40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2050 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2337  Cyanophycinase and related exopeptidase-like protein  95.01 
 
 
598 aa  1043    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.704877  normal  0.140679 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2050  cyanophycinase-related exopeptidase-like protein  100 
 
 
541 aa  1122    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.338236  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2002  cyanophycinase-related exopeptidase-like protein  95.19 
 
 
541 aa  1046    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.083735  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1987  cyanophycinase-related exopeptidase-like protein  95.75 
 
 
541 aa  1055    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2394  cyanophycinase-related exopeptidase-like protein  39.87 
 
 
559 aa  294  3e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.746369 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1099  cyanophycinase  35.44 
 
 
418 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.517521  normal  0.0298062 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0337  cyanophycinase. Serine peptidase. MEROPS family S51  27.97 
 
 
288 aa  79.3  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.504841 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1177  cyanophycinase  28.63 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1813  cyanophycinase  26.67 
 
 
287 aa  69.3  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2760  cyanophycinase  33.54 
 
 
280 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0874  cyanophycinase  26 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0986  cyanophycinase  26.78 
 
 
287 aa  67.8  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00665374 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0959  cyanophycinase  26.78 
 
 
287 aa  67.8  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2399  cyanophycinase  25.26 
 
 
273 aa  67.4  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4853  cyanophycinase  26.94 
 
 
297 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4955  cyanophycinase  24.05 
 
 
284 aa  63.9  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1651  cyanophycinase  24.35 
 
 
289 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137691  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2478  cyanophycinase  28.31 
 
 
278 aa  59.7  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1870  cyanophycinase  31.19 
 
 
274 aa  58.5  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.989428  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0131  cyanophycinase  25.84 
 
 
274 aa  58.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1964  cyanophycinase  25.52 
 
 
291 aa  57.8  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0630267 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13540  cyanophycinase  33.55 
 
 
328 aa  57.4  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.500388  normal  0.709698 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0172  cyanophycinase  24.9 
 
 
278 aa  57  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0803268  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2188  cyanophycinase  28.77 
 
 
275 aa  57  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0054  cyanophycinase  27.23 
 
 
269 aa  56.2  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0084  cyanophycinase  25.83 
 
 
273 aa  55.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2205  cyanophycinase  26.5 
 
 
269 aa  55.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0514  cyanophycinase  30.72 
 
 
291 aa  54.3  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.226202  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0740  peptidase S51 dipeptidase E  30.48 
 
 
339 aa  53.5  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141411  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1113  cyanophycinase  25.21 
 
 
284 aa  52.8  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.481233  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2775  cyanophycinase  30.72 
 
 
611 aa  52.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1121  peptidase S51 dipeptidase E  31.9 
 
 
340 aa  52.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.575257  hitchhiker  0.00178513 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5801  cyanophycinase  29.59 
 
 
281 aa  52  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.260535  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4859  cyanophycinase  47.83 
 
 
327 aa  51.6  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.600302 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2283  cyanophycinase and related exopeptidase-like  27.49 
 
 
331 aa  49.3  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1095  cyanophycinase-like protein  28.82 
 
 
587 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.092083  normal  0.0870185 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4153  cyanophycinase  27.06 
 
 
289 aa  47.4  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0592  peptidase S51, dipeptidase E  28.66 
 
 
346 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2878  cyanophycinase-related exopeptidase  28.5 
 
 
458 aa  45.8  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0616  cyanophycinase  24.4 
 
 
293 aa  45.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0275965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>