More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3205 on replicon NC_008036
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008036  Sala_3205  nitrogen-fixing NifU-like  100 
 
 		 311 aa  628  1e-179  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0469  putative nitrogen-fixing NifU, Rieske (2Fe-2S) region  52.36 
 
 		 289 aa  287  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483541  normal  0.014762 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3755  Rieske (2Fe-2S) domain protein  53.14 
 
 		 290 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0858  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.85 
 
 		 301 aa  228  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0710  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  44.44 
 
 		 296 aa  225  6e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1813  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.59 
 
 		 309 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1251  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.07 
 
 		 289 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1282  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.07 
 
 		 289 aa  199  7e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0910712 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3870  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  32.37 
 
 		 270 aa  191  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  33.33 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0476  nitrogen-fixing NifU domain protein  33.07 
 
 		 286 aa  145  9e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.140105  normal  0.34365 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3228  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  32.48 
 
 		 289 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2369  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.3 
 
 		 285 aa  122  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010436 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3360  nitrogen-fixing NifU-like  39.76 
 
 		 173 aa  109  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.595792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4600  nitrogen-fixing NifU-like  41.14 
 
 		 158 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.357598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2142  nitrogen-fixing NifU-like protein  32.2 
 
 		 294 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2188  NifU domain-containing protein  32.2 
 
 		 294 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.226918 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2129  NifU domain-containing protein  31.64 
 
 		 294 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0750308  normal  0.014165 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  50 
 
 		 74 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1653  NifU protein, putative  54.17 
 
 		 84 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.421868  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2015  NifU domain-containing protein  52.78 
 
 		 86 aa  73.2  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213209  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0398  NifU protein, putative  51.39 
 
 		 89 aa  72  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.939749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0419  nitrogen-fixing NifU domain protein  50 
 
 		 86 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0336152  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2358  nitrogen-fixing NifU domain protein  51.39 
 
 		 86 aa  71.2  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0997  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.61 
 
 		 77 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997138 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  48.53 
 
 		 73 aa  70.9  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2542  nitrogen-fixing NifU domain protein  29.14 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.364829 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1421  NifU domain-containing protein  47.06 
 
 		 72 aa  70.5  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238769  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.83 
 
 		 73 aa  69.7  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.71 
 
 		 99 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0073046  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2018  nitrogen-fixing NifU domain protein  50.7 
 
 		 86 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.700022  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1525  HesB/YadR/YfhF-family protein  50 
 
 		 195 aa  68.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  45.71 
 
 		 74 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.22 
 
 		 87 aa  67.4  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2796  nitrogen-fixing NifU domain protein  50 
 
 		 73 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000131696  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.38 
 
 		 72 aa  67  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.43 
 
 		 74 aa  67  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1815  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.48 
 
 		 86 aa  66.6  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0183632  normal  0.633859 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0333  NifU domain-containing protein  48.57 
 
 		 74 aa  66.6  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000601792  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1414  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.06 
 
 		 73 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68572e-21 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15130  thioredoxin-like protein  44.93 
 
 		 76 aa  66.2  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.206063 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.73 
 
 		 73 aa  65.9  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0939  NifU domain-containing protein  42.86 
 
 		 73 aa  65.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.388562  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16946  predicted protein  39.44 
 
 		 213 aa  65.5  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0480  NifU-like domain-containing protein  44.29 
 
 		 74 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1109  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.25 
 
 		 88 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.442386 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0925  hypothetical protein  47.14 
 
 		 86 aa  65.1  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0198354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  40.79 
 
 		 80 aa  64.3  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  40.26 
 
 		 103 aa  63.9  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20981  NifU-like protein  40.58 
 
 		 81 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04691  NifU-like protein  40.58 
 
 		 81 aa  63.5  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1018  Rieske (2Fe-2S) region  35.16 
 
 		 98 aa  63.5  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131503 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0414  NifU-like protein  40.58 
 
 		 81 aa  63.5  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.03 
 
 		 81 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04381  NifU-like protein  40.58 
 
 		 81 aa  63.5  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.725479  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0450  putative NifU-like protein  42.03 
 
 		 81 aa  63.2  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2861  nitrogen-fixing NifU-like protein  41.89 
 
 		 80 aa  62.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3441  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  40 
 
 		 79 aa  63.2  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04791  NifU-like protein  40.58 
 
 		 81 aa  63.2  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04161  NifU-like protein  39.13 
 
 		 81 aa  63.2  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.43569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3034  nitrogen-fixing NifU-like  40.58 
 
 		 76 aa  62.8  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2413  NifU domain-containing protein  27.72 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0708227  normal  0.256977 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5056  nifU domain protein  41.43 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5086  NifU domain-containing protein  41.43 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4821  NifU domain-containing protein  41.43 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4659  NifU domain-containing protein  41.43 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4678  NifU domain-containing protein  41.43 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4771  NifU domain-containing protein  41.43 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0148  nifU domain protein  41.43 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5094  nifU domain protein  41.43 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5186  NifU domain-containing protein  41.43 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5092  nifU domain protein  41.43 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0796  NifU-like protein  39.73 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.077695  normal  0.023151 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3554  NifU domain-containing protein  42.03 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0845  Rieske 2Fe-2S family protein  35.16 
 
 		 103 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1585  NifU-like protein  38.36 
 
 		 81 aa  62.4  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.716402  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.58 
 
 		 79 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2034  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.58 
 
 		 76 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.58 
 
 		 79 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3815  hypothetical protein  40.43 
 
 		 186 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.473897  normal  0.0339082 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4936  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.47 
 
 		 85 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.336138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1752  NifU-like protein  39.13 
 
 		 81 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.354649  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3194  Rieske (2Fe-2S) region  30.43 
 
 		 100 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.5117e-17  hitchhiker  4.2038099999999998e-22 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04711  NifU-like protein  39.13 
 
 		 81 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.265709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4000  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.67 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1502  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 		 105 aa  61.6  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.165892 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0723  NifU domain-containing protein  39.13 
 
 		 76 aa  60.8  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603746 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3614  nitrogen-fixing NifU domain protein  40 
 
 		 73 aa  60.1  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187737  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0399  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.12 
 
 		 79 aa  60.1  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1987  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.55 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0303  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.61 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000392242  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00755  NifU protein, putative  40 
 
 		 80 aa  58.5  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0945933  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0085  NifU domain-containing protein  40.58 
 
 		 72 aa  58.5  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000210342  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1911  hypothetical protein  37.66 
 
 		 227 aa  58.5  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000392795  hitchhiker  0.00108913 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3926  putative DNA uptake protein  39.19 
 
 		 191 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4634  putative DNA uptake protein  37.33 
 
 		 191 aa  58.9  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2202  HesB/YadR/YfhF  38.96 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.20209  decreased coverage  0.00866489 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0220  putative DNA uptake protein  46.75 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.722098  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3695  putative DNA uptake protein  37.84 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3819  putative DNA uptake protein  37.84 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>