27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0943 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0943  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  527  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0992  hypothetical protein  75.1 
 
 		 260 aa  380  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.489151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3176  hypothetical protein  64.2 
 
 		 260 aa  353  1e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.441176  hitchhiker  0.000145856 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2950  hypothetical protein  59.29 
 
 		 271 aa  302  4.0000000000000003e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2130  hypothetical protein  45.28 
 
 		 260 aa  209  5e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.133112 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0221  hypothetical protein  26.12 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0032159  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1275  hypothetical protein  25.12 
 
 		 266 aa  88.2  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.298884  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3211  putative integral membrane protein  25.1 
 
 		 249 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal  0.0103033 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1773  hypothetical protein  26.83 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.938201 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2097  hypothetical protein  26.23 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.206136 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0538  hypothetical protein  24.88 
 
 		 265 aa  68.6  0.00000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.86943  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4120  hypothetical protein  24.91 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5922  hypothetical protein  22.11 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235163  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0714  hypothetical protein  25.1 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.570099  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3512  hypothetical protein  28.02 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1148  hypothetical protein  24.32 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3807  hypothetical protein  27.38 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.18849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1030  hypothetical protein  22.34 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.275581  normal  0.132673 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0192  hypothetical protein  20.51 
 
 		 267 aa  52.8  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.698451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1668  hypothetical protein  24.38 
 
 		 252 aa  52.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575966  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0576  hypothetical protein  20.97 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2455  hypothetical protein  25.81 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.928532  normal  0.405844 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3554  hypothetical protein  22.98 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1837  hypothetical protein  21.2 
 
 		 263 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2992  putative transmembrane protein  23.36 
 
 		 236 aa  43.5  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9307  hypothetical protein  24.1 
 
 		 262 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0619  hypothetical protein  25.44 
 
 		 266 aa  42  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0794565 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>