker  0.00133084 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4185  hypothetical protein  33.53 
 
 
165 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436089  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1903  hypothetical protein  32.74 
 
 
169 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.522183 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2420  hypothetical protein  32.37 
 
 
169 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.384209  normal  0.715571 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2424  hypothetical protein  32.02 
 
 
168 aa  81.3  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0847  hypothetical protein  29.41 
 
 
168 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1369  hypothetical protein  33.71 
 
 
167 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0562  hypothetical protein  32.02 
 
 
173 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1995  hypothetical protein  31.95 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.938278  normal  0.0127211 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5253  hypothetical protein  30.9 
 
 
186 aa  75.5  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415649  normal  0.0494269 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1896  hypothetical protein  33.15 
 
 
170 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3797  hypothetical protein  32.02 
 
 
174 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288116  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3056  hypothetical protein  29.94 
 
 
173 aa  73.9  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.020297  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0819  hypothetical protein  30.18 
 
 
172 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0828  hypothetical protein  30.18 
 
 
172 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0241  hypothetical protein  31.82 
 
 
170 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000109722 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0235  hypothetical protein  31.82 
 
 
170 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0235  hypothetical protein  31.82 
 
 
170 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0238  hypothetical protein  31.25 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0238  hypothetical protein  31.76 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0345  hypothetical protein  30.29 
 
 
170 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0958  hypothetical protein  30.18 
 
 
172 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0479  hypothetical protein  30.18 
 
 
172 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0920  hypothetical protein  29.59 
 
 
172 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.617627  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2439  hypothetical protein  30.18 
 
 
171 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3783  hypothetical protein  31.18 
 
 
170 aa  67  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4492  hypothetical protein  31.18 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0239  hypothetical protein  30.59 
 
 
170 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000143934 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5053  helix-turn-helix domain-containing protein  28.99 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.776949 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3817  hypothetical protein  26.59 
 
 
174 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3867  hypothetical protein  26.59 
 
 
174 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1532  hypothetical protein  29.71 
 
 
169 aa  64.7  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189027  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4059  hypothetical protein  29.17 
 
 
172 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06423  conserved hypothetical protein  31.21 
 
 
173 aa  58.9  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0269408  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2170  hypothetical protein  29.45 
 
 
172 aa  50.8  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1217  hypothetical protein  22.49 
 
 
174 aa  45.8  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>