51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0010 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0010  hypothetical protein  100 
 
 
103 aa  211  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2333  hypothetical protein  38.61 
 
 
111 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0383076  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3374  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.76 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3458  hypothetical protein  37.76 
 
 
109 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30877  predicted protein  32.94 
 
 
116 aa  65.1  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.216922  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1746  hypothetical protein  37.21 
 
 
111 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3598  jemb  38.37 
 
 
111 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1604  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35 
 
 
111 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.449956  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0281  hypothetical protein  43.04 
 
 
111 aa  62.8  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3311  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.02 
 
 
119 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197263  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4312  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.67 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1855  jemb  36.05 
 
 
111 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2971  hypothetical protein  40 
 
 
356 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35240  hypothetical protein  40 
 
 
356 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.788403 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1802  hypothetical protein  36.05 
 
 
111 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2498  hypothetical protein  35.71 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1779  hypothetical protein  36.05 
 
 
111 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1605  hypothetical protein  36.05 
 
 
111 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1566  hypothetical protein  36.05 
 
 
111 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.049004  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3117  hypothetical protein  42.47 
 
 
74 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1728  hypothetical protein  36.05 
 
 
111 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1679  hypothetical protein  33.33 
 
 
120 aa  53.9  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000558133  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1557  hypothetical protein  36.05 
 
 
111 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0592  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1365  hypothetical protein  44.16 
 
 
108 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4448  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.7 
 
 
106 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02020  hypothetical protein  31.31 
 
 
98 aa  51.2  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8109  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.3 
 
 
110 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3370  hypothetical protein  34.88 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.101654  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1974  hypothetical protein  34.88 
 
 
105 aa  48.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1128  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.71 
 
 
105 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.09622  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2536  hypothetical protein  33.72 
 
 
105 aa  47  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00800306  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1988  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.84 
 
 
116 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0736398  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0735  hypothetical protein  36.36 
 
 
108 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.502281  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2462  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.72 
 
 
118 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.230174 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1530  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.48 
 
 
115 aa  43.9  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297813  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3555  hypothetical protein  36.36 
 
 
122 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1569  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.76 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.546229  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3574  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.99 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.979061  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1646  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.56 
 
 
105 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000547273  hitchhiker  0.0000000000361664 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3785  hypothetical protein  31.68 
 
 
97 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000153969  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2857  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.21 
 
 
134 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.667667  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0387  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.72 
 
 
129 aa  41.6  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0282  hypothetical protein  31.87 
 
 
127 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1664  hypothetical protein  36.78 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0176885  normal  0.0334132 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2346  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.21 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0890791  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1651  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.84 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00430685  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1911  hypothetical protein  34.33 
 
 
120 aa  40.8  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0627023  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1839  hypothetical protein  34.33 
 
 
120 aa  40.8  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.483565  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0132  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.16 
 
 
128 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0140  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.16 
 
 
128 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.915911  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>