82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0579 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0579  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  344  3e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0345367 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3021  hypothetical protein  43.88 
 
 		 175 aa  130  9e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0979  hypothetical protein  32.91 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.556138 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2989  hypothetical protein  32.91 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.394828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1903  hypothetical protein  31.9 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.522183 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1091  hypothetical protein  31.65 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1570  hypothetical protein  32.47 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0958  hypothetical protein  33.33 
 
 		 172 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0819  hypothetical protein  34.57 
 
 		 172 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0061  hypothetical protein  31.2 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0479  hypothetical protein  33.33 
 
 		 172 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4185  hypothetical protein  32.5 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2439  hypothetical protein  33.33 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5006  hypothetical protein  31.87 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0920  hypothetical protein  32.72 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.617627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0828  hypothetical protein  34.57 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3857  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.512206  normal  0.250482 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1369  hypothetical protein  33.85 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3410  hypothetical protein  28.83 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0055  hypothetical protein  32 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626392  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2424  hypothetical protein  30.4 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3357  hypothetical protein  31.25 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.844459 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2808  hypothetical protein  32.06 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4777  hypothetical protein  32.1 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00674885  hitchhiker  0.00133084 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4059  hypothetical protein  32.1 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1821  hypothetical protein  33.12 
 
 		 169 aa  67.4  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00670  hypothetical protein  31.2 
 
 		 168 aa  67.4  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3295  hypothetical protein  30.72 
 
 		 168 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.331848  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2540  hypothetical protein  30.72 
 
 		 168 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.228229  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2000  hypothetical protein  31.45 
 
 		 173 aa  67  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000379085 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2397  hypothetical protein  30.72 
 
 		 168 aa  67  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1518  hypothetical protein  30.72 
 
 		 168 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1995  hypothetical protein  31.48 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.938278  normal  0.0127211 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2441  hypothetical protein  30.72 
 
 		 168 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.263602  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2016  hypothetical protein  30.72 
 
 		 168 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1287  hypothetical protein  30.72 
 
 		 168 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3710  hypothetical protein  28.92 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.617797  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1303  hypothetical protein  28.57 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.652966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2420  hypothetical protein  28.48 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.384209  normal  0.715571 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5053  helix-turn-helix domain-containing protein  32.7 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.776949 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1303  hypothetical protein  33.11 
 
 		 167 aa  63.9  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.412045  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2687  hypothetical protein  27.67 
 
 		 187 aa  63.9  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1986  hypothetical protein  33.08 
 
 		 178 aa  63.9  0.0000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000813375  normal  0.0326161 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4974  hypothetical protein  28.48 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1850  hypothetical protein  30.72 
 
 		 168 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.095787  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0681  hypothetical protein  30.13 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1532  hypothetical protein  29.41 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0614  hypothetical protein  31.14 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2185  hypothetical protein  30.07 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27954 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0562  hypothetical protein  28.26 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2170  hypothetical protein  33.06 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02104  hypothetical protein  25.2 
 
 		 170 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.32134 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0847  hypothetical protein  29.11 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2884  hypothetical protein  30.38 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06423  conserved hypothetical protein  30.52 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0269408  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4492  hypothetical protein  27.74 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0239  hypothetical protein  27.74 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000143934 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5253  hypothetical protein  25.19 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415649  normal  0.0494269 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0238  hypothetical protein  27.1 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3867  hypothetical protein  25.97 
 
 		 174 aa  53.9  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3817  hypothetical protein  25.97 
 
 		 174 aa  53.9  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0923  hypothetical protein  25.2 
 
 		 169 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470025  normal  0.52192 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0858  hypothetical protein  25.2 
 
 		 169 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.293474 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3783  hypothetical protein  27.1 
 
 		 170 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0235  hypothetical protein  26.47 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0345  hypothetical protein  26.47 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0235  hypothetical protein  26.47 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0238  hypothetical protein  26.47 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0241  hypothetical protein  26.47 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000109722 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3797  hypothetical protein  26.81 
 
 		 174 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1896  hypothetical protein  26.98 
 
 		 170 aa  48.1  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4810  hypothetical protein  28.37 
 
 		 211 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3056  hypothetical protein  27.34 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.020297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1636  hypothetical protein  29.86 
 
 		 190 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.722246  normal  0.0779232 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1579  hypothetical protein  30.94 
 
 		 403 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360622  normal  0.0697544 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1580  hypothetical protein  27.66 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.967848  normal  0.206881 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1662  hypothetical protein  29.17 
 
 		 228 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1182  hypothetical protein  29.17 
 
 		 228 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1217  hypothetical protein  26.12 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304346  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4217  hypothetical protein  48.65 
 
 		 189 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1561  hypothetical protein  29.08 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2420  hypothetical protein  30.22 
 
 		 191 aa  41.2  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0537843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>