89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3783 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3783  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  353  5e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0238  hypothetical protein  98.82 
 
 
170 aa  350  5e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0239  hypothetical protein  97.65 
 
 
170 aa  349  1e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000143934 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4492  hypothetical protein  95.29 
 
 
170 aa  343  8.999999999999999e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0235  hypothetical protein  87.65 
 
 
170 aa  317  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0345  hypothetical protein  87.06 
 
 
170 aa  317  3.9999999999999996e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0238  hypothetical protein  87.65 
 
 
170 aa  317  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0235  hypothetical protein  87.65 
 
 
170 aa  317  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0241  hypothetical protein  87.65 
 
 
170 aa  317  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000109722 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0562  hypothetical protein  81.18 
 
 
173 aa  297  6e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1896  hypothetical protein  74.12 
 
 
170 aa  269  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1303  hypothetical protein  47.88 
 
 
167 aa  149  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.412045  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02104  hypothetical protein  46.67 
 
 
170 aa  144  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.32134 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0923  hypothetical protein  47.27 
 
 
169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470025  normal  0.52192 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0858  hypothetical protein  47.27 
 
 
169 aa  138  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.293474 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1821  hypothetical protein  48.72 
 
 
169 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311509  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3410  hypothetical protein  45.28 
 
 
169 aa  134  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0847  hypothetical protein  43.64 
 
 
168 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00670  hypothetical protein  45.73 
 
 
168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3857  hypothetical protein  42.33 
 
 
165 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.512206  normal  0.250482 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1903  hypothetical protein  43.71 
 
 
169 aa  128  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.522183 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1091  hypothetical protein  43.64 
 
 
196 aa  128  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2989  hypothetical protein  43.03 
 
 
167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.394828  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1303  hypothetical protein  44.65 
 
 
169 aa  127  6e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.652966  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0055  hypothetical protein  45.12 
 
 
168 aa  127  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626392  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4185  hypothetical protein  42.33 
 
 
165 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436089  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1369  hypothetical protein  45.45 
 
 
167 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3710  hypothetical protein  41.82 
 
 
169 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.617797  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2687  hypothetical protein  40.61 
 
 
187 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3357  hypothetical protein  42.68 
 
 
168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.844459 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2420  hypothetical protein  40.61 
 
 
169 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.384209  normal  0.715571 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2000  hypothetical protein  45.86 
 
 
173 aa  124  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000379085 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5053  helix-turn-helix domain-containing protein  45.45 
 
 
168 aa  124  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.776949 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4974  hypothetical protein  40.12 
 
 
169 aa  123  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1570  hypothetical protein  44.31 
 
 
170 aa  121  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5006  hypothetical protein  45.51 
 
 
168 aa  121  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4777  hypothetical protein  44.16 
 
 
169 aa  120  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00674885  hitchhiker  0.00133084 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1995  hypothetical protein  42.21 
 
 
169 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.938278  normal  0.0127211 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2424  hypothetical protein  41.32 
 
 
168 aa  119  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2439  hypothetical protein  43.51 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0958  hypothetical protein  42.86 
 
 
172 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0479  hypothetical protein  42.86 
 
 
172 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0828  hypothetical protein  42.86 
 
 
172 aa  117  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1518  hypothetical protein  40.85 
 
 
168 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1287  hypothetical protein  40.85 
 
 
168 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2441  hypothetical protein  40.85 
 
 
168 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.263602  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3295  hypothetical protein  40.85 
 
 
168 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.331848  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2016  hypothetical protein  40.85 
 
 
168 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2540  hypothetical protein  40.85 
 
 
168 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.228229  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0920  hypothetical protein  42.21 
 
 
172 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.617627  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1532  hypothetical protein  39.63 
 
 
169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189027  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1850  hypothetical protein  43.03 
 
 
168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.095787  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0061  hypothetical protein  40.61 
 
 
168 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0819  hypothetical protein  42.21 
 
 
172 aa  114  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2397  hypothetical protein  40.24 
 
 
168 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4059  hypothetical protein  43.23 
 
 
172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5253  hypothetical protein  39.76 
 
 
186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415649  normal  0.0494269 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2185  hypothetical protein  39.02 
 
 
179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.27954 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0979  hypothetical protein  39.62 
 
 
170 aa  106  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.556138 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0614  hypothetical protein  39.76 
 
 
170 aa  103  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2808  hypothetical protein  39.16 
 
 
183 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2170  hypothetical protein  35.71 
 
 
172 aa  92.8  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1986  hypothetical protein  33.93 
 
 
178 aa  82  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000813375  normal  0.0326161 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1579  hypothetical protein  31.52 
 
 
403 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360622  normal  0.0697544 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06423  conserved hypothetical protein  36.97 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0269408  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4810  hypothetical protein  33.14 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1662  hypothetical protein  30.3 
 
 
228 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1636  hypothetical protein  30.3 
 
 
190 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.722246  normal  0.0779232 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1182  hypothetical protein  30.3 
 
 
228 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2420  hypothetical protein  30 
 
 
191 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0537843  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2884  hypothetical protein  33.85 
 
 
170 aa  70.5  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1627  hypothetical protein  31.18 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.474473  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1561  hypothetical protein  29.7 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1938  hypothetical protein  31.18 
 
 
191 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.411142  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1924  hypothetical protein  31.18 
 
 
191 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168146  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2084  hypothetical protein  31.18 
 
 
267 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111552  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0871  hypothetical protein  31.18 
 
 
255 aa  67  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0668164  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1184  hypothetical protein  31.18 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11176  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0290  hypothetical protein  31.18 
 
 
255 aa  67  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0025701  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1580  hypothetical protein  29.94 
 
 
190 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.967848  normal  0.206881 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4217  hypothetical protein  32.84 
 
 
189 aa  62  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221932  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3817  hypothetical protein  30.38 
 
 
174 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3867  hypothetical protein  30.38 
 
 
174 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0579  hypothetical protein  27.1 
 
 
166 aa  53.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0345367 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3797  hypothetical protein  25.41 
 
 
174 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288116  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3056  hypothetical protein  46.67 
 
 
173 aa  51.6  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.020297  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3021  hypothetical protein  27.34 
 
 
175 aa  49.7  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1217  hypothetical protein  26.16 
 
 
174 aa  43.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304346  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0681  hypothetical protein  27.08 
 
 
152 aa  41.2  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>