More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1876 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0753  alkaline serine protease  62.48 
 
 
609 aa  725    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3290  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  60.69 
 
 
608 aa  719    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000004601 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0917  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  59.93 
 
 
608 aa  722    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0197096  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2300  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  67.27 
 
 
606 aa  833    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3290  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  63.3 
 
 
606 aa  759    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000745292  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2570  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  65.59 
 
 
521 aa  680    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2637  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  65.78 
 
 
521 aa  682    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000344019  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3638  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  63.46 
 
 
608 aa  776    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2745  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  65.78 
 
 
521 aa  682    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000278512  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1876  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  100 
 
 
607 aa  1238    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.747842  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3431  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  60.95 
 
 
607 aa  733    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2208  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  58.11 
 
 
605 aa  689    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00762588  normal  0.156391 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2720  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  61.54 
 
 
613 aa  731    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000639683  hitchhiker  0.000730662 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3313  cold-active alkaline serine protease  42.42 
 
 
514 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2871  cold-active alkaline serine protease  45.02 
 
 
789 aa  357  2.9999999999999997e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2413  cold-active alkaline serine protease  40.73 
 
 
526 aa  340  4e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.733883 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2185  cold-active serine alkaline protease  37.65 
 
 
803 aa  259  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000390899  decreased coverage  0.00433013 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.83 
 
 
807 aa  259  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000415164  unclonable  0.00000378434 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3106  cold-active serine alkaline protease  35.26 
 
 
807 aa  257  3e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0751  cold-active alkaline serine protease  35.45 
 
 
789 aa  257  4e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3162  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.74 
 
 
543 aa  256  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.177636  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.26 
 
 
809 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000125277  hitchhiker  0.0000000821824 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1390  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.87 
 
 
805 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000278441  hitchhiker  0.0000000134181 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1409  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.87 
 
 
803 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000345823  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1455  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.87 
 
 
805 aa  239  9e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00029067  hitchhiker  0.000623133 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2477  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.65 
 
 
823 aa  239  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000447493  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2799  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.59 
 
 
819 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000118341  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1578  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.59 
 
 
819 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000462777  hitchhiker  0.00000000445269 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2874  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.59 
 
 
819 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000394785  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2779  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.59 
 
 
819 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000279348  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2692  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.89 
 
 
818 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3041  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.13 
 
 
807 aa  231  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.022997  normal  0.0310863 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000775  regulatory P domain of the subtilisin-like proprotein convertase  36.45 
 
 
677 aa  231  4e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1611  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.91 
 
 
802 aa  230  5e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0326681 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04872  cold-active alkaline serine protease  33.92 
 
 
794 aa  223  8e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03458  cold-active serine alkaline protease  41.55 
 
 
533 aa  205  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0416206  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46872  predicted protein  30.25 
 
 
670 aa  182  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916479  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4109  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.95 
 
 
520 aa  169  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.941558 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.67 
 
 
699 aa  167  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2027  aerolysin  34.8 
 
 
399 aa  131  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48262  predicted protein  30.77 
 
 
559 aa  119  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1249  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  33.58 
 
 
431 aa  117  7.999999999999999e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.613624  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2735  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.23 
 
 
669 aa  108  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.637714 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2143  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.96 
 
 
370 aa  107  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1050  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.76 
 
 
413 aa  107  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.141106  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4623  subtilisin-like serine protease  25.62 
 
 
1406 aa  103  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5001  hypothetical protein  25.42 
 
 
1407 aa  101  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0931  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.86 
 
 
500 aa  101  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143808  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5031  subtilase domain-containing protein  24.38 
 
 
1407 aa  100  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5739  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  32.19 
 
 
298 aa  100  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.750481  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5011  minor extracellular protease VPR  24.38 
 
 
1407 aa  100  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3593  subtilisin Carlsberg  31.76 
 
 
298 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2345  alkaline serine protease, subtilase family  29.07 
 
 
397 aa  99  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1805  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.32 
 
 
396 aa  99  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0411901  normal  0.0459712 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2480  alkaline serine protease, subtilase family  28.68 
 
 
397 aa  99  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2410  alkaline serine protease  29.07 
 
 
397 aa  98.6  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1874  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  37.14 
 
 
474 aa  98.6  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2222  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.8 
 
 
891 aa  98.6  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0089  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.65 
 
 
368 aa  98.2  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2216  alkaline serine protease  28.41 
 
 
397 aa  97.4  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00115327  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2980  alkaline serine protease, subtilase family  28.29 
 
 
397 aa  97.4  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.503855 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2155  alkaline serine protease  28.41 
 
 
397 aa  97.4  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.130046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2139  alkaline serine protease  28.41 
 
 
397 aa  97.4  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2380  alkaline serine protease  28.41 
 
 
397 aa  97.4  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2398  alkaline serine protease, subtilase family  28.41 
 
 
397 aa  97.4  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2056  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.16 
 
 
392 aa  95.9  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.317337  normal  0.564481 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.86 
 
 
540 aa  95.9  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.81 
 
 
423 aa  95.9  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.223191  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4678  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.14 
 
 
407 aa  95.1  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264127  normal  0.283017 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2220  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.02 
 
 
397 aa  95.1  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000312805  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2354  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.09 
 
 
453 aa  95.1  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.92 
 
 
1029 aa  95.1  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0552  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.92 
 
 
490 aa  94.7  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0755  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.51 
 
 
679 aa  94.7  5e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.312676  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1928  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.43 
 
 
452 aa  94.4  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0040  minor extracellular protease epr  33.82 
 
 
297 aa  94  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0844257 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0058  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.8 
 
 
449 aa  93.2  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3542  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.93 
 
 
638 aa  93.2  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0100576  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2075  subtilisin  31.4 
 
 
485 aa  92.8  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.734666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0861  intracellular serine protease  32.42 
 
 
307 aa  92  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000163196  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0468  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28.25 
 
 
860 aa  91.7  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1388  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.54 
 
 
444 aa  92  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.196735  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3977  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  40.45 
 
 
377 aa  91.7  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.745092 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0119  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.85 
 
 
587 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.165742 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4060  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.55 
 
 
627 aa  91.3  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0156752  normal  0.194218 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2600  subtilisin-like serine protease-like  37.5 
 
 
1315 aa  91.3  5e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0639979  normal  0.124831 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4085  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  31.27 
 
 
615 aa  90.9  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0298  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.26 
 
 
320 aa  90.9  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0265  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.26 
 
 
320 aa  90.9  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2196  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.32 
 
 
423 aa  90.9  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0357  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.99 
 
 
577 aa  90.9  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1096  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.18 
 
 
589 aa  90.5  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.18 
 
 
589 aa  90.5  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.798248  normal  0.349528 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3522  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.45 
 
 
615 aa  90.5  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0365  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.29 
 
 
487 aa  89.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0291  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.26 
 
 
320 aa  89.7  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0084  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28.21 
 
 
860 aa  89  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000306364  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2844  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.71 
 
 
639 aa  88.6  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0124345  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4226  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.69 
 
 
1454 aa  88.2  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.542738  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.58 
 
 
1776 aa  87.8  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>