More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0244 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0244  30S ribosomal protein S9  100 
 
 		 165 aa  330  4e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4594  30S ribosomal protein S9  87.94 
 
 		 188 aa  255  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3285  30S ribosomal protein S9  73.1 
 
 		 180 aa  240  7.999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2938  ribosomal protein S9  66.67 
 
 		 162 aa  213  7e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000844995 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4591  30S ribosomal protein S9  68.94 
 
 		 160 aa  212  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4345  30S ribosomal protein S9  65.22 
 
 		 160 aa  212  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1681  30S ribosomal protein S9  66.67 
 
 		 155 aa  211  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00362695  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2708  30S ribosomal protein S9  67.7 
 
 		 158 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.421371  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2425  30S ribosomal protein S9  64.81 
 
 		 164 aa  211  4.9999999999999996e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2697  30S ribosomal protein S9  66.87 
 
 		 161 aa  210  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.145825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2175  30S ribosomal protein S9  62.65 
 
 		 160 aa  208  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0915323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0902  30S ribosomal protein S9  61.82 
 
 		 161 aa  209  2e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.829966  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0021  30S ribosomal protein S9  62.65 
 
 		 160 aa  209  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849835  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1601  30S ribosomal protein S9  63.86 
 
 		 164 aa  209  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.292372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1650  30S ribosomal protein S9  62.65 
 
 		 160 aa  209  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.377487 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3107  30S ribosomal protein S9  67.08 
 
 		 160 aa  208  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.966484  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1872  30S ribosomal protein S9  63.98 
 
 		 159 aa  208  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.952658 
 
 
-
 
NC_004310  BR0790  30S ribosomal protein S9  63.35 
 
 		 158 aa  207  4e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.552498  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0786  30S ribosomal protein S9  63.35 
 
 		 158 aa  207  4e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.637937  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1513  SSU ribosomal protein S9P  62.65 
 
 		 165 aa  207  5e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.472306 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2496  30S ribosomal protein S9  63.03 
 
 		 158 aa  207  6e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0149  30S ribosomal protein S9  61.88 
 
 		 162 aa  207  7e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1476  30S ribosomal protein S9  66.25 
 
 		 166 aa  206  9e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.270542 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  63.25 
 
 		 158 aa  206  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2672  30S ribosomal protein S9  66.46 
 
 		 158 aa  206  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569835  normal  0.132209 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2454  30S ribosomal protein S9  64.85 
 
 		 158 aa  206  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  62.11 
 
 		 159 aa  206  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  60.62 
 
 		 162 aa  204  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1422  30S ribosomal protein S9  71.43 
 
 		 158 aa  204  4e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.51395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3025  30S ribosomal protein S9  68.31 
 
 		 157 aa  204  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2249  30S ribosomal protein S9  63.64 
 
 		 163 aa  204  6e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2650  30S ribosomal protein S9  61.25 
 
 		 161 aa  201  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1179  30S ribosomal protein S9  60.62 
 
 		 161 aa  201  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.554063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  60.62 
 
 		 161 aa  200  7e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  60.62 
 
 		 161 aa  200  7e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1321  30S ribosomal protein S9  61.21 
 
 		 155 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1234  30S ribosomal protein S9  61.82 
 
 		 155 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0861  30S ribosomal protein S9  61.82 
 
 		 155 aa  196  9e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0415089  normal  0.103809 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1163  30S ribosomal protein S9  59.75 
 
 		 160 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.456788  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1384  30S ribosomal protein S9  60.61 
 
 		 161 aa  194  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2970  30S ribosomal protein S9  62.58 
 
 		 159 aa  194  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0570988  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  65.62 
 
 		 130 aa  168  4e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0821  30S ribosomal protein S9  60.31 
 
 		 149 aa  160  6e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.766995  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1018  30S ribosomal protein S9  60.31 
 
 		 152 aa  160  1e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0913  ribosomal protein S9  60.48 
 
 		 129 aa  159  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000269489  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3348  ribosomal protein S9  60.48 
 
 		 129 aa  159  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0614997 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1050  30S ribosomal protein S9  61.29 
 
 		 130 aa  159  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000126027  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  59.35 
 
 		 130 aa  158  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0607  30S ribosomal protein S9  59.68 
 
 		 130 aa  157  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000206629  hitchhiker  0.00149279 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1899  30S ribosomal protein S9  60.32 
 
 		 130 aa  156  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.1303899999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2875  30S ribosomal protein S9  58.87 
 
 		 130 aa  154  6e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0195834  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0066  30S ribosomal protein S9  57.58 
 
 		 151 aa  153  1e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3085  30S ribosomal protein S9  59.68 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000996861  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3190  30S ribosomal protein S9  58.87 
 
 		 130 aa  152  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000452354  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  63.11 
 
 		 130 aa  152  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0525  30S ribosomal protein S9  57.03 
 
 		 130 aa  150  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000883336  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0461  30S ribosomal protein S9  57.03 
 
 		 130 aa  150  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000140237  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1133  30S ribosomal protein S9  57.03 
 
 		 130 aa  150  5e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000113025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4348  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000012665  hitchhiker  0.00291766 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0300  30S ribosomal protein S9  57.26 
 
 		 130 aa  148  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00212654  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2663  30S ribosomal protein S9  55.47 
 
 		 130 aa  148  4e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00134428  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0839  ribosomal protein S9  55.15 
 
 		 145 aa  147  7e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3436  30S ribosomal protein S9  56.1 
 
 		 131 aa  147  8e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  58.87 
 
 		 130 aa  147  9e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  61.48 
 
 		 130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  61.48 
 
 		 130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3704  30S ribosomal protein S9  55.47 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00817033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  56.56 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  56.56 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3607  30S ribosomal protein S9  55.47 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000867127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  56.56 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3642  30S ribosomal protein S9  55.47 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000331692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3535  30S ribosomal protein S9  55.47 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000799314  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004510  SSU ribosomal protein S9p (S16e)  54.69 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000229051  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3536  30S ribosomal protein S9  55.47 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000037617  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4425  ribosomal protein S9  55.65 
 
 		 130 aa  145  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4119  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 		 130 aa  145  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0128  30S ribosomal protein S9  59.38 
 
 		 130 aa  145  3e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000606121  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  58.87 
 
 		 130 aa  144  5e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00882  30S ribosomal protein S9  53.91 
 
 		 130 aa  144  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  57.81 
 
 		 130 aa  144  6e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3665  30S ribosomal protein S9  54.69 
 
 		 130 aa  144  6e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0023412  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0293  ribosomal protein S9  54.69 
 
 		 130 aa  144  6e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000515876  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03090  30S ribosomal protein S9  54.69 
 
 		 130 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000557445  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0476  ribosomal protein S9  54.69 
 
 		 130 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000601039  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0476  30S ribosomal protein S9  54.69 
 
 		 130 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000111446  normal  0.163216 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1233  30S ribosomal protein S9  57.26 
 
 		 130 aa  144  8.000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000147442  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3546  30S ribosomal protein S9  54.69 
 
 		 130 aa  144  8.000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104404  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03041  hypothetical protein  54.69 
 
 		 130 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000287646  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3525  30S ribosomal protein S9  54.69 
 
 		 130 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000016286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3713  30S ribosomal protein S9  54.69 
 
 		 130 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000596943  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4547  30S ribosomal protein S9  54.69 
 
 		 130 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000371086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3419  30S ribosomal protein S9  54.69 
 
 		 130 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1316  30S ribosomal protein S9  54.84 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.428523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4408  30S ribosomal protein S9  54.84 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  59.35 
 
 		 133 aa  143  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0902  30S ribosomal protein S9  54.03 
 
 		 130 aa  143  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3796  ribosomal protein S9  53.91 
 
 		 130 aa  143  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000182281  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3638  ribosomal protein S9  53.12 
 
 		 130 aa  143  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00994207  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4533  30S ribosomal protein S9  54.84 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848049  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>