90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1570 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_1570  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  349  8.999999999999999e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1850  hypothetical protein  84.34 
 
 
168 aa  295  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.095787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3295  hypothetical protein  71.26 
 
 
168 aa  251  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.331848  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2016  hypothetical protein  71.26 
 
 
168 aa  251  3e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2441  hypothetical protein  71.26 
 
 
168 aa  251  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.263602  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1518  hypothetical protein  71.26 
 
 
168 aa  251  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1287  hypothetical protein  71.26 
 
 
168 aa  251  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2540  hypothetical protein  71.26 
 
 
168 aa  251  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.228229  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2397  hypothetical protein  70.66 
 
 
168 aa  248  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0979  hypothetical protein  60.84 
 
 
170 aa  217  5e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.556138 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5053  helix-turn-helix domain-containing protein  60.71 
 
 
168 aa  214  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.776949 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0828  hypothetical protein  59.88 
 
 
172 aa  207  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0819  hypothetical protein  59.88 
 
 
172 aa  207  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0920  hypothetical protein  59.64 
 
 
172 aa  205  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.617627  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0479  hypothetical protein  59.28 
 
 
172 aa  205  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0958  hypothetical protein  59.28 
 
 
172 aa  205  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2439  hypothetical protein  59.04 
 
 
171 aa  204  5e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4777  hypothetical protein  59.28 
 
 
169 aa  202  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00674885  hitchhiker  0.00133084 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4059  hypothetical protein  58.08 
 
 
172 aa  202  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0055  hypothetical protein  62.28 
 
 
168 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626392  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1995  hypothetical protein  56.89 
 
 
169 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.938278  normal  0.0127211 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00670  hypothetical protein  61.68 
 
 
168 aa  198  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2424  hypothetical protein  57.23 
 
 
168 aa  189  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3357  hypothetical protein  56.02 
 
 
168 aa  186  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.844459 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0061  hypothetical protein  54.82 
 
 
168 aa  186  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1303  hypothetical protein  50.9 
 
 
167 aa  184  4e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.412045  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1903  hypothetical protein  53.29 
 
 
169 aa  181  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.522183 
 
 
-
 
NC_003296  RS02104  hypothetical protein  53.94 
 
 
170 aa  179  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.32134 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0847  hypothetical protein  50 
 
 
168 aa  176  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0923  hypothetical protein  56.36 
 
 
169 aa  169  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470025  normal  0.52192 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0858  hypothetical protein  56.36 
 
 
169 aa  169  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.293474 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2687  hypothetical protein  50.3 
 
 
187 aa  164  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3857  hypothetical protein  50.6 
 
 
165 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.512206  normal  0.250482 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2808  hypothetical protein  51.52 
 
 
183 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1091  hypothetical protein  51.5 
 
 
196 aa  161  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2989  hypothetical protein  49.7 
 
 
167 aa  160  7e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.394828  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2420  hypothetical protein  48.52 
 
 
169 aa  160  9e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.384209  normal  0.715571 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1821  hypothetical protein  47.59 
 
 
169 aa  157  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311509  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3710  hypothetical protein  47.65 
 
 
169 aa  157  9e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.617797  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4185  hypothetical protein  48.8 
 
 
165 aa  154  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436089  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1532  hypothetical protein  47.06 
 
 
169 aa  155  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189027  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5006  hypothetical protein  45.51 
 
 
168 aa  154  7e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2000  hypothetical protein  45.18 
 
 
173 aa  153  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000379085 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1369  hypothetical protein  50.6 
 
 
167 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4974  hypothetical protein  45.88 
 
 
169 aa  149  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3410  hypothetical protein  45.45 
 
 
169 aa  144  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1896  hypothetical protein  46.71 
 
 
170 aa  142  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1303  hypothetical protein  42.01 
 
 
169 aa  137  7.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.652966  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0614  hypothetical protein  42.44 
 
 
170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2185  hypothetical protein  42.42 
 
 
179 aa  129  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.27954 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0238  hypothetical protein  44.91 
 
 
170 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0235  hypothetical protein  44.31 
 
 
170 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0235  hypothetical protein  44.31 
 
 
170 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0345  hypothetical protein  44.31 
 
 
170 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0241  hypothetical protein  44.31 
 
 
170 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000109722 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0239  hypothetical protein  45.51 
 
 
170 aa  124  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000143934 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0562  hypothetical protein  42.51 
 
 
173 aa  122  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0238  hypothetical protein  44.91 
 
 
170 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4492  hypothetical protein  44.31 
 
 
170 aa  121  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3783  hypothetical protein  44.31 
 
 
170 aa  121  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06423  conserved hypothetical protein  38.27 
 
 
173 aa  117  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0269408  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5253  hypothetical protein  36.97 
 
 
186 aa  117  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415649  normal  0.0494269 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3056  hypothetical protein  37.06 
 
 
173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.020297  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1986  hypothetical protein  37.8 
 
 
178 aa  107  6e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000813375  normal  0.0326161 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3797  hypothetical protein  34.73 
 
 
174 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288116  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2420  hypothetical protein  36.47 
 
 
191 aa  90.1  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0537843  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1182  hypothetical protein  36.09 
 
 
228 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1662  hypothetical protein  36.09 
 
 
228 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1579  hypothetical protein  36.69 
 
 
403 aa  89.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360622  normal  0.0697544 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1561  hypothetical protein  35.5 
 
 
190 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1636  hypothetical protein  35.5 
 
 
190 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.722246  normal  0.0779232 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2084  hypothetical protein  34.1 
 
 
267 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111552  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1938  hypothetical protein  34.3 
 
 
191 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.411142  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4810  hypothetical protein  34.91 
 
 
211 aa  86.7  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1580  hypothetical protein  34.32 
 
 
190 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.967848  normal  0.206881 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1924  hypothetical protein  34.3 
 
 
191 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168146  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0290  hypothetical protein  34.1 
 
 
255 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0025701  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0871  hypothetical protein  34.1 
 
 
255 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0668164  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1184  hypothetical protein  34.1 
 
 
255 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11176  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1627  hypothetical protein  33.72 
 
 
191 aa  84.7  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.474473  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1217  hypothetical protein  31.52 
 
 
174 aa  83.2  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304346  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2170  hypothetical protein  31.58 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0579  hypothetical protein  32.47 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0345367 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2884  hypothetical protein  30 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3867  hypothetical protein  31.01 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3817  hypothetical protein  31.01 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2060  hypothetical protein  49.46 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3021  hypothetical protein  28.15 
 
 
175 aa  62.8  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4217  hypothetical protein  30.51 
 
 
189 aa  60.5  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221932  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0681  hypothetical protein  30.15 
 
 
152 aa  44.7  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>